一个新克隆的长链非编码RNA调控肝细胞癌增殖的机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81402009
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1805.肿瘤表观遗传
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most common and lethal types of malignant tumors in China. Recently, using RNA-Sequencing (RNA-Seq) strategies based on next-generation sequencing (NGS) technologies, we sequenced the transcriptome of HCC cells and cloned a new long non-coding RNA (lncRNA) gene located on chromosome 11q13.1. This lncRNA is up-regulated in HCC cells and is associated with poor HCC prognosis. Inhibition of this lncRNA in HCC cells using shRNAs could suppress the proliferation of these tumor cells. Furthermore, this lncRNA is located in a high-frequency amplification region of the HCC genome and is only 150 kb from the important oncogene CCND1, which encodes the cyclin D1 protein. Preliminary data show that expression of this lncRNA is positively correlated with expression of CCND1. In the proposed project, we will explore potential causes for the up-regulation of this novel lncRNA in HCC cells, we will examine the regulatory relationship between this lncRNA and CCND1, and we will identify the downstream signaling pathways that affect HCC proliferation. Together, these experiments will help elucidate the molecular mechanisms linking this novel lncRNA to HCC initiation and development. Achieving the goals in this proposal will provide new experimental data for etiological studies, new molecules for use as prognostic and diagnostic markers, and new targets for novel HCC therapies.
肝细胞癌是我国发病率和病死率最高的恶性肿瘤之一。最近我们通过新一代测序技术对肝细胞癌的RNA进行大规模测序(RNA-Seq)在染色体11q13.1区域发现并克隆了一个新的长链非编码RNA(lncRNA)基因,已初步证实该lncRNA在肝癌中表达上调,且与肝癌预后相关。利用shRNA在肝癌细胞中干扰该lncRNA的表达可抑制肝癌细胞的增殖。该lncRNA位于肝癌基因组高频扩增区域,距重要瘤基因CCND1(编码cyclinD1)仅150Kb,我们初步证实该lncRNA与CCND1的表达相关。本项目拟进一步探讨该lncRNA在肝癌中表达上调的可能原因,它与CCND1间的调控关系及它调控肝癌细胞增殖所涉及的下游信号通路,从而初步阐明这一新克隆lncRNA分子在肝癌发生发展中的作用机制。本项目的完成将为肝癌的病因发病学提供新的实验资料,并提供新的肝癌治疗靶点及诊断和预后分子标记。

