拟南芥ABS3亚家族基因调控黑暗胁迫下叶片衰老的机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31570267
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    63.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0205.植物与环境互作
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Plant senescence is an essential stage of plant growth and development, and it is critically important for processes such as reproductive growth and seed formation in plant life cycles. Previously, we identified two Arabidopsis thaliana gain-of-function development mutants, abs3-1D and abs4-1D. The cloning of corresponding genes ABS3 and ABS4 revealed that both genes belong to the ABS3 subfamily of MATE transporter gene family. Both abs3-1D and abs4-1D showed accelerated leaf senescence in dark-induced leaf senescence assays, while quadruple mutant of ABS3 subfamily of MATE genes (mateq) displayed a stay-green phenotype and delayed leaf senescence in the dark, indicating that ABS3 subfamily genes positively regulate dark-induced leaf senescence. In this project, we plan to carry out experiments including detailed characterizations of gain-of-function and loss-of-function mutants, transcriptome analysis and genetic interaction and genetic suppressor analyses, to elucidate the mechanisms of ABS3 subfamily genes-mediated leaf senescence under dark stress. This project will not only enhance our understanding of the basic process of plant senescence, it will also provide foundation for future artificial manipulation of plant senescence to improve plant traits.
植物衰老是植物生长发育的重要阶段,对植物生殖发育、种子形成等生命活动过程具有重要意义。在前期工作中申请人筛选了拟南芥显性发育突变体abs3-1D和abs4-1D并相应克隆了同属ABS3亚家族的MATE转运蛋白基因ABS3和ABS4。在黑暗胁迫下abs3-1D和abs4-1D表现出叶片衰老加剧表型,而ABS3亚家族MATE转运蛋白基因的四重功能缺失突变体mateq在黑暗胁迫下表现出功能型滞绿表型,表明ABS3亚家族基因正调控黑暗胁迫下叶片衰老过程。本项目拟通过ABS3亚家族MATE转运蛋白基因调控黑暗胁迫下叶片衰老的特征研究、基因表达研究和遗传互作网络研究三部分内容,阐明ABS3亚家族MATE转运蛋白基因调控黑暗胁迫下叶片衰老的作用机制。本项目的研究将有望增进对植物衰老这一基本生物学过程的理解,并为通过调控植物衰老过程来改造植物性状提供理论支撑。

结项摘要

衰老过程是植物生命周期的重要环节,也受到环境因子的密切调控。胁迫环境如黑暗或弱光诱导植物启动衰老程序。衰老进程的加剧或延缓对植物响应逆境胁迫、生物量形成和作物产量建成至关重要。但是目前对植物衰老调控的分子机理,特别是植物响应环境胁迫的衰老调控机理的认识还十分有限。本项目围绕拟南芥ABS3亚家族MATE基因调控黑暗胁迫下植物衰老的作用机制开展了研究。在黑暗碳饥饿胁迫下和自然生长过程中,ABS3亚家族MATE基因过表达加速总蛋白降解和植物衰老,功能缺失则显著抑制衰老。遗传分析发现ABS3亚家族MATE基因的功能缺失可以有效抑制自噬缺陷突变体atg5和atg7的黑暗早衰表型,这是首次报道自噬突变体的遗传抑制机制,说明自噬缺陷激活的衰老途径依赖于ABS3亚家族MATE。ABS3亚家族MATEs与自噬关键蛋白ATG8物理互作,且这一作用与ATG8在经典自噬途径中的功能不同,代表ATG8的一个与自噬无关的新功能。ABS3-ATG8互作依赖于ABS3蛋白序列中的两个ATG8互作基序(AIM),定点突变这两个AIM抑制ABS3-ATG8互作和ABS3促进衰老的作用。ABS3-ATG8互作介导的衰老调控模式在拟南芥和小麦中保守,可能代表一个高等植物中保守的衰老调控范式。基于这些工作提出了ATG8-ABS3互作控制植物衰老的模型。黑暗碳饥饿诱导衰老条件下,衰老相关基因的RT-qPCR分析和RNA-seq转录组分析,揭示ABS3介导衰老调控通路包括大量基因在转录水平的深刻变化。开展了abs3-1D早衰表型的遗传抑制子筛选,鉴定得到ABS3介导衰老途径中的两个关键转录因子。这项工作建立了一个新的植物ABS3亚家族MATE基因介导的蛋白降解和衰老调控途径,加深了对植物衰老遗传调控网络的认识,为人工调控作物衰老进程提供了重要的理论支撑。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Chloroplast Translation Initiation Factors Regulate Leaf Variegation and Development
叶绿体翻译起始因子调节叶片杂色和发育。
  • DOI:
    10.1104/pp.15.02040
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    PLANT PHYSIOLOGY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Zheng Mengdi;Liu Xiayan;Liang Shuang;Fu Shiying;Qi Yafei;Zhao Jun;Shao Jingxia;An Lijun;Yu Fei
  • 通讯作者:
    Yu Fei
Balance between Cytosolic and Chloroplast Translation Affects Leaf Variegation
细胞质和叶绿体翻译之间的平衡影响叶子杂色。
  • DOI:
    10.1104/pp.17.00673
  • 发表时间:
    2018-01-01
  • 期刊:
    PLANT PHYSIOLOGY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Wang, Ruijuan;Zhao, Jun;Yu, Fei
  • 通讯作者:
    Yu, Fei
Noncanonical ATG8-ABS3 interaction controls senescence in plants
非经典 ATG8-ABS3 相互作用控制植物衰老。
  • DOI:
    10.1038/s41477-018-0348-x
  • 发表时间:
    2019-02-01
  • 期刊:
    NATURE PLANTS
  • 影响因子:
    18
  • 作者:
    Jia, Min;Liu, Xiayan;Yu, Fei
  • 通讯作者:
    Yu, Fei
A New Allele of the SPIKE1 Locus Reveals Distinct Regulation of Trichome and Pavement Cell Development and Plant Growth.
SPIKE1 基因座的一个新等位基因揭示了毛状体和路面细胞发育和植物生长的独特调节。
  • DOI:
    10.3389/fpls.2019.00016
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Frontiers in Plant Science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Liang Shuang;Yang Xuying;Deng Meng;Zhao Jun;Shao Jingxia;Qi Yafei;Liu Xiayan;Yu Fei;An Lijun
  • 通讯作者:
    An Lijun

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  • 通讯作者:
    谭伟民
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    --
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  • 通讯作者:
    谭伟民

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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