面向大数据的语义计算框架及在生物医学信息中的应用研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    61473260
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    84.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    F0607.知识表示与处理
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

More advanced and intelligent big data processing needs semantic technologies urgently. However, current big data platforms lack the capability of processing data semantics. The principal goal of the project is to develop a semantic computing framework geared toward typical characteristics of big data applications, and foster its application in particular domains such as biomedical informatics. Specifically, we consider three main problems including: a) How to balance the expressiveness of data semantics and scalability of data parallelism? b) How to discover deep semantic relations from multi-scale big data? c) How to enable real time semantic interaction with big data? The research consists of four sub-topics including: a) Semantic model for big data; b) Cross-boundaries and multi-scale semantic discovery from big data; c) Elastic and scalable engine for big semantic graph storage and query interactions; d) Applications in biomedical knowledge discovery and biomedical semantic network processing. The key innovations of the project lie in three aspects: a) A light-weight semantic model for big data; b) Multi-scale semantic discovery for big data; c) Evolvable storage and real time query engine for big semantic graph.
大数据的智能处理迫切需要语义技术的支持,然而现有的大数据技术平台都相对缺乏数据语义的处理能力。本项目主要目标是研究面向大数据的语义计算框架,并推动其在生物医学大数据等领域的应用。具体主要围绕三个科学问题:a)怎样平衡数据的语义表达和弹性可扩展的数据处理能力?b)怎样实现跨边界跨尺度的大数据语义挖掘与知识发现?c)怎样实现更加智能的大数据自然语义交互。并拟开展四个方面的研究,包括:a)研究面向大数据特征的语义表达框架;b)研究跨边界、跨尺度的大数据语义发现方法;c)研究弹性可扩展的语义大图处理引擎及高实时的语义交互技术;d)结合生物医学和健康领域的大数据处理开展应用创新研究。同时,形成三个方面的关键技术创新:a)轻语义表达模型;b)跨尺度语义挖掘;c)可演化语义大图存储与实时语义交互。随着图模型在大数据应用中日益重要,本项目的研究有助于提升在大数据核心技术领域的竞争力。

结项摘要

大数据的智能处理迫切需要语义技术的支持,然而现有的大数据技术平台都相对缺乏数据 语义的处理能力。本项目主要目标是研究面向大数据的语义计算框架,并推动其在生物医 学大数据等领域的应用。具体主要围绕三个科学问题:a)怎样平衡数据的语义表达和弹性 可扩展的数据处理能力?b)怎样实现跨边界跨尺度的大数据语义挖掘与知识发现?c)怎样 实现更加智能的大数据自然语义交互。并拟开展四个方面的研究,包括:a)研究面向大数 据特征的语义表达框架;b)研究跨边界、跨尺度的大数据语义发现方法;c)研究弹性可扩 展的语义大图处理引擎及高实时的语义交互技术;d)结合生物医学和健康领域的大数据处 理开展应用创新研究。同时,形成三个方面的关键技术创新:a)轻语义表达模型;b)跨尺 度语义挖掘;c)可演化语义大图存储与实时语义交互。随着图模型在大数据应用中日益重 要,本项目的研究有助于提升在大数据核心技术领域的竞争力。本项目所取得主要成果在于弹性语义图处理和大数据语义发现两个方面。弹性语义图处理对于大规模的知识图谱的处理性能比较关键,特别是在流式语义数据情况下更具挑战。本项目重点在流式语义图的弹性处理方面取得了研究成果。此外,大数据的语义发现对于从粗糙的大数据中抽取和构建大规模的知识图谱至关重要,本项目也在从文本大数据中抽取语义关系等方面取得了一定的研究成果。随着知识图谱和语义计算技术在搜索、问答和大数据分析等领域得到越来越多的应用,本项目所研究的有关大规模的语义图谱处理引擎,以及大数据语义发现等技术在医疗、电商、金融等多个领域都具备较好的应用前景。本项目总共发表相关学术论文 23篇,获得授权专利7项,培养博士生4名,硕士生8名,本科生15名。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(12)
专利数量(7)
Forecasting Public Transit Use by Crowdsensing and Semantic Trajectory Mining: Case Studies.
通过群体感知和语义轨迹挖掘预测公共交通使用情况:案例研究。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    ISPRS Int. J. Geo-Information
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ningyu Zhang;Huajun Chen;Xi Chen;Jiaoyan Chen
  • 通讯作者:
    Jiaoyan Chen
Large-Scale Real-Time Semantic Processing Framework for Internet of Things
物联网大规模实时语义处理框架
  • DOI:
    10.1155/2015/365372
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    IJDSN. International Journal of Distributed Sensor Networks
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Xi Chen;Huajun Chen;Ningyu Zhang;Jue Huang;Wen Zhang
  • 通讯作者:
    Wen Zhang
ELM Meets Urban Big Data Analysis: Case Studies.
ELM 与城市大数据分析的结合:案例研究。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Comp. Int. and Neurosc.
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ningyu Zhang;Huajun Chen;Xi Chen;Jiaoyan Chen
  • 通讯作者:
    Jiaoyan Chen
Semantic Framework of Internet of Things for Smart Cities: Case Studies
智慧城市物联网语义框架:案例研究
  • DOI:
    10.3390/s16091501
  • 发表时间:
    2016-09-14
  • 期刊:
    Sensors (IF: 2.964)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhang N;Chen H;Chen X;Chen J
  • 通讯作者:
    Chen J

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其他文献

中医药文献语义关系图发现
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    计算机科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陶金火;陈华钧;胡雪琴
  • 通讯作者:
    胡雪琴
基于知识协同微调的低资源知识图谱补全方法.
  • DOI:
    10.3354/meps11780
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    软件学报. 2022. (CCF A).
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张宁豫;谢辛;陈想;陈华钧
  • 通讯作者:
    陈华钧
Modern bioinformatics meets traditional Chinese medicine
现代生物信息学遇上传统中医
  • DOI:
    10.1093/bib/bbt063
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Briefings in Bioinformatics
  • 影响因子:
    9.5
  • 作者:
    陈华钧
  • 通讯作者:
    陈华钧
一种面向链接数据进行语义关系挖掘的多智能体框架
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Journal of Zhejiang University-Science C(Computers and Electronics)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈华钧;于彤;郑清照;顾佩钦;张宇
  • 通讯作者:
    张宇
A multi-agent framework for mining semantic relations from linked data.
用于从链接数据中挖掘语义关系的多代理框架。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Journal of Zhejiang University-Science C(Computers and Electronics)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈华钧
  • 通讯作者:
    陈华钧

其他文献

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陈华钧的其他基金

面向复杂推理的可解释知识图谱技术及在政府治理中的应用研究
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面向商务大数据的知识图谱引擎构建方法与关键技术研究
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时空知识图谱的表示模型与计算方法研究
  • 批准号:
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    2016
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    64.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
社会网络空间的语义计算模型与方法
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    32.0 万元
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    面上项目
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  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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相似海外基金

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知道了

AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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