内质网钙过载离子通道TMCO1的结构和功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31872722
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0503.细胞感应与环境生物物理
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

The endoplasmic reticulum (ER) is the main intracellular Ca2+ store to maintain the Ca2+ homeostasis for proper Ca2+ signaling and key cellular functions. TMCO1 is a recently identified calcium channel that prevents endoplasmic reticulum from calcium overfilling, thereby playing a crucial role in calcium homeostasis. In response to calcium overloading, TMCO1 assembles into a functional calcium-selective channel, regulating the calcium content in endoplasmic reticulum store. The active form of TMCO1 is a homotetramer, while it disassembles to a dimer upon Ca2+ depletion. TMCO1 is a highly conserved protein among species, but its primary sequence does not resemble any calcium channel studied to date. Here we propose to determine the high-resolution structure of TMCO1 using nuclear magnetic resonance (NMR) and electron microscopy (EM) in combination. We will further study how TMCO1 can be activated by Ca2+ and how TMCO1 releases Ca2+ to the cytoplasm. The detailed structures of TMCO1 will provide the valuable knowledge of understanding the mechanistic mechanisms of TMCO1 activation and regulation, which will further benefit the studies of TMCO1 defect syndrome.
钙离子的稳态平衡对细胞的生理功能至关重要。内质网是细胞内最重要的钙库,其钙水平过高或过低都会造成钙信号紊乱,进而导致细胞生理功能异常,引发疾病。TMCO1是最近鉴定出来定位于内质网上的钙离子过载激活的钙通道蛋白。TMCO1能感知内质网中过高的钙浓度并形成具有钙离子通道活性的四聚体,将内质网中过多的钙离子排出。当内质网中Ca2+浓度下降到正常水平,TMCO1则解聚成二聚体,失去钙离子通道活性,以免Ca2+的过度释放。TMCO1的序列高度保守,但与迄今已知结构的钙离子通道序列都不相似。本项目中我们将综合利用核磁、电镜等多种结构生物学手段对TMCO1进行系统全面的结构解析,对TMCO1如何响应和转运钙离子进行深入研究,揭示不同状态下TMCO1 的分子基础和作用机制,为深入了解TMCO1的体内功能奠定基础,为相关疾病的药物研制提供思路和线索。

结项摘要

TMCO1是真核生物中定位于内质网一个高度保守的膜蛋白。研究发现,TMCO1是遗传性疾病脑颅胸发育异常 (CFT dysplasia) 的致病原因。近年来TMCO1蛋白被发现在多种肿瘤细胞中高表达,可以作为肿瘤治疗的潜在靶点。TMCO1于2016年首次被报道是一种内质网的钙离子通道,当TMCO1形成同源四聚体时,将对内质网腔体中过量的Ca2+进行转运,从而维持内质网中钙离子的平衡。然而TMCO1的结构一直以来扑朔迷离,甚至拓扑结构都存在争议。本项目中我们综合利用核磁、晶体衍射和电镜等多种结构生物学手段尝试对TMCO1进行结构解析。我们首先收集了DdTMCO1 的核磁三共振实验数据,完成了DdTMCO1的主链归属,解析了DdTMCO1的二级结构。在此基础上,我们对DdTMCO1进行了钙离子滴定,发现DdTMCO1的DxxD motif在加入钙离子后会发生明显的化学位移的变化。然而我们发现DdTMCO1的膜外区域由于受到DPC的影响,其α螺旋二级结构遭到破坏。因此,我们进一步在大肠杆菌和昆虫细胞表达体系中对50多个物种的TMCO1进行表达结晶筛选,可惜没有获得稳定且有活性的纯蛋白。我们将DdTMCO1的核磁样品置换到Amphipol,制备成了负染电镜的样品,并在200kv的电镜下收集了数据,获得了蛋白二维平均的初步形貌。然而在2020年8月,McGilvray et. al在elife上发表了TMCO1在内质网转运体复合物中的结构,导致我们不得不调整了研究对象和目标,后期转向了包括PD-L1、DHHC3、CAC、CD28等跨膜蛋白的结构解析。当前研究结果基本完成了项目的预期计划。目前已发表5篇SCI论文,完成情况良好。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structural Exploration on Palmitoyltransferase DHHC3 from Homo sapiens.
智人棕榈酰转移酶 DHHC3 的结构探索
  • DOI:
    10.3390/polym14153013
  • 发表时间:
    2022-07-26
  • 期刊:
    Polymers
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
  • 通讯作者:
Regulation of PD-L1 through direct binding of cholesterol to CRAC motifs.
通过胆固醇与 CRAC 基序的直接结合来调节 PD-L1
  • DOI:
    10.1126/sciadv.abq4722
  • 发表时间:
    2022-08-26
  • 期刊:
    Science advances
  • 影响因子:
    13.6
  • 作者:
  • 通讯作者:
Expression, purification and characterization of TMCO1 for structural studies
用于结构研究的 TMCO1 表达、纯化和表征
  • DOI:
    10.1016/j.pep.2020.105803
  • 发表时间:
    2021-03-01
  • 期刊:
    PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Zhang, Ningning;Tang, Meng;OuYang, Bo
  • 通讯作者:
    OuYang, Bo
NMR Characterization of Long-Chain Fatty Acylcarnitine Binding to the Mitochondrial Carnitine/Acylcarnitine Carrier.
长链脂肪酰肉碱与线粒体肉碱/酰肉碱载体结合的 NMR 表征
  • DOI:
    10.3390/ijms23094608
  • 发表时间:
    2022-04-21
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
  • 通讯作者:

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    金华

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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