己酮糖3-差向异构酶的构效关系与分子改造

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31171705
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    63.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2002.食品生物化学
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

稀有糖是碳水化合物研究新热点,己糖类稀有糖可依据己糖类单糖循环生物转化策略来获得最佳生物法制备途径,己酮糖3-差向异构酶是实现己糖类单糖循环转化的最基础的酶类,然而该酶类的底物特异性、热稳定性、弱酸稳定性等结构基础及功能改造等研究并不深入。本项目运用分子生物学、生物信息学及现代检测分析等方法,结合计算机模拟与突变研究技术,解析己酮糖3-差向异构酶的结构功能关系及催化机理,揭示己酮糖3-差向异构酶的底物特异性、热稳定性、弱酸稳定性及金属离子依赖性等机制;采用基于计算机模拟的分子设计或定点饱和突变技术结合高效筛选手段,实现己酮糖3-差向异构酶的定向改造与功能优化,以提高热稳定性及酶反应活力,改善底物特异性及弱酸稳定性,构建适用于单糖循环生物转化产业化应用的突变体酶,为碳水化合物资源开发利用提供新思路。

结项摘要

本项目利用分子生物学而技术,筛选到了几种新型的D-阿洛酮糖 3-差向异构酶并进行了分子改造,研究结果概括如下:(1)通过分子克隆、表达纯化和性质鉴定,研究了来源于Clostridium sp. BNL1100、Desmospora sp. 8437和Treponema primitia ZAS-1等微生物DPEase的酶学性质与动力学参数;(2)研究酶学性质发现,重组Clostridium sp. DPEase、Desmospora sp. DPEase和T. primitia DPEase的最适pH分别为8.0、7.5和8.0;三种重组酶的最适温度分别为60 oC、65 oC和70 oC。三种酶均有较宽的pH作用范围(pH 6.0~9.0),并且在此pH范围内稳定性较好。重组酶对温度都比较敏感,50 oC以下时热稳定较好,但在60 oC进行温育时,重组酶很容易变性失去生物活性。这三种酶都是离子依赖型酶,只有Co2+存在时才能表现出催化活性。(3)三种重组酶的最适底物均为D-阿洛酮糖,当以D-阿洛酮糖为底物时,Clostridium sp. DPEase、Desmospora sp. DPEase和T. primitia DPEase的Km值分别为228、81和209 mM;当以D-果糖为底物时,它们的Km值分别为279、549和279 mM。(4)利用已有的晶体结构信息,利用SWISS-MODEL对C. bolteae DPEase酶单体的结构进行模拟,利用Discovery studio软件对C. bolteae DPEase酶和D-果糖进行对接,获得位于活性中心的关键氨基酸位点为Glu158,His188,Arg217,Glu152,Glu246,Y68和G109。突变结果表明,Glu152和Glu246为催化活性中心关键氨基酸,Glu158,His188和Arg217与底物结合有关,68和109位的氨基酸与底物识别有关,影响活性口袋的形成。并成功构建双突变体Y68I/G109P,该突变体酶对D-果糖的亲和能力更高,具有更好的热稳定性。该项目的开展对于己酮糖3-差向异构酶的结构与功能关系的阐明及该酶工业化应用提供必要的理论基础。在本基金项目资助下,已发表SCI论文25篇,获得授权发明专利2项,申请国家发明专利5项,荣获教育部科技进步二等奖1项。

项目成果

期刊论文数量(28)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(4)
专利数量(0)
Characterization of a D-psicose-producing enzyme, D-psicose 3-epimerase, from Clostridium sp.
来自梭菌属的 D-阿洛酮糖生产酶、D-阿洛酮糖 3-差向异构酶的表征。
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2013-09-01
  • 期刊:
    BIOTECHNOLOGY LETTERS
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Mu, Wanmeng;Zhang, Wenli;Zhang, Tao
  • 通讯作者:
    Zhang, Tao
Characterization of D-lactate dehydrogenase from Pediococcus acidilactici that converts phenylpyruvic acid into phenyllactic acid
将苯丙酮酸转化为苯乳酸的乳酸片球菌 D-乳酸脱氢酶的表征
  • DOI:
    10.1007/s10529-012-0847-1
  • 发表时间:
    2012-05-01
  • 期刊:
    BIOTECHNOLOGY LETTERS
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Mu, Wanmeng;Yu, Shuhuai;Li, Xingfeng
  • 通讯作者:
    Li, Xingfeng
Molecular cloning, expression, and enzymatic characterization of Solanum tuberosum hydroperoxide lyase
马铃薯氢过氧化物裂合酶的分子克隆、表达和酶学表征
  • DOI:
    10.1007/s00217-012-1685-z
  • 发表时间:
    2012-04-01
  • 期刊:
    EUROPEAN FOOD RESEARCH AND TECHNOLOGY
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Mu, Wanmeng;Xue, Qinghai;Hua, Yufei
  • 通讯作者:
    Hua, Yufei
Recent research on 3-phenyllactic acid, a broad-spectrum antimicrobial compound
广谱抗菌化合物3-苯基乳酸的最新研究
  • DOI:
    10.1007/s00253-012-4269-8
  • 发表时间:
    2012-09-01
  • 期刊:
    APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Mu, Wanmeng;Yu, Shuhuai;Jiang, Bo
  • 通讯作者:
    Jiang, Bo
Production of 3-phenyllactic acid and 4-hydroxyphenyllactic acid by Pediococcus acidilactici DSM 20284 fermentation
利用乳酸片球菌 DSM 20284 发酵生产 3-苯基乳酸和 4-羟基苯基乳酸
  • DOI:
    10.1007/s00217-012-1768-x
  • 发表时间:
    2012-07
  • 期刊:
    European Food Research and Technology
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    沐万孟
  • 通讯作者:
    沐万孟

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  • 作者:
    沐万孟
  • 通讯作者:
    沐万孟
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    沐万孟
  • 通讯作者:
    沐万孟

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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