结项摘要

肝细胞癌是我国发病率和病死率最高的恶性肿瘤之一。我们通过新一代测序技术对肝细胞癌的RNA进行大规模测序(RNA-Seq)在染色体11q13.1区域发现并克隆了一个新的长链非编码RNA(lncRNA)基因,已初步证实该lncRNA在肝癌中表达上调,且与肝癌预后相关。利用shRNA在肝癌细胞中干扰该lncRNA的表达可抑制肝癌细胞的增殖。该lncRNA位于肝癌基因组高频扩增区域,距重要瘤基因CCND1(编码cyclinD1)仅150Kb,我们初步证实该lncRNA与CCND1的表达相关,并初步探讨了该lncRNA在肝癌中表达上调的可能原因,它与CCND1间的调控关系及它调控肝癌细胞增殖所涉及的下游信号通路,从而初步阐明了这一新克隆lncRNA分子在肝癌发生发展中的作用机制。本项目的完成为肝癌的病因发病学提供新的实验资料,并提供了新的肝癌治疗靶点及诊断和预后分子标记。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Cloning and Functional Characterization of a Novel Long Non-coding RNA Gene Associated With Hepatocellular Carcinoma
与肝细胞癌相关的新型长非编码 RNA 基因的克隆和功能表征
  • DOI:
    10.3724/sp.j.1206.2012.00613
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Progress in Biochemistry and Biophysics
  • 影响因子:
    0.3
  • 作者:
    Tang Ke;Wei Fang;Bo Hao;Huang Hong-Bin;Zhang Wen-Ling;Gong Zhao-Jian;Li Xia-Yu;Song Ya-Li;Liao Qian-Jin;Peng Shu-Ping;Xiang Juan-Juan;Zhou Ming;Ma Jian;Li Xiao-Ling;Xiong Wei;Li Yong;Zeng Zhao-Yang;Li Gui-Yuan
  • 通讯作者:
    Li Gui-Yuan
Identification of candidate biomarkers for the early detection of nasopharyngeal carcinoma by quantitative proteomic analysis
通过定量蛋白质组分析鉴定鼻咽癌早期检测的候选生物标志物
  • DOI:
    10.1016/j.jprot.2014.06.025
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Journal of Proteomics
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Yang Jing;Zhou Ming;Zhao Ran;Peng Shuping;Luo Zhaohui;Li Xiayu;Cao Li;Tang Ke;Ma Jian;Xiong Wei;Fan Songqing;Schmitt David C.;Tan Ming;Li Xiaoling;Li Guiyuan
  • 通讯作者:
    Li Guiyuan
Upregulated long non-coding RNA AFAP1-AS1 expression is associated with progression and poor prognosis of nasopharyngeal carcinoma
长链非编码RNA AFAP1-AS1表达上调与鼻咽癌进展和不良预后相关
  • DOI:
    10.1111/nph.14990
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Bo Hao;Gong Zhaojian;Zhang Wenling;Li Xiayu;Zeng Yong;Liao Qianjin;Chen Pan;Shi Lei;Lian Yu;Jing Yizhou;Tang Ke;Li Zheng;Zhou Yanhong;Zhou Ming;Xiang Bo;Li Xiaoling;Yang Jianbo;Xiong Wei;Li Guiyuan;Zeng Zhaoyang
  • 通讯作者:
    Zeng Zhaoyang
CD90 is upregulated in gastric cancer tissues and inhibits gastric cancer cell apoptosis by modulating the expression level of SPARC protein
CD90在胃癌组织中表达上调并通过调节SPARC蛋白表达水平抑制胃癌细胞凋亡
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Oncology Reports
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Zhu Guang Chao;Gao Lu;He Junyu;Long Yuehua;Liao Shan;Wang Haiyun;Li Xujuan;Yi Wei;Pei Zhen;Wu Minghua;Xiang Juanjuan;Peng Shuping;Ma Jian;Zhou Ming;Zeng Zhaoyang;Xiang Bo;Xiong Wet;Tang Ke;Cao Li;Li Xiaoling;Li Guiyuan;Zhou Yanhong
  • 通讯作者:
    Zhou Yanhong
SPLUNC1 is associated with nasopharyngeal carcinoma prognosis and plays an important role in all-trans-retinoic acid-induced growth inhibition and differentiation in nasopharyngeal cancer cells
SPLUNC1与鼻咽癌预后相关,在全反式维A酸诱导的鼻咽癌细胞生长抑制和分化中发挥重要作用
  • DOI:
    10.1111/febs.13020
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    FEBS Journal
  • 影响因子:
    5.4
  • 作者:
    Zhang Wenling;Zeng Zhaoyang;Wei Fang;Chen Pan;Schmitt David C.;Fan Songqing;Guo Xiaofang;Liang Fang;Shi Lei;Liu Zixin;Zhang Zuping;Xiang Bo;Zhou Ming;Huang Donghai;Tang Ke;Li Xiaoling;Xiong Wei;Tan Ming;Li Guiyuan;Li Xiayu
  • 通讯作者:
    Li Xiayu

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其他文献

High-voltage direct-current circuit breaker
高压直流断路器
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015-09-21
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    顾永超;董贺贺;查燚;王飞宇;唐珂;程申
  • 通讯作者:
    程申
硝基还原酶结构域蛋白1在大鼠睾丸组织中特异性高表达在人类睾丸癌中表达下调(英文)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    生物化学与生物物理进展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    唐珂;郑盼;向波;李桂源
  • 通讯作者:
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马铃薯淀粉代谢相关基因及其顺式调控元件的分子研究进展
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    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    曾子贤
Pretreatment Effect on Ceria-Supported Gold Nanocatalysts for CO Oxidation:Importance of the Gold– Ceria Interaction
预处理对二氧化铈负载的金纳米催化剂 CO 氧化的影响:金与二氧化铈相互作用的重要性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Energy Technology
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    任雨晴;唐珂;魏璟婧;杨红晓;魏慧英;杨延钊
  • 通讯作者:
    杨延钊
Inluence of chitosan on the microstructured Au/CeO2 catalyst: An enhanced catalytic performance for CO oxidation
壳聚糖对微结构 Au/CeO2 催化剂的影响:增强 CO 氧化催化性能
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    catalysis Letters
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    马雪芹;唐珂;刘伟;朱文双;王舒平;郭永华;杨红晓;郭今心;杨延钊
  • 通讯作者:
    杨延钊

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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