两株链霉菌中新颖安莎类抗生素的挖掘及其生物合成机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81903479
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3402.天然药物化学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

The long-term, large-scale overuse and reliance of antibiotics in clinic led to serious antibiotic resistance in numerous bacteria. The discovery of novel antibiotics is of vital importance for human health. Ansamycins is a class of type I polyketide macrolide antibiotic with high medicinal potential, including rifamycin, geldanamycin, maytansine and many other well-kown drug precursors. Therefore, ansamycins owns predominant development potential. This project intends to focus on the excavation and biosynthesis of novel ansamycin antibiotics from microorganisms. On one hand, genome mining technology will be used to activate the pentaketide ansamycin biosynthesis gene cluster in Streptomyces sp. S035, then new skeleton pentaketide ansamycins will be tracked and separated. On the other hand, research on the biosynthesis mechanism of tetrapetalones and the accumulation of intermediates from the mutants will be carried out based on gene-cluster analysis. The biosynthetic mechanism of tetrapetalones will be elucidated at the first time, which could provide insights for the yield enhancement and structure optimization. This project integrates the traditional strategies of natural product research and the emerging genome mining technology through multidisciplinary intersection, directionally mining new skeleton ansamycins and providing lead compounds for novel pharmaceutical agent development.
临床上对抗生素的长期、大量的滥用与依赖导致多种细菌产生严重的耐药,新型抗生素的发掘对人类健康尤为重要。安莎是一类药用价值很高的Ⅰ型聚酮大环内酰胺类抗生素,其中包括利福霉素、格尔登霉素、美登木素等多个著名的药物先导,具有优越的开发潜力。本项目拟开展微生物中新颖安莎类抗生素的挖掘及其生物合成研究,一方面利用基因组挖掘技术激活链霉菌S035中的五酮安莎生物合成基因簇,追踪分离新骨架五酮安莎类化合物;另一方面根据基因簇分析开展对五酮安莎tetrapetalones生物合成机制研究以及突变株中间体的积累,首次阐明五酮安莎tetrapetalones的生物合成机制,为其产量优化和结构改造提供依据。本申请项目通过多学科交叉,整合天然产物研究传统方法与新兴基因组挖掘技术,定向挖掘新骨架安莎类化合物,为新药研发提供先导化合物。

结项摘要

临床上对抗生素的长期、大量的滥用与依赖导致多种细菌产生严重的耐药,新型抗生素的发掘对人类健康尤为重要。安莎是一类药用价值很高的大环内酰胺类抗生素,其中包括利福霉素、格尔登霉素、美登木素等多个著名的药物先导,具有优越的开发潜力。本项目通过调控基因组成型表达和启动子置换的方法激活链霉菌Streptomyce sp. S010中的tpt隐性安莎基因簇,分离得到7个新颖的五酮安莎类化合物,并通过体内敲除等策略对新颖五酮安莎类化合物的生物合成进行了研究;通过过表达构建S035的突变株,激活安莎基因簇,分离纯获得16个新化合物,包含6个新颖五酮安莎化合物,并初步的测定化合物的细胞毒活性,为后续对已有安莎化合物进行结构改造和优化奠定了基础。综上,本项目在生物信息学指导下,利用基因组挖掘技术成功激活隐性基因,策略性挖掘出新骨架安莎类化合物并解析其生物合成机制,也为新型抗生素的发现提供药物先导。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Progress on Terpenoids With Biological Activities Produced by Plant Endophytic Fungi in China Between 2017 and 2019
2017-2019年我国植物内生真菌产生的具有生物活性的萜类化合物研究进展
  • DOI:
    10.1177/1934578x20937204
  • 发表时间:
    2020-07
  • 期刊:
    Natural Product Communications
  • 影响因子:
    1.8
  • 作者:
    Zhao Yu;Cui Jing;Liu Mengyujie;Zhao Lei
  • 通讯作者:
    Zhao Lei
Discovery and identification of proangiogenic chemical markers from Gastrodiae Rhizoma based on zebrafish model and metabolomics approach
基于斑马鱼模型和代谢组学方法的天麻促血管生成化学标志物的发现和鉴定
  • DOI:
    10.1002/pca.2949
  • 发表时间:
    2020-06-03
  • 期刊:
    PHYTOCHEMICAL ANALYSIS
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Liu, Mengyujie;Zhao, Liang;Zhong, Lihong
  • 通讯作者:
    Zhong, Lihong

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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