染色体3q13和5p13区域遗传变异与胃癌易感性的分子流行病学研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81202267
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    23.0万
  • 负责人：
    戴俊程
  • 依托单位：
    南京医科大学
  • 学科分类：
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份：
    2015
  • 批准年份：
    2012
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2013-01-01 至2015-12-31

项目摘要

Although H.pylori infection is one of the major risk factors for gastric cancer, only a small proportion of infected individuals develop gastric cancer, suggesting that both environmental and genetic factors play important roles in gastric cancer pathogenesis. Our latest gastric cancer GWAS study have identified two new susceptibility loci at 3q13 and 5p13 region, however, the exact genetic etiology and mechanisms of gastric cancer in these regions are unclear. On the basis of our previous GWAS study and combing with the databases of 1000 Genomes and Hapmap, this project is proposed to firstly resequence the GWAS-reported regions using Next-generation sequencing(NGS) technology, then perform fine-mapping study and related molecular biology assays by using a large-sample case-control design. Three aspects will be considered in the project: 1. Identify the genetic variations in 3q13 and 5p13 regions related to gastric cancer in Chinese population; 2. Detect gene-gene and gene-environmental interactions between genetic variants and related risk factors; 3. Reveal the regulatory mechanisms of the relevant genetic variations of susceptibility genes(such as PTGER4, PRKAA1 and ZBTB20). The results of this project could improve understanding of the etiology and mechanisms of gastric cancer development, which in turn is important for early detection, diagnosis and targeted treatment of gastric cancer.
幽门螺旋杆菌感染(H. pylori)是胃癌发生的主要危险因素之一，但仅小部分感染者最终罹患胃癌，提示胃癌的发生是环境和遗传因素共同作用的结果。本课题组最新全基因组关联研究发现，染色体3q13和5p13区域可能是胃癌的重要易感区域，但该区域遗传变异在胃癌发生中的具体遗传机制尚未阐明。本研究在前期工作的基础上，拟通过对上述两个区域进行重测序，结合千人基因组计划(1000 Genome)和人类单倍型计划(Hapmap)数据库，采用大样本精细作图研究以及分子生物学手段深入探讨：①染色体3q13和5p13区域的遗传变异在中国人群胃癌发生中的作用；②基因-基因、基因与环境暴露之间的交互作用；③相关遗传变异对候选易感基因(如PTGER4、PRKAA1和ZBTB20)的调控机制。研究结果将为胃癌发生机制的阐明提供理论基础，所发现的遗传标志物可为胃癌高危人群的筛查和早诊早治提供科学依据。

结项摘要

以课题组近年来在胃癌分子流行病学研究方面的成果为理论和技术基础，采用大样本的两阶段病例-对照研究设计，对染色体3q13 和5p13 区域遗传变异进行了精细作图研究，筛选并验证了这两个区域上多个功能性SNPs 和标签SNPs与胃癌遗传易感性的关系，以及相关的基因－基因和基因-环境在胃癌发生中的交互作用；验证各通路联合基因型与表型的相互关系及其在胃癌发病风险中的作用，并进行相关的生物学功能研究。研究结果将为胃癌发生机制的阐明提供理论基础，所发现的遗传标志物可为胃癌高危人群的筛查和早诊早治提供科学依据。

项目成果

期刊论文数量（8）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Genetic variants at 5p15 are associated with risk and early onset of gastric cancer in Chinese populations
5p15 的遗传变异与中国人群胃癌的风险和早期发病相关
  • DOI：
    10.1093/carcin/bgt259
  • 发表时间：
    2013-11-01
  • 期刊：
    CARCINOGENESIS
  • 影响因子：
    4.7
  • 作者：
    Du, Jiangbo;Xu, Yaochu;Jin, Guangfu
  • 通讯作者：
    Jin, Guangfu
Telomere length, genetic variants and gastric cancer risk in a Chinese population
中国人群的端粒长度、遗传变异和胃癌风险。
  • DOI：
    10.1093/carcin/bgv075
  • 发表时间：
    2015-09-01
  • 期刊：
    CARCINOGENESIS
  • 影响因子：
    4.7
  • 作者：
    Du, Jiangbo;Zhu, Xun;Jin, Guangfu
  • 通讯作者：
    Jin, Guangfu
Genetic variants at 8q24 are associated with risk of esophageal squamous cell carcinoma in a Chinese population.
8q24 的遗传变异与中国人群食管鳞状细胞癌的风险相关
  • DOI：
    10.1111/cas.12399
  • 发表时间：
    2014-06
  • 期刊：
    Cancer science
  • 影响因子：
    5.7
  • 作者：
    Dai N;Zheng M;Wang C;Ji Y;Du J;Zhu C;He Y;Zhu M;Zhu X;Sun M;Dai J;Ma H;Chen J;Hu Z;Gu H;Jin G;Shen H
  • 通讯作者：
    Shen H

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

其他文献

全基因组关联性研究的基因型填补
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    中国卫生统计
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    赵杨;戴俊程;柏建岭;彭志行;于浩;沈洪兵;陈峰
  • 通讯作者：
    陈峰
三种块缺失数据处理方法的比较
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    中国卫生统计
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    林丽娟;董学思;赵杨;魏永越;戴俊程;陈峰
  • 通讯作者：
    陈峰
多组学联合缺失数据填补方法的评价
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    中国卫生统计
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    董学思;林丽娟;赵杨;魏永越;戴俊程;陈峰
  • 通讯作者：
    陈峰

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败，请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题，我已根据课题信息分析并撰写以下内容，帮您拓宽课题思路：

AI项目思路

AI技术路线图

戴俊程的其他基金

基于自然人群队列的长寿相关遗传变异鉴定及其生物学机制研究
  • 批准号：
    81941020
  • 批准年份：
    2019
  • 资助金额：
    90 万元
  • 项目类别：
    专项基金项目
血浆环状RNA作为肺癌早期生物标志物的分子流行病学研究
  • 批准号：
    81573238
  • 批准年份：
    2015
  • 资助金额：
    55.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者：{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
关闭
close
客服二维码