胎儿非综合征先天性心血管畸形全基因组拷贝数变异分析

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基本信息

  • 批准号：
    31471204
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    80.0万
  • 负责人：
    谢建生
  • 依托单位：
    南方医科大学
  • 学科分类：
    C0607.基因组学
  • 结题年份：
    2018
  • 批准年份：
    2014
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

According to etiology,fetal congenital heart disease(CHD) can be divided into two types of known syndrome and sporatic,Non-syndrome.This project will selects cases of fetuses with Non-syndromic congenetial heart disease as research targets.Using the techniques of genome-wide Array-CGH or next-generation DNA sequencing,we manage to discover suspecious disease-assciation copy number variants in the research cases. Comparing with biological information from control cases of normal fetuses, disease-association copy number variants could be identified.This project can overcome shortages such as rare type of CHD by selectiong live birth's cases with CHD and let us understand comprehensively the pathogenesis of CHD.
胎儿先天性心脏病可分为已知的综合征性先天性心脏病和散发的、病因未明的非综合征性先天性心脏病。本课题通过对胎儿先天性心脏病病例进行细胞遗传和分子遗传学研究，筛选出非综合征性胎儿先天性心脏病病例，进一步进行全基因组拷贝数变异关联研究，发现可疑致病性拷贝数变异，经与因计划生育等原因引产的胎儿组织标本进行比对和遗传流行病学统计分析，筛选出导致非综合征性胎儿先天性心脏病的致病性拷贝数变异。本课题能够克服目前国内外先心病遗传因素研究主要以活产患儿作为研究对象存在的病种较少、不能覆盖胎死宫内或出生即夭折的先心病病例的局限，从而更广泛、深入地研究心血管系统畸形的类型及其发病机制，可望发现新的致畸基因变异类型，进一步揭示先天性心脏病发病的分子机制。

结项摘要

胎儿先天性心脏病（Congenital heart disease,CHD）可分为已知的综合征性CHD和散发的、病因未明的非综合征性CHD。本课题通过对胎儿CHD病例进行细胞遗传和分子遗传学研究，筛选出非综合征性胎儿CHD病例，进一步进行全基因组拷贝数变异（Copy number variation,CNV）关联研究，筛选出导致非综合征性胎儿CHD的致病性CNV。到目前为止，共收集了402例经超声诊断为先天性心脏畸形的胎儿，其中包括活产、死产、出生即夭折以及暂未出生的胎儿。其中42例样本为引产后脐带、绒毛及组织，余下360例胎儿的样本为羊水、活检绒毛及脐带血。我们对42例引产胎儿进行了染色体微阵列分析，对余下360例胎儿中的355例同时进行G显带染色体核型分析和染色体微阵列分析（另外5例因孕周过大羊水细胞培养失败）。结果如下：1、共检出86例致病性CNV；12例可能致病的CNV；21例临床意义未明的CNV，7例可能良性的CNV。致病及可能致病CNV的检出率为24.4%（98/402），染色体数目异常占9.5%（38/402）。2、按是否合并其他异常将胎儿CHD分为4类：单纯CHD组，253例，占62.9%；CHD合并心外结构畸形组，107例，占26.6%；CHD合并FGR组，21例，占5.2%；CHD合并软指标异常组，27例，占6.7%。有6例CHD胎儿既合并心外畸形又合并有FGR。3、各组致病和可能致病CNV的检出率及两两比较：单纯型CHD组为16.2%（41/253）；CHD合并心外结构畸形组为39.3%（42/107）；CHD合并FGR组为42.9%（9/21）；CHD合并软指标异常组为33.3%（9/27）。单纯CHD组和CHD合并心外结构畸形组比较差异有统计学意义；单纯CHD组和CHD合并FGR组比较差异有统计学意义；其他小组之间两两比较均无统计学意义。4、两种检测方法的比较：染色体核型和染色体微阵列对异常CNV的检出率分别为14.6%（52/355）和29.6%（119/402），二者差异有统计学意义。5、对31例未检出染色体数目异常和拷贝数变异的胎儿先天性心脏病病例，进一步进行全外显子组高通量DNA测序分析。其中检出12例单基因可疑致病或致病突变病例，10例胎儿先心病标本检出临床意义不明基因突变。9例胎儿先心病标本未检出与先心病相关的基因突变。

项目成果

期刊论文数量（9）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Novel homozygous FANCL mutation and somatic heterozygous SETBP1 mutation in a Chinese girl with Fanconi Anemia
范可尼贫血中国女孩中新型纯合 FANCL 突变和体细胞杂合 SETBP1 突变
  • DOI：
    10.1016/j.ejmg.2017.04.008
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    European Journal of Medical Genetics
  • 影响因子：
    1.9
  • 作者：
    Wu Weiqing;Liu Yang;Zhou Qinghua;Wang Qin;Luo Fuwei;Xu Zhiyong;Geng Qian;Li Peining;Zhang Hui Z;Xie Jiansheng
  • 通讯作者：
    Xie Jiansheng
CC2D2A基因变异所致Joubert综合征一家系的临床及分子遗传学分析
  • DOI：
    10.3760/cma.j.issn.0578-1310.2015.06.007
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    中华儿科杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    苏艳华;谢建生;尉姗姗;罗红玉;吴维青;徐志勇
  • 通讯作者：
    徐志勇
4例Williams-Beuren综合征家系遗传学诊断与产前诊断
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    中国当代儿科杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘洋;徐志勇;吴维青;罗福薇;谢建生
  • 通讯作者：
    谢建生
G显带核型和多重连接依赖探针扩增联合分析胎儿先天性心脏畸形染色体异常
  • DOI：
    10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2017.01.001
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    中华医学遗传学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    谢建生
  • 通讯作者：
    谢建生
Multiplex ligation-dependent probe amplification and array comparative genomic hybridization analyses for prenatal diagnosis of cytogenomic abnormalities.
多重连接依赖性探针扩增和阵列比较基因组杂交分析用于细胞基因组异常的产前诊断。
  • DOI：
    10.1186/s13039-014-0084-5
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    Molecular cytogenetics
  • 影响因子：
    1.3
  • 作者：
    Xu Z;Geng Q;Luo F;Xu F;Li P;Xie J
  • 通讯作者：
    Xie J

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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