非SLC26A4双等位基因突变的前庭导水管扩大致病机制研究

结题报告

项目介绍

AI项目解读

基本信息

批准号：
81400471
项目类别：
青年科学基金项目
资助金额：
23.0万
负责人：
苏钰
依托单位：
中国人民解放军总医院
学科分类：
H1405.耳鼻咽喉头颈发育相关疾病
结题年份：
2017
批准年份：
2014
项目状态：
已结题
起止时间：
2015-01-01 至2017-12-31

项目参与者：
赵建东；高雪；卢宇；
关键词：
生物信息学非综合征前庭导水管扩大 SLC26A4 目标序列捕获大规模平行测序

项目摘要

Non-syndromic enlarged vestibular aqueduct (EVA) is one of the most common autosomal recessive inner ear malformations and associated with SLC26A4 mutations, which account for 13.7% of patients with hereditary sensorineural hearing loss. All the patients with diallelic mutations in SLC26A4 could be identified with enlarged vestibular aqueduct in temporal bone CT scan. Although there is clear association between EVA and SLC26A4 mutations, previous clinical practice showed that in some EVA patients, SLC26A4 diallelic mutations could not be detected. Rencently, pathogenic CNVs (copy number variation, CNV) in exons were found in only about 30% EVA patients without diallelic SLC26A4 mutaitons. In this study, we applied MPS (Massively parallel sequencing) platforms to explore the existence of other EVA responsible genes and to enrich the pathogeneis of the EVA. Our result will provide theoretical basis for clinical patient management, genetic counseling, molecular diagnosis, and development of advanced therapeutic strategies.

非综合征性前庭水管扩大(EVA)是一种最常见的常染色体隐性遗传性内耳畸形，约占遗传性感音神经性聋的13.7%，与SLC26A4基因突变关系密切。SLC26A4基因双等位基因致病性突变患者均可得到影像学的验证。虽然二者关系密切，但国内外研究均发现在相当一部分EVA患者中未能找到SLC26A4基因突变或仅找到一个单等位基因突变。目前我课题组发现约30%非SLC26A4的双等位基因突变的EVA患者中存在致病性外显子拷贝数变异(CNV)，但仍然有约70%左右的该类患者不能明确病因。为了进一步明确这部分病人的致病机理，探索在EVA的发病中是否存在SLC26A4基因编码蛋白功能相关基因或其他遗传因素的协同作用，我们拟将大规模平行测序(MPS)新技术平台应用于非SLC26A4的双等位基因突变的EVA患者的基因检测，结果或有助于解决该患者群的遗传咨询困境，为EVA患者的遗传咨询和产前诊断提供可靠依据。

结项摘要

非综合征性前庭水管扩大(EVA)是一种最常见的常染色体隐性遗传性内耳畸形，约占遗传性感音神经性聋的13.7%，与SLC26A4基因突变关系密切。SLC26A4基因双等位基因致病性突变患者均可得到影像学的验证。虽然二者关系密切，但国内外研究均发现在相当一部分EVA患者中，未能找到SLC26A4基因突变或仅找到一个单等位基因突变。目前我课题组发现约30%非SLC26A4的双等位基因突变的EVA患者中存在致病的外显子拷贝数变异，但是仍然有约70%左右的非SLC26A4双等位基因突变的EVA患者不能明确病因。为了进一步明确这部分病人的致病机理，更好的与临床应用接轨，课题组与迈基诺公司合作改进了实验方法，设计了SLC26A4 基因全序列检测芯片，对新收集的131例未明确诊断的EVAS患者进行SLC26A4 基因全序列检测，49例患者存在致病性CNVs（12种），其中8种CNVs可鉴定两端断点，4种可鉴定一端断点。选取了3个影像学明确符合EVAS但上述各种检测未发现致病突变及结构变异患者，送全外显子组测序，目前结果尚未分析结束。利用此研究结果开展了临床遗传咨询及产前诊断：1个CNVs遗传性耳聋家庭实施PGD成功保障听力正常后代出生，为1个CNVs遗传性耳聋家庭实施产前诊断成功预测胎儿听力前庭状态。通过本课题研究发现，听觉前庭基因组致病拷贝数变异（CNVs）可能是提高分子确诊率的关键之一。课题对不能明确分子病因的大前庭水管综合征病例进行SLC26A4基因全序列检测，计算拷贝数系数分析断裂点，鉴定致病CNVs，总结其系统研究策略；同时对未能发现致病原因的EVA进行进一步的研究，探索在的发病中是否存在SLC26A4基因编码蛋白功能相关基因或其他遗传因素的协同作用，目前已取得显著成果，为解决该患者群的遗传咨询困境及产前诊断提供可靠依据。