HLA-DRB1风险氨基酸变异通过改变抗原结合槽的空间构象参与氨苯砜超敏反应综合征发生的机制研究

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项目介绍
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基本信息

  • 批准号:
    81903224
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1202.皮肤免疫性疾病
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Five amino acid variants in high disequilibrium within HLA-DRB1 were identified significantly associated with dapsone hypersensitivity syndrome by the applicant. Research findings were published in 《J Invest Dermatol》. Through Three dimensional crystal structure simulation analysis, we found HLA-DRB1 risk amino acid variants may affect the spatial conformation of antigen-binding groove. Previous research indicated that polymorphism of amino acid residues in the antigen-binding cleft influence interaction and recognition of specific drugs, peptides repertoire would be altered, evoking the immune response. Thus, we hypothesize that risk amino acid variants of HLA-DRB1 may influence the interaction between dapsone and HLA-DR, alter the peptide repertoire, activate T cells, and eventually induce dapsone hypersensitivity syndrome. In this program, we will perform molecular docking to detect the interaction between dapsone and HLA-DRB1 risk amino acid variants, LS-MS elution peptide analysis to detect whether dapsone affect the repertoire of peptides. The function and restricted pattern of HLA-DRB1 risk amino acid variants in dapsone-specific T-cells activation will be detected using lymphocyte transformation test and ELIspot, the phenotypic features and secreted cytokines of activated dapsone-specific T-cells will be analyzed by flow cytometry and ELISA. This program will reveal the function and molecular pathogenesis of HLA-DRB1 risk amino acid variants involving in DHS and provide suggestions for the precise prediction of DHS.
申请人前期发现HLA-DRB1上5个氨基酸(AA)变异与氨苯砜超敏反应综合征(DHS)发病相关,研究成果发表于《J Invest Dermatol》。三维晶体结构模拟分析发现上述AA变异影响了抗原结合槽的空间构象。既往研究已证实此类空间构象的变化可影响其与特定药物的交互作用,进而改变抗原肽谱激活免疫应答致药物超敏反应发生。因此,为证实5个风险AA变异在DHS发生中的作用机制是否遵循上述过程,申请人后续拟通过分子对接研究风险AA变异与氨苯砜间的交互作用;LC-MS洗脱肽分析研究氨苯砜与DRB1结合是否改变抗原肽谱;采用淋巴细胞活化试验、Elispot试验、流式、ELISA等分析风险AA变异在氨苯砜激活T细胞中的作用,对活化T细胞表型特征及细胞因子的影响,及对CD4+T细胞活化的限制性,以期深入探讨风险AA变异在DHS发生中的作用机制,为疾病精准预防奠定基础。

结项摘要

申请人前期发现HLA-DRB1上5个氨基酸(AA)变异与氨苯砜超敏反应综合征(DHS)发病相关,研究成果发表于《J Invest Dermatol》。三维晶体结构模拟分析发现上述AA变异影响了抗原结合槽的空间构象。既往研究已证实此类空间构象的变化可影响其与特定药物的交互作用,进而改变抗原肽谱激活免疫应答致药物超敏反应发生。后续课题组利用体外刺激培养成功制备多种T细胞克隆,并且通过单细胞TCR测序成功发现氨苯砜特异性T细胞为多克隆T细胞;通过全基因组关联分析和全基因组甲基化技术成功发现影响抗原递呈细胞功能的关键分子-TAP,加上课题组之前发现的氨苯砜与HLA分子的结合发生在抗原递呈细胞后,因此课题组得出TAP影响内源性抗原肽的转运,从而改变影响氨苯砜特异性T细胞应答激活的抗原肽谱;进一步通过体外TAP功能抑制实验发现,氨苯砜特异性T细胞应答的产生依赖于TAP功能的完整性;而TAP基因通过影响HLA分子的表达以及影响HLA分子与内源性抗原肽的结合发挥作用。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
HLA Class-II‒Restricted CD8+ T Cells Contribute to the Promiscuous Immune Response in Dapsone-Hypersensitive Patients
HLA-II 类限制性 CD8 T 细胞导致氨苯砜过敏患者出现混杂的免疫反应
  • DOI:
    10.1016/j.jid.2021.03.014
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Journal of Investigative Dermatology
  • 影响因子:
    6.5
  • 作者:
    Qing Zhao;Mubarak Almutairi;Arun Tailor;Adam Lister;Nicolas Harper;James Line;Xiaoli Meng;Jirawat Pratoomwun;Kanoot Jaruthamsophon;Chonlaphat Sukasem;Yonghu Sun;Lele Sun;Monday O. Ogese;David J. MacEwan;Munir Pirmohamed;Jianjun Liu;David A. Ostrov;Hong Li
  • 通讯作者:
    Hong Li
TAP2 Drives HLA-B*13:01-Linked Dapsone Hypersensitivity Syndrome Tolerance and Reactivity
TAP2 驱动 HLA-B13:01 相关氨苯砜超敏综合征耐受性和反应性
  • DOI:
    10.1016/j.jid.2022.10.009
  • 发表时间:
    2023-04-17
  • 期刊:
    JOURNAL OF INVESTIGATIVE DERMATOLOGY
  • 影响因子:
    6.5
  • 作者:
    Sun,Lele;Wang,Zhenzhen;Zhang,Furen
  • 通讯作者:
    Zhang,Furen

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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