大分子及其粒子在细胞膜界面扩散行为与机理的模拟及理论分析

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21873053
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0309.高分子物理与高分子物理化学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Diffusion dynamics of macromolecules and their nanoparticles on the cell membrane is of essential importance to cellular functioning and to the development of novel nanocarriers for the targeted drug delivery. In this project, through applying and developing the mesoscale model and method, we aim to simulate the diffusion process of macromolecules and their nanoparticles on the lipid bilayer membrane-a model membrane of the real cell membrane, and build the theoretical model to analyze such a biophysical process, which would lead to a thorough insight into the dynamics and mechanism of the diffusion process of these materials at the interface of the cell membrane. Firstly, a dissipative-particle-dynamics (DPD) model of spherical nanoparticles with homogeneous surface will be developed to simulate their diffusion dynamics on the lipid bilayer, where the interaction parameters will be tailored to consider how various nanoparticle-membrane interaction states influence the diffusion dynamics. The conditions accounting for the possible diffusion patterns, that is, the Brownian and non-Brownian dynamics will be examined and the underlying physics will be in-depth discussed. Then, the nanoparticles with heterogeneous surface will be studied, so that the effects of the interactions, induced by the heterogeneous surface, the membrane fluctuation, and the spatial distribution of the charges on the nanoparticle surface, on the diffusion behaviors and mechanism can be considered. Finally, the in-plane diffusion behavior of the macromolecules with complex topologies, particularly the two-dimensional functional macromolecule, will be simulated, where the effect caused by the anisotropic shape on the diffusion patterns and the potential abnormal diffusion dynamics will be investigated. The physical principles for these dynamic behaviors will also be analyzed through developing a theoretical model. The findings might provide useful guidelines for the optimal design of the biomacromolecules toward wide biomedical applications, and might demonstrate an intuitive framework for the further research of this important topic.
本项目旨在运用和发展介尺度模拟方法和模型,研究大分子及其粒子在细胞双层磷脂薄膜界面上的扩散输运过程,并建立理论模型对该过程进行理论分析,以期阐明此类材料在细胞膜界面上的扩散动力学及机理。首先构建耗散粒子动力学模型研究均相表面的球形纳米粒子在双层磷脂薄膜上的扩散输运过程,并通过调控作用参数改变粒子与膜的作用状态,以明晰作用状态对扩散模式的影响,进而揭示可能的布朗运动与非布朗运动出现的条件及其隐含的物理机制。随后,将研究范围拓展至非均相粒子,以考察非均相表面所引发的各向异性作用、膜的涨落以及电荷空间分布等对扩散动力学及机理的影响。在此基础上,进一步考察具有复杂拓扑结构的二维功能大分子在双层脂膜界面上的扩散输运过程,以揭示形状各向异性效应所导致的扩散模式的变化以及潜在的反常扩散行为,并构建理论模型深入剖析对应的物理原理。为优化生物大分子材料的设计,促进其生物医学应用奠定理论基础,形成原创性成果。

结项摘要

深入探究大分子及其粒子在生物膜界面复杂作用和动力学行为的物理机制是高分子物理化学与软凝聚态物理相交叉的基础前沿课题,对于发展新型、高效的生物医用功能材料来说意义重大。该项目即立足于这一重要基础科学问题,旨在发展模拟计算模型和基于统计力学的分析理论,以深入研究此类体系在细胞膜界面的扩散输运动力学行为和影响因素,进而阐明该复杂动力学过程的物理化学机制。取得的重要结果概括如下:1)发展了适用于非对称各向异性粒子在细胞膜界面扩散输运的模拟模型和分析理论,进而从理论上发现了此类粒子在细胞膜界面的Lévy扩散动力学行为,并且从理论和实验两方面证实了其针对膜上靶点的高效药物递送效果。2)推导了高分子凝聚态物理新理论,并结合计算模拟,揭示了大分子粒子在生物大分子网络中扩散输运的网格拓扑效应、网链柔顺性效应以及动态连接点“开关门”效应。3)发展了活性物质生物界面作用的非平衡态理论研究这一新方向,并首次给出了活性各向异性大分子粒子细胞内化输运的理论模型,同时揭示了这一过程独特的动力学行为。4)提出了生物-纳米界面作用与动力学的熵调控新概念,并基于此实现了新型功能高分子体系的理性化设计,阐释了对应现象背后的熵机制。5)将生物-纳米界面熵调控的概念、模型与理论拓展至更为复杂的生物大分子和大分子胶体体系的界面结构构筑与动力学调控中,发展了多种熵驱有序组装体,并深入探究了此类体系中熵效应介导的输运动力学行为。6)发展了介尺度流体力学模型,适当探索了生物体中微纳流体通道内大分子功能体系的输运动力学及其调控机制,力图阐明生物界面上扩散与流体力学效应两种输运机制的差异。7) 该项目在执行期间申请人以通讯作者在Nat Comm, Sci Adv, PRL(2), JACS(2), ACS Nano(2), Nano Lett(2)等领域内重要期刊发表SCI收录文章21篇,并由科学出版社出版专著《软物质体系的熵调控》。该项目的研究结果显著丰富和完善了生物界面物质输运的物理理论框架,为理解相关生命现象和发展新型生物医用功能材料奠定了理论基础。

