肿瘤相关新基因PRR11和FAM33A共享双向启动子区域的鉴定及Myb对其调控的分子机制与生物学意义研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81171879
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1801.肿瘤病因
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

肿瘤相关新基因的鉴定与功能解析及其知识产权猎取是后基因组时代国际竞争的一个焦点,也是我们的主研方向。PRR11是我们自主发现的数个肿瘤相关新基因之一,对其功能研究已获青年基金资助且进展良好,已证实其通过调控细胞周期、细胞增殖而参与肿瘤发生。项目执行过程中,我们又惊喜地意外发现:该基因恰和另一肿瘤相关新基因FAM33A共享一独特而典型的双向启动子,且经典癌基因Myb还能显著调控其活性。本研究拟在此基础上,以基因转录调控为切入点对在研项目进行纵向深入拓展,综合采用多种转录调控及分子肿瘤学研究技术,进一步对该双向启动子进行全面系统的鉴定,进而验证并阐明Myb对该双基因转录单元的直接转录激活效应及其在细胞周期和肿瘤发生中的作用与意义。该研究不仅对于丰富真核基因转录调控及分子肿瘤学理论具有重要科学意义,而且因该双向启动子具有能同时调控双基因高效表达的特性,故在肿瘤基因治疗等方面也极具潜在应用价值。

结项摘要

“头对头”基因对是真核生物中一种独特的基因组织方式,其转录是由一个独特的双向启动子驱动。该类基因约占人类基因总数的10%,初步研究显示其在肿瘤发生发展等过程中具有重要作用。开展该类基因的功能与调控机制研究对于丰富真核基因转录调控和分子肿瘤学基础理论以及开发肿瘤防治新策略具有重要意义。PRR11是我们前期研究自主鉴定的一个参与细胞周期和肺癌发生发展的肿瘤相关新基因。在本研究中,我们对PRR11与其相邻基因SKA2(也称FAM33A)组成的基因对及其共享的双向启动子区域进行了系统鉴定,并对其转录调控机制及其在肺癌中的临床意义进行了系统研究。基因结构分析证实PRR11与其邻侧基因SKA2以“头对头”方式排列,转录起始位点分析结果证实两基因间的距离小于500 bp,从而确认了PRR11-SKA2是一个典型的“头对头”基因对。启动子活性分析结果进一步证实,两基因确实共享一个典型的双向启动子,且两基因间一段最短的80 bp序列作为核心启动子驱动PRR11-SKA2基因对的双向基础转录。转录调控机制研究结果表明,Myb、NF-Y等转录因子等均能调控PRR11-SKA2双向启动子的转录。NF-Y能直接结合并进而激活PRR11-SKA2双向启动子,是调控PRR11-SKA2转录单元转录的主要转录因子。而Myb对PRR11-SKA2转录单元的调控则具有组织细胞特异性,且可能依赖其它转录因子的共同参与。进一步的功能研究结果表明,联合或者单独沉默PRR11与SKA2的表达可导致肺癌细胞的增殖迁移及侵袭能力显著降低,且两基因之间具有协同作用。临床样本分析结果显示,PRR11与SKA2在肺癌中均呈现显著高表达,且两者的表达呈显著正相关,并与NF-Y的表达水平也呈显著正相关,PRR11与SKA2共同高表达的肺癌病人预后明显低于单个基因高表达组或两基因同时低表达组。综上,我们的研究结果表明,PRR11-SKA2是一个典型的受双向启动子驱动转录的“头对头”基因对,受Myb、NF-Y等转录因子的调控,且PRR11-SKA2基因对在肺癌中的显著高表达对于维持肺癌细胞的高增殖活性和运动能力非常重要,是一个新的肺癌诊断和治疗的潜在靶点。

项目成果

期刊论文数量(15)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)
Identification and analysis of the promoter region of the human HAS3 gene.
人HAS3基因启动子区的鉴定和分析。
  • DOI:
    10.1016/j.bbrc.2015.03.142
  • 发表时间:
    2015-05
  • 期刊:
    Biochem Biophys Res Commun
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ji, Ying;Du, Gang;Wang, Yitao;Bu, Youquan
  • 通讯作者:
    Bu, Youquan
人PRR11核心启动子区域NF-Y结合位点的定点突变分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    中国细胞生物学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王义涛;蔡伟;朱慧芳;卜友泉
  • 通讯作者:
    卜友泉
抑制PRR11基因表达对H1299细胞周期的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    中国细胞生物学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朱慧芳;蔡 伟;朱远远;卜友泉
  • 通讯作者:
    卜友泉
RNAi干扰Ska2对H1299细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国细胞生物学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张莹;朱慧芳;李轶;卜友泉
  • 通讯作者:
    卜友泉
The gene pair PRR11 and SKA2 shares a NF-Y-regulated bidirectional promoter and contributes to lung cancer development
基因对 PRR11 和 SKA2 共享一个 NF-Y 调节的双向启动子,并有助于肺癌的发展。
  • DOI:
    10.1016/j.bbagrm.2015.07.002
  • 发表时间:
    2015-09-01
  • 期刊:
    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENE REGULATORY MECHANISMS
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Wang, Yitao;Zhang, Ying;Bu, Youquan
  • 通讯作者:
    Bu, Youquan

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    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    刘革力

其他文献

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卜友泉的其他基金

PRR11与RNF41相互作用的鉴定及其对肺癌细胞STAT3通路的调控机制与临床意义研究
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    81672301
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一个新的肿瘤相关基因- - PRR11的鉴定与功能解析
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    青年科学基金项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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