以磷酸甘油酸酯激酶 pgk-1为靶点的新型活性小分子研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21877093
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    67.5万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0706.药物化学生物学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Phosphoglycerate kinase-1 (pgk-1) is a kinase ubiquitously distributed in nearly all organisms, catalyzing key biochemical reactions in the glycolytic pathway. Recently research developments have identified that, besides glycolysis, pgk-1 also participates in many other signaling pathways and exhibits various important biological functions in cells. As a result, pgk-1 has been intimately implicated in many human diseases including neuropathy, malignant cancer, stroke, sepsis, infectious diseases, etc. As a classic kinase in glucose metabolism, pgk-1’s biochemical and structural properties have been extensively studied; however, research on pgk-1’s non-metabolic functions is still very limited, presumably due to the lack of effective small molecule probes that can modulate pgk-1’s enzymatic activities. Previously we discovered that terazosin, a marketed anti-hypertension drug, can activate pgk-1, and we have elucidated the underlying mechanism that pgk-1 activates the downstream HSP90 and then induce multi-stress resistance to apoptosis in cells and in vivo. Based on these results, here we propose to design and develop novel small molecules that can selectively activates and inhibits pgk-1, and to use these small molecules as probes to investigate the molecular mechanisms underlying pgk-1’s biological functions. We expect the proposed research will provide novel and useful tools for studying pgk-1, discovering drug candidates, and developing versatile probes targeting pgk-1 in various forms of cancers.
磷酸甘油酯激酶pgk-1是一种广泛存在于细胞内,在糖代谢中产生催化活性的重要激酶。除糖代谢之外,pgk-1还具有多种重要的生物功能:pgk-1的失调和神经系统疾病、恶性肿瘤、败血症、传染性疾病等人类重要疾病密切相关。虽然pgk-1的传统生物化学研究较为成熟,但由于缺乏有效的小分子探针,人们对pgk-1在糖代谢之外生物功能的研究和作用机制的理解非常有限,成为亟待取得突破的研究方向。我们的前期工作发现了pgk-1的小分子激活剂特拉唑嗪,并揭示了pgk-1激活下游的热受激蛋白HSP90,在细胞和活体中抑制凋亡的信号通路。本项目将基于该工作基础,以特拉唑嗪为出发点,发展新型骨架结构的活性小分子,实现对pgk-1的有效激活和抑制,并以此为探针工具进行pgk-1在肿瘤细胞中功能机制的研究。由于pgk-1在生命过程中的重要性,本申请对探索癌症分子机理、抗肿瘤药物研发方面,具有重要的科学和实际意义。

结项摘要

磷酸甘油酯激酶pgk-1是一种广泛存在于细胞内,在糖代谢中产生催化活性的重要激酶。除糖代谢之外,pgk-1还具有多种重要的生物功能:pgk-1的失调和神经系统疾病、恶性肿瘤、败血症、传染性疾病等人类重要疾病密切相关。虽然pgk-1的传统生物化学研究较为成熟,但对pgk-1在糖代谢之外生物功能的研究和作用机制的理解非常有限,成为亟待取得突破的研究方向。我们的前期工作发现了pgk-1的小分子激活剂特拉唑嗪,以及与下游热受激蛋白HSP90之间的关联。本项目基于该工作基础,以特拉唑嗪为化学基础,设计、合成,并发展了新型结构的pgk-1激活剂和抑制剂,并且在研究工作中发现了pgk-1与细胞中ISOC蛋白相关,存在新颖的ISOC-pgk-1蛋白复合体,在细胞迁移和细胞自噬的信号传导通路中起着重要作用。由于ISOC本身的蛋白结构和生物功能基本是空白,以及pgk-1在生命过程中的重要性,本项目的研究成果对探索癌症分子机理、抗肿瘤药物研发方面,提供了新颖的靶点以及药物开放的物质基础。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Identification of isoform/domain-selective fragments from the selection of DNA-encoded dynamic library
从 DNA 编码动态文库的选择中鉴定异构体/结构域选择性片段
  • DOI:
    10.1016/j.bmc.2021.116328
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Bioorganic & Medicinal Chemistry
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Zhou Yu;Shen Wenyin;Peng Jianzhao;Deng Yuqing;Li Xiaoyu
  • 通讯作者:
    Li Xiaoyu
Psoralen as an interstrand DNA crosslinker in the selection of DNA-Encoded dynamic chemical library
补骨脂素作为 DNA 链间交联剂在 DNA 编码动态化学库选择中的应用
  • DOI:
    10.1016/j.bbrc.2020.04.033
  • 发表时间:
    2020-12-03
  • 期刊:
    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Zhou,Yu;Peng,Jianzhao;Li,Xiaoyu
  • 通讯作者:
    Li,Xiaoyu
Identification of Histone deacetylase (HDAC)-Associated Proteins with DNA-Programmed Affinity Labeling
使用 DNA 编程亲和标记鉴定组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 相关蛋白
  • DOI:
    10.1002/anie.202001205
  • 发表时间:
    2020-08-11
  • 期刊:
    ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Zhang,Jianfu;Peng,Jianzhao;Li,Xiaoyu
  • 通讯作者:
    Li,Xiaoyu
Selection of DNA-encoded chemical libraries against endogenous membrane proteins on live cells
针对活细胞内源膜蛋白的 DNA 编码化学文库的选择
  • DOI:
    10.1038/s41557-020-00605-x
  • 发表时间:
    2020-12-21
  • 期刊:
    NATURE CHEMISTRY
  • 影响因子:
    21.8
  • 作者:
    Huang, Yiran;Meng, Ling;Li, Xiaoyu
  • 通讯作者:
    Li, Xiaoyu
Introducing aldehyde functionality to proteins using ligand-directed affinity labeling
使用配体定向亲和标记将醛功能引入蛋白质
  • DOI:
    10.1039/d0cc01982h
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Chemical Communications
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Song Yinan;Xiong Feng;Peng Jianzhao;Fung Yi Man Eva;Huang Yiran;Li Xiaoyu
  • 通讯作者:
    Li Xiaoyu

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    胡月明

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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