环状RNA cir-BANP调控结直肠癌细胞生物学行为的分子机制及其临床应用

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基本信息

  • 批准号:
    81601843
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    18.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2605.分子生物学检验
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Circular BANP (cir-BANP) was overexpressed significantly in colorectal cancer (CRC) tissue with unknown function, which was identified from differential circular RNA expression profile between colorectal cancer tissues and adjacent normal tissues. Our previous study revealed that underexpression of cir-BANP could induce G1 phase arrest and reduction of cell proliferation and clone formation in colorectal cancer cell. According to the bioinformatic analyses and research results, we hypothesized that as a ceRNA, cir-BANP could relieve the miR-500a-3p-induced inhibition of CDK6 and affect cell cycle and proliferation by combining with miR-500a-3p competitively. We sought to confirm the biological functions and molecular mechanisms of cir-BANP in vitro and vivo through strategies of upregulation and downregulation and molecular biological techniques, such as pull-down assay. Additionally, clinical application for cir-BANP as a potential prognostic factor for CRC was also been determined. To date, there are no reports about cir-BANP function respecting regulating cell cycle and proliferation in CRC. This study might provide a potential novel target for CRC treatment, and open a door to a new era in molecular oncology.
cir-BANP是采用芯片筛选结直肠癌组织和癌旁正常对照组织差异环状RNA(circRNA)时获得、显著高表达于结直肠癌组织、功能未知的一个环状RNA。前期研究发现,干扰cir-BANP表达可导致结直肠癌细胞G1期阻滞、细胞增殖和克隆形成受抑制。根据生物信息学分析和预实验结果,我们提出cir-BANP的作用机制假说:cir-BANP可作为一种竞争性内源RNA竞争结合miR-500a-3p,解除miR-500a-3p对CDK6的抑制作用,从而发挥调控细胞周期和增殖的生物学功能。本课题拟采用沉默和过表达策略,结合pull-down 实验等分子生物学技术体内体外论证cir-BANP的生物学功能和分子机制,并分析cir-BANP作为结直肠癌预后因子的临床应用价值。有关cir-BANP调控结直肠癌细胞周期和增殖的作用和机制国内外未见报道,本研究有源头创新性,可为结直肠癌治疗提供新的潜在靶标。

结项摘要

结直肠癌(CRC)是世界范围内高发的恶性肿瘤之一,早期结直肠癌的5年生存率可达90.1%,但对于存在远处转移的患者生存率只有11.7%。为了能改善患者的疗效和预后情况,更深入的理解结直肠癌发生的分子机制非常重要。. 环状RNA(circRNAs)被报道是一种新的非编码RNA,5’和3’首尾相连。越来越多的文献报道环状RNA可作为miRNA海绵从而调控基因的表达。有关结直肠癌的环状表达谱和环状RNA在CRC发生和发展中的作用仍不是很清楚。. 为了阐明这个问题,我们采用环状RNA芯片分析结直肠癌组织和癌旁对照组织的环状RNA表达差异。结果发现2608条人类CircRNA中与正常对照相比分别有136条高表达和243条低表达(>2倍)。我们发现其中一个CircRNA circ-BANP在结直肠癌组织中显著高表达(>25.9)。同时,circ-BANP在癌组织和癌旁对照组织中表达一致性好,因此,我们选择circ-BANP作为进一步研究对象。. 利用反向引物,我们采用RT-PCR检测了35例结直肠癌组织和癌旁组织中circ-BANP的表达。同样,结果发现circ-BANP在癌组织中高表达。我们还分析了circ-BANP的表达和35例结直肠癌病理特征的关系。但是发现circ-BANP的表达与患者病理学临床资料无显著关系。与PCR的结果相似,荧光原位杂交实验显示相比于正常对照,circ-BANP在结直肠癌组织中过表达。. 接下来,我们打算探寻circ-BANP在结直肠癌细胞中的生物学功能。使用siRNA沉默circ-BANP,circ-BANP的表达受到抑制。我们发现相比阴性对照组,si-circ-BANP组细胞增殖受到显著抑制。为了进一步验证circ-BANP对CRC细胞增殖的影响,我们做了平板克隆形成实验。和预期一致,siRNA干扰后HCT116和HT29细胞克隆形成能力显著降低。采用双萤光素酶报告基因实验、pull-down和原位杂交共定位实验证实circ-BANP具有miR-874海绵功能,可通过吸附miR-874发挥调控结直肠癌细胞增殖的功能。. 综上,本项目研究了circ-BANP发挥调控结直肠癌细胞增殖的生物学功能和机制,本研究将为结直肠癌诊断和和治疗提供新的潜在靶标。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Novel exosomal miR-46146 transfer oxaliplatin chemoresistance in colorectal cancer
新型外泌体 miR-46146 传递结直肠癌奥沙利铂化疗耐药性
  • DOI:
    10.1007/s12094-019-02237-1
  • 发表时间:
    2019-11
  • 期刊:
    Clinical and Translational Oncology
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Xu Yijun;Zhu Mingchen
  • 通讯作者:
    Zhu Mingchen
Circular BANP, an upregulated circular RNA that modulates cell proliferation in colorectal cancer
Circular BANP,一种上调的环状 RNA,可调节结直肠癌中的细胞增殖
  • DOI:
    10.1016/j.biopha.2016.12.097
  • 发表时间:
    2017-04-01
  • 期刊:
    BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
  • 影响因子:
    7.5
  • 作者:
    Zhu, Mingchen;Xu, Yijun;Yan, Feng
  • 通讯作者:
    Yan, Feng

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其他文献

血浆 miR-199a-5p 与 miR-200c-3p 在胃腺癌中的临床应用。
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  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    中华检验医学杂志
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  • 作者:
    唐锦莉;严枫;王晓明;葛梦圆;桂珍;李金昌;竺明晨
  • 通讯作者:
    竺明晨
血浆长链非编码RNA 肺腺癌相关转录本1在乳腺癌中的表达及临床意义
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  • 发表时间:
    2018
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    中华检验医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴钧;余丽莉;王晓明;李金昌;竺明晨;严枫
  • 通讯作者:
    严枫

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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