项目成果

期刊论文数量(21)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Entropic Control of Nanoparticle Self-assembly through Confinement
通过限制对纳米粒子自组装的熵控制
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Nanoscale Horizons
  • 影响因子:
    9.7
  • 作者:
    Cuiling Hou;Lijuan Gao;Yuming Wang;Li-Tang Yan
  • 通讯作者:
    Li-Tang Yan
Entropy-driven Self-assembly of Tethered Janus Nanoparticles on A Sphere
球体上束缚 Janus 纳米粒子的熵驱动自组装
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Fundamental Research
  • 影响因子:
    6.2
  • 作者:
    Guolong Zhu;Yuming Wang;Lijuan Gao;Ziyang Xu;Xuanyu Zhang;Xiaobin Dai;Lijun Dai;Cuiling Hou;Li-Tang Yan
  • 通讯作者:
    Li-Tang Yan
Entropy-Driven Crystallization of Colloid Particles Within Cylindrical Confinement
圆柱形约束内胶体粒子的熵驱动结晶
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Chemical Journal of Chinese Universities
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Cuiling Hou;Guolong Zhu;Xiaobin Dai;Ziyang Xu;Pengyu Chen;Xuanyu Zhang;Lijuan Gao;Li-Tang Yan
  • 通讯作者:
    Li-Tang Yan
Diffusive Transport of Nanoscale Objects through Cell Membranes: A Computational Perspective
纳米级物体通过细胞膜的扩散传输:计算视角
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Soft Matter
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Ziyang Xu;Lijuan Gao;Pengyu Chen;Li-Tang Yan
  • 通讯作者:
    Li-Tang Yan
Plastic Crystal-to-Crystal Transition of Janus Particles under Shear
剪切下 Janus 粒子的塑性晶体到晶体的转变
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Physical Review Letters
  • 影响因子:
    8.6
  • 作者:
    Zihan Huang;Guolong Zhu;Pengyu Chen;Cuiling Hou;Li-Tang Yan
  • 通讯作者:
    Li-Tang Yan

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其他文献

含Janus粒子组装体的构筑、调控及功能的模拟与理论分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Acta Polymerica Sinica
  • 影响因子:
    1.9
  • 作者:
    陈鹏宇;杨烨;朱国龙;燕立唐
  • 通讯作者:
    燕立唐
Optimal Reactivity and Improved Self-Healing Capability of Structurally-Dynamic Polymers Grafted on Janus Nanoparticles Governed by Chain Stiffness and Spatial Organization
由链刚度和空间组织控制的 Janus 纳米粒子上接枝的结构动态聚合物的最佳反应性和改进的自愈能力
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Small
  • 影响因子:
    13.3
  • 作者:
    Tianqi Cui;张兴华;苗兵;燕立唐
  • 通讯作者:
    燕立唐
Optimal Reactivity and Improved Self-Healing Capability of Structurally-Dynamic Polymers Grafted on Janus Nanoparticles Governed by Chain Stiffness and Spatial Organization
由链刚度和空间组织控制的 Janus 纳米粒子上接枝的结构动态聚合物的最佳反应性和改进的自愈能力
  • DOI:
    10.1002/smll.201603155
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Small
  • 影响因子:
    13.3
  • 作者:
    Guoxi Xu;Zihan Huang;Pengyu Chen;Tianqi Cui;张兴华;苗兵;燕立唐
  • 通讯作者:
    燕立唐

其他文献

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燕立唐的其他基金

大分子及其粒子界面行为的理论计算与模拟
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    400 万元
  • 项目类别:
    国家杰出青年科学基金
树枝状大分子跨细胞双层磷脂膜输运过程及机理的介观模拟及理论分析
  • 批准号:
    51273105
  • 批准年份:
    2012
  • 资助金额:
    80.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
Janus纳米粒子在嵌段共聚物中的定向与协同自组装:有序超分子结构及其力学性能
  • 批准号:
    21174080
  • 批准年份:
    2011
  • 资助金额:
    60.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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