土壤中DNA的反应性、可提取性与指纹图谱特征

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    40571082
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    42.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0709.基础土壤学
  • 结题年份:
    2008
  • 批准年份:
    2005
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2006-01-01 至2008-12-31

项目摘要

研究几种主要地带性土壤与不同大小分子DNA的反应特点,探讨这些反应特点如何影响土壤中微生物DNA的可提取性(DNA分子的大小、纯度、提取率),并用提取的DNA进行分子生态学分析,以阐明这些土壤在微生物群落组成和多样性方面的异同。从土壤、特别是高铁和高有机质含量的土壤中分离足够纯和具有代表性的DNA是土壤分子生态学研究的难点之一,而提取的DNA分子大小则是限制宏基因组(Metagenome)克隆文库建立的关键之一。对DNA与土壤及其组成成分相互作用机理的认识将有助于这些问题的解决。该项目将DNA分子化学、土壤微生物学、土壤化学与分子生物学结合起来进行研究,可增进对DNA在土壤中化学行为和反应机理的认识,为土壤DNA提取方法的改进和土壤分子生态学研究的发展提供基础。土壤微生物指纹图谱特征则可为土壤评价和管理提供依据。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)
Abundance and composition of ammonia-oxidizing bacteria and ammonia-oxidizing archaea communities of an alkaline sandy loam
碱性砂壤土氨氧化细菌和氨氧化古菌群落的丰度和组成
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
Bacterial communities inside and surrounding soil iron-manganese nodules
土壤铁锰结核内部和周围的细菌群落
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
Soil enzymatic activities and microbial community structure with different application rates of Cd and Pb
不同Cd、Pb施用量下土壤酶活性及微生物群落结构
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
Long-term fertilization regimes affect bacterial community structure and diversity of an agricultural soil in northern Chin
长期施肥制度影响钦北农业土壤细菌群落结构和多样性
  • DOI:
    10.1016/j.cub.2012.06.041
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
Microbial composition and diversity of an upland red soil under long-term fertilization treatments as revealed by culture-dependent and culture-independent approaches
通过培养依赖和非培养方法揭示长期施肥处理下旱地红壤的微生物组成和多样性
  • DOI:
    10.1039/d3dd00085k
  • 发表时间:
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  • 作者:
  • 通讯作者:

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其他文献

土壤游离铝的形态
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  • 期刊:
    科学通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    贺纪正;李学垣
  • 通讯作者:
    李学垣
旱地红壤反硝化功能基因丰度对长期施肥的响应
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    林永新
土壤病毒生态学研究方法
  • DOI:
    10.5846/stxb201511122292
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    生态学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    韩丽丽;于丹婷;贺纪正
  • 通讯作者:
    贺纪正
全球变化野外控制试验及其在土壤微生物生态学研究中的应用
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    应用生态学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    沈菊培
病毒生态学研究进展
  • DOI:
    10.5846/stxb201501210170
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    生态学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    韩丽丽;贺纪正
  • 通讯作者:
    贺纪正

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几种典型土壤中病毒多样性及其分布特征
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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