粗糙脉孢菌中异染色质基因表达调控分子机制的研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31771383
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Heterochromatin is a unique type of chromatin that is characterized by its transcriptionally repressed state and highly condensed structure. The assembly of heterochromatin is kept under tight regulation, and play important roles in many cellular processes. The heterochromatin always results in neighbor gene silencing, however another genes are positively regulated by its proximal heterochromatin region named heterochromatic genes.Our studies showed that the highest expression of methionine synthesae (met-8) gene was required in its proximal 50 kb AT-rich heterochromatin in Neurospora crassa. In this study, by means of a diverse mix of technologies such as biochemistry, molecular genetics, epigenetics, and systematic biology, we are trying to explore the mechanism of heterochromatin formation and how heterochromatin regulates the transcription of heterochromatic genes in Neurospora crassa. Our work will improve our knowledge about heterochromatic gene regulation and provide a novel insight into the heterochromatin functions and epigenetic regulation.
异染色质是一种独特的染色质状态,其结构高度浓缩,且处于转录沉默状态,具有复杂的调控方式及重要的生理功能。异染色质通常造成基因沉默,但也存在一类异染色质基因,其正常的表达依赖于邻近的异染色质。本实验室研究发现甲硫氨酸合成酶基因(met-8)上游存在50-kb异染色质区域,并且该异染色质结构对于维持met-8基因的高转录水平具有重要作用。本项目以粗糙脉孢菌为材料,围绕此独特的生物学现象,结合生物化学、分子遗传学、表观遗传学、系统生物学等多学科研究手段,对异染色质基因表达调控分子机制进行深入探讨。其研究结果不仅可以增进我们对真核生物异染色质基因表达调控的认识,同时也为解析异染色质的新功能及表观遗传学修饰的调控机制开拓了新方向。

结项摘要

基因组上存在很多分散的异染色质区域。这些异染色质区域能够影响附近基因的表达。本课题利用遗传学和生物化学方法,对粗糙脉孢菌受异染色质影响基因转录调控的分子机制进行研究。我们通过突变体筛选得到了CPC1/GCN4、GCN5、CTK复合体、HDA-2复合体、SWR1复合体、类组蛋白转录因子复合体NC2、INO80复合体以及DMM-1等一系列影响异染色质基因转录的调控因子。我们进一步系统地解析了这些调控因子影响基因表达的详细分子机制。这些转录调控因子在动、植物中具有很高的保守型,它们可能通过相似的机制参与动、植物中异染色质基因的调控。因此,我们研究结果对动、植物中异染色质基因转录调控机制的认识具有重要的参考价值。部分研究结果以学术论文的形式发表在Free Radical Biology and Medicine、Environmental Microbiology 、Current Genetics、Nucleic Acids Research等杂志上。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Two dominant selectable markers for genetic manipulation inNeurospora crassa
用于粗糙脉孢菌遗传操作的两个显性选择标记
  • DOI:
    10.1007/s00294-020-01063-1
  • 发表时间:
    2020-08-01
  • 期刊:
    CURRENT GENETICS
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    He, Lingaonan;Guo, Wei;He, Qun
  • 通讯作者:
    He, Qun
The Neurospora RNA polymerase II kinase CTK negatively regulates catalase expression in a chromatin context-dependent manner
脉孢菌 RNA 聚合酶 II 激酶 CTK 以染色质背景依赖性方式负向调节过氧化氢酶表达
  • DOI:
    10.1111/1462-2920.14821
  • 发表时间:
    2019-10-21
  • 期刊:
    ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    Duan, Jiabin;Liu, Qingqing;He, Qun
  • 通讯作者:
    He, Qun
NC2 complex is a key factor for the activation of catalase-3 transcription by regulating H2A.Z deposition
NC2 复合物是通过调节 H2A.Z 沉积激活过氧化氢酶 3 转录的关键因素
  • DOI:
    10.1093/nar/gkaa552
  • 发表时间:
    2020-09-04
  • 期刊:
    NUCLEIC ACIDS RESEARCH
  • 影响因子:
    14.9
  • 作者:
    Cui, Guofei;Dong, Qing;He, Qun
  • 通讯作者:
    He, Qun

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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