内质网质量控制系统决定膜蛋白新生肽链折叠或降解的机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31670780
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The endoplasmic reticulumn (ER) quality control (ERQC) pathway constantly surveys newly synthesized membrane proteins to selectively recognize and degrade faulty proteins whose accumulaiton can lead to various diseases. The ERQC protects the biosynthetic intermediate from degradation, while specifically selects those that have failed to mature for destruction via ER associated degradation pathway. It is largely unknown how ERQC discriminates aforementioned two species of a nascent peptide and triages them between constant folding and degradation. We therefore proposed a “two-step ubiquitination” model based on the fact that sequencial E3 ligases are usually involved in degradation of high-molecular weight transmembrane proteins. We will use cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) as a model to identify transmembrane ubiquitin ligase and potential deubiquitinase involved in co-translational ubiquitination of nascent peptide of membrane proteins. The functional interplay between the ligases and deubiquitinase(s) will be thoroughly investigated in order to reveal the principle of the “molecular switch” that determines the constant folding or degradative fate of CFTR nascent chain. We believe that this research will provide insight into how two antagonizing activities finely tune critical biological event such as membrane protein biosynthesis and quality control.
内质网质量控制系统能有效的监控膜蛋白新生肽链的折叠状态,保护正常的折叠中间体,而将折叠超时或失败的肽链分选出来,利用内质网关联的降解途径将其清除。质量控制系统如何根据已折叠时间来分选正常和折叠失败的肽链、如何决定二者继续折叠或降解的不同命运是本领域内的关键问题。本项目基于已有的发现提出了控制膜蛋白新生肽链合成和降解的“两步泛素化”模型,利用12次跨膜蛋白囊性纤维化跨膜转导调节器(CFTR)为模式研究对象,鉴定调控膜蛋白新生肽链共翻译泛素化的跨膜泛素连接酶和去泛素化酶,着重研究两种酶在功能上的相互作用,最终阐明内质网质量控制系统控制CFTR新生肽链合成或降解两种命运的“分子开关”原理。本课题的研究将深刻揭示两种相互拮抗的酶活力精细调控整合膜蛋白生物合成和降解的偶联机制。

结项摘要

内质网质量控制系统监控新生膜蛋白和分泌蛋白的合成,折叠和装配。错误折叠蛋白质会通过泛素-蛋白酶体介导的内质网关联降解途径(ER-associated degradation, ERAD)被清除。在此降解途径中,错误折叠蛋白质底物如何被识别、穿越内质网膜,并被位于细胞质中的蛋白酶体降解,机制不清晰。我们从两个方面研究了该问题。首先,我们发现错误折叠膜蛋白在内质网膜被泛素化、并在驱动蛋白AAA-ATPase p97/VCP作用下从内质网膜移位至水溶性细胞质后,会经历一步“再泛素化”的机制,才能被蛋白酶体降解。我们鉴定了关键的泛素连接酶复合体BAG6-RNF126, 并将其命名为“再泛素化酶”。我们通过体内敲减和体外重构“再泛素化”等实验,阐明了移位到细胞质中的错误折叠膜蛋白被BAG6-RNF126复合体结合并泛素化的分子机制。“再泛素化”为蛋白酶体快速识别并降解位于细胞质中的错误折叠膜蛋白所必需,其有效加速了错误折叠膜蛋白的降解,减少了其在水溶性细胞质停留的时间,从而避免其形成毒性的聚集物沉积在细胞内。其次,我们研究了三种不同类型的ERAD底物穿越内质网膜时是否需要去折叠;我们发现具有不同结构性质的ERAD底物采用不同的去折叠和跨膜策略:(1)定位于内质网囊腔可溶性的ERAD-L底物无需去折叠,可完整的穿越内质网膜并降解,该过程由泛素连接酶Hrd1介导;(2)HIV 编码的蛋白质Vpu介导的CD4降解过程中,CD4需要去折叠才能通过内质网膜;(3)多次跨膜蛋白的内质网囊腔结构域必需处于完全去折叠的状态才能跨膜内质网膜,该过程由泛素连接酶gp78介导;诱导无结构的囊腔结构折叠会抑制其跨膜移位和降解。由此我们开发出了一种能捕获错误折叠蛋白质跨膜移位中间体的实验体系,为鉴定介导错误折叠蛋白质移位的蛋白质通道打下了基础。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A technique for delineating the unfolding requirements for substrate entry into retrotranslocons during endoplasmic reticulum-associated degradation.
一种描述内质网相关降解过程中底物进入逆转录转位子的展开要求的技术。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    J Biol Chem
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Junfen Shi;Xianyan Hu;Yuan Guo;Linhan Wang;Jia Ji;Jiqiang Li;Zai-Rong Zhang
  • 通讯作者:
    Zai-Rong Zhang
RNF126-Mediated Reubiquitination Is Required for Proteasomal Degradation of p97-Extracted Membrane Proteins
p97 提取的膜蛋白的蛋白酶体降解需要 RNF126 介导的重泛素化
  • DOI:
    10.1186/s12884-022-04661-8
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Molecular Cell
  • 影响因子:
    16
  • 作者:
    Xianyan Hu;Linhan Wang;Yuancai Wang;Jia Ji;Jiqiang Li;Zhiyuan Wang;Congcong Li;Yaoyang Zhang;Zai-Rong Zhang
  • 通讯作者:
    Zai-Rong Zhang
A network of chaperones prevents and detects failures in membrane protein lipid bilayer integration
分子伴侣网络可预防和检测膜蛋白脂质双层整合的失败
  • DOI:
    10.1038/s41467-019-08632-0
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Nature Communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Coelho Joao P L;Stahl Matthias;Bloemeke Nicolas;Meighen Berger Kevin;Alvira Carlos Piedrafita;Zai-Rong Zhang;Sieber Stephan A;Feige Matthias J
  • 通讯作者:
    Feige Matthias J

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张在荣的其他基金

内质网膜蛋白穿膜移位和降解的机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    53 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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