塔河废弃古河道胡杨内生可培养细菌多样性与群落结构时空演变格局的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31060002
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0101.微生物多样性、分类与系统发育
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

本项目组前期预研数据表明:废弃古河道林地胡杨内生可培养真细菌菌种资源的多样性极丰富。 "土著"新种的发现频率超出了预期,极具进一步挖掘的潜力。从塔河中游主河道胡杨林区、塔河废弃古河道之一的UGAN河(已断流122年)与KIRIK河(已断流340年)林地各选择2棵胡杨,共采取6棵胡杨的树干内存液样本,用现代细菌资源学研究方法,筛选分离胡杨内生可培养真细菌菌种,进行分类鉴定,发掘出一批当地"土著"新菌种和罕见菌种,刷新国内外菌种分布记录。搞清3条处于时空隔离状态河道上胡杨内生可培养细菌的多样性、分布格局和种群结构的变迁状况;分别构建菌种分子系统发育树,探索人类社会活动的加剧和生态体系破碎化对弱势"土著"细菌种群生存繁衍造成危害的时空演变进程,为有效遏制细菌资源急剧减少的趋势提供基本数据。系统的阐明塔河胡杨林地胡杨内生细菌的物种多样性和群落分布特点,构建细菌菌种资源保护与可持续利用信息共享平台。

结项摘要

从三条河道的6个采样位点,分别与5月上旬与9月下旬采样;每一个样点采取4棵胡杨树的树干内存液,共24份液样。用4种培养基共分离纯化了588株胡杨内生真细菌;其中Ugan古河道270株,Kiyik古河道151株,塔河主河道167株。基于它们的16S rDNA 序列分析表明,588株细菌分别属于6个大类群:其中变形菌门γ亚群的细菌占总分离菌的50.17%,厚壁菌门占34.58%,放线菌门占10.17%,变形菌门α亚群占4.24%,拟杆菌门占0.5%,变形菌门β亚群占0.34%;共47个属,114种;其中包括41个胡杨林本源的潜在新菌种(16S rDNA相似率均<98.0%)。γ-变形菌纲和厚壁菌门的细菌是胡杨茎秆液中的优势类群,假单胞菌属(29.76%)和芽孢杆菌属(19.05%)为优势属。其中与Pseudomonas xinjiangensis这个菌种相聚类的潜在新菌种(74株,12.585%)是胡杨内生菌的本源优势菌种。辛普森多样性指数表明Kiyik河胡杨可培养内生菌的多样性指数为0.931,塔河多样性指数为0.935;Ugan河多样性最高,为0.969;3条河道的胡杨内生菌多样性都较高,多样性指数较接近。香农—威纳均匀度指数表明,Ugan河的可培养胡杨内生细菌的分布最均匀,均匀度指数为0.8570;塔河次之,为0.8314;Kiyik河最低,为0.7937。胡杨内生菌群落结构的时空变化对比分析表明,Kiyik河的细菌群落结构保持原始状态最好,菌种数与本源潜在新菌种的检出率最高(1/3.082, 1/7.550),很少受外来常见优势菌群的清洗与取代。Ugan古河道次之,菌种数与本源潜在新菌种的检出率有些降低(1/3.333,1/12.857),胡杨内生菌群落结构发生了一定程度的变迁。塔河主河道细菌群落结构发生了较大程度的改变,菌种数与本源潜在新菌种的检出率都显著下降(1/4.282,1/20.875),被人类活动带来的外来常见优势菌群生态冲刷的趋势明显。这些数据都充分展示出了胡杨内生细菌的群落结构与人类的活动分布区现状,3条河道的地理位置,以及远在荒漠区的Kiyik与Ugan古河道的废弃年代具有很强的相关性。

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(2)
会议论文数量(3)
专利数量(0)
中国新纪录种灰白翅孢壳Emericellopsis pallida.
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    新疆大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    苏俊;马相汝;木合塔尔•阿布都克里木;索菲娅;艾尔肯•热合曼
  • 通讯作者:
    艾尔肯•热合曼
Ugan古河道胡杨可培养内生细菌的多样性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    微生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Erkin Rahman;谢仁娜依·甫拉提;玛丽帕·吐达洪1;马丽艳木·阿木东;艾尼江·尔斯曼;祖母拉提·阿布都热依木;艾尔肯·热合曼;Khayir Yusuf;Shirenay Pulat
  • 通讯作者:
    Shirenay Pulat
沙雅县胡杨林土壤可培养细菌的多样性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    新疆农业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    马丽艳木·阿木东;谢仁娜依·甫拉提;卡依尔·玉素甫;艾尼江·尔斯曼;玛丽帕·吐达洪;程刚;祖母拉提·阿布都热依木;艾尔肯·热合曼;木合塔·阿不都克里木
  • 通讯作者:
    木合塔·阿不都克里木
西昆仑山2个海拔位点可培养细菌多样性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    干旱区研究
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    玛丽帕·吐达洪;阿不都外力·阿布都热依木;孜来古丽·米吉提;卡依尔·玉素甫;马丽艳木·阿木东;艾尼江·尔斯曼;祖母拉提·阿布都热依木;艾尔肯·热合曼
  • 通讯作者:
    艾尔肯·热合曼
稷酸米汁中新耐碱酵母Trichosporon asahii var. asahii XJU-1的分离鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    生物技术
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Erkin RAHMAN;马相如;阿不都外力·阿布都热依木;索菲娅;木合塔尔·阿布都克里木;艾尔肯·热合曼;SU Jun;MA Xiang-ru;Abduwaly ABDUREHIM
  • 通讯作者:
    Abduwaly ABDUREHIM

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艾尔肯·热合曼的其他基金

塔里木河谷低水位区优势胡杨品种的筛选及其遗传标记体系的构建
  • 批准号:
    30471405
  • 批准年份:
    2004
  • 资助金额:
    21.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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