基于非编码RNA转录组学对甲状腺相关眼病纤维化的相关基因和信号通路的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81870689
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    57.0万
  • 负责人：
    杨华胜
  • 依托单位：
    中山大学
  • 学科分类：
    H1307.全身疾病眼部表现、眼眶疾病
  • 结题年份：
    2022
  • 批准年份：
    2018
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Orbital fibroblasts (OF) are the key effector cell of thyroid related ophthalmopathy (TAO). OF are activated with adipogenic differentiation (type I) or fibrosis (type II), and patients with fibrosis are tend to suffer from more severe strabismus, decreased vision or even blindness. Therefore, the mechanism of fibrosis of OF is the major cause of TAO. Our previous studies shown that ncRNA (including circRNA and lncRNA) is important in the development of fibrosis for TAO: comparing type I with type II TAO orbital lesions, circRNA /lncRNA were increased by 143/301, and decreased by 102/487; Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes extracted the difference to 15 channels including cGMP-PKG and close connection. Our research intends to clarify the machanism of the effect and regulation of fibrosis by gene expression and the related signal pathway of OF in transcriptome level (including mRNA and ncRNA) in TAO. Our reaseach will provide new ideas and therapeutic targets to the prevention and treatment of TAO.
眼眶成纤维细胞（OF）是甲状腺相关眼病（TAO）病生过程中关键效应细胞，其活化后脂肪分化（I型）或纤维化（II型）,而纤维化患者更易出现严重的斜视、视力下降甚至失明。因此，OF纤维化的机制是TAO发展和结局的关键。预实验发现非编码RNA（ncRNA，包括circRNA、lncRNA）在TAO纤维化的发生发展中起重要作用：I型与II型TAO眼眶病变组织比较，circRNA/lncRNA分别上调143/301个，下调102/487个；KEGG通路注释提取到包括cGMP-PKG、紧密连接等15条通路。本课题拟从转录组（包括mRNA及ncRNA）水平，进行TAO基因表达水平及相关信号通路研究，明确ncRNA通过OF调控TAO纤维化中的相关基因和信号通路。本研究将为TAO的防治提供新的思路和治疗靶点。

结项摘要

背景：甲状腺相关眼病（TAO）临床上可分为I型（脂肪为主型）和II型（肌肉为主型）。目前对于TAO临床分型机制尚不明确，为研究其潜在的分子机制，利用转录组测序技术对不同临床分型TAO的环状RNA(circRNA)的表达谱进行测定。.主要研究内容：收集6对I型和II型TAO患者眼眶结缔组织样本进行高通量RNA测序。用另外3对I型和II型TAO患者眼眶结缔组织样本对差异表达的circRNA和mRNA通过定量的实时聚合酶链反应（qRT-PCR）进行验证。我们使用生物信息学预测构建了一个circRNA-microRNA（miRNA）-mRNA网络。基于差异mRNA表达构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，并通过Cytoscape软件插件确定核心基因。利用功能和通路的富集分析以阐明circRNA功能。通过慢病毒介导的过表达hsa_cir_0007006，利用蛋白印迹法（WB）检测hsa_cir_0007006与COL1A1和MMP2的表达关系。同时，通过WB验证差异表达的通路。.重要结果和关键数据：RNA测序结果提示总共7489个circRNA和15803个mRNA差异表达，相较于I型TAO，II型TAO中94个circRNA表达上调，76个circRNA表达下调；488个mRNA表达上调和138mRNA表达下调。对7个差异表达的circRNA和2个mRNA进行了qRT-PCR验证，与RNA测序数据相符合。竞争性内源性RNA（ceRNA）网络构建包含了7个circRNA、23个miRNA和262个mRNA。功能性富集分析揭示了几条重要的信号通路。过表达hsa_cir_0007006导致COL1A1和MMP2的表达水平降低。松弛素信号通路在两种亚型中差异表达。.科学意义：I型和II型TAO之间存在差异表达的circRNA。hsa_cir_0007006-COL1A1、MMP2-松弛素信号传导通路的调节作用在TAO分型中起着至关重要的作用。可能作为对于TAO诊断和治疗的重要靶点。

项目成果

期刊论文数量（21）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Elevated Immunoglobulin G4 Levels in Patients with Thyroid Eye Disease and Their Clinical Implications
甲状腺眼病患者免疫球蛋白 G4 水平升高及其临床意义
  • DOI：
    10.1167/iovs.61.5.57
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    Investigative Opthalmology & Visual Science
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Huijing Ye;Wei Xiao;Rongxin Chen;Ping Zhang;Lijuan Tang;Jingqiao Chen;Te Zhang;Xian Ji;Lu Shi;Huasheng Yang
  • 通讯作者：
    Huasheng Yang
Intraoperative administration of intravenous flurbiprofen axetil with nalbuphine reduces postoperative pain after orbital decompression: a single-center, prospective randomized controlled trial
术中静脉注射氟比洛芬酯联合纳布啡可减轻眼眶减压术后疼痛：一项单中心、前瞻性随机对照试验
  • DOI：
    10.2147/jpr.s187020
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    Journal of Pain Research
  • 影响因子：
    2.7
  • 作者：
    Huijing Ye;Xiufen Lian;Rongxin Chen;Yanling Zhu;Hongbin Chen;Jingxia Huang;Ling Xie;Wenfang Ma;Huasheng Yang;Wenjun Guo
  • 通讯作者：
    Wenjun Guo
Peripapillary and Macular Vessel Density in Dysthyroid Optic Neuropathy: An Optical Coherence Tomography Angiography Study
甲状腺功能障碍性视神经病变中的视乳头周围和黄斑血管密度：光学相干断层扫描血管造影研究
  • DOI：
    10.1167/iovs.18-25941
  • 发表时间：
    2019-05-01
  • 期刊：
    INVESTIGATIVE OPHTHALMOLOGY & VISUAL SCIENCE
  • 影响因子：
    4.4
  • 作者：
    Zhang, Te;Xiao, Wei;Yang, Huasheng
  • 通讯作者：
    Yang, Huasheng
Increased Dysfunctional and Plastic Regulatory T Cells in Idiopathic Orbital Inflammation.
特发性眼眶炎症中功能失调和塑性调节 T 细胞增加
  • DOI：
    10.3389/fimmu.2021.634847
  • 发表时间：
    2021
  • 期刊：
    Frontiers in immunology
  • 影响因子：
    7.3
  • 作者：
    Chen J;Ye H;Xiao W;Mao Y;Ai S;Chen R;Lian X;Shi L;Wang X;Bi S;Yang S;Ji X;Zhang T;Yang H
  • 通讯作者：
    Yang H
甲状腺相关眼病患者外周血单核细胞亚型比例分布
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    中华实验眼科杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    徐迦南;叶慧菁;陈荣新;陈果;陈静巧;杨华胜
  • 通讯作者：
    杨华胜

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

其他文献

甲状腺相关眼病眼眶减压手术经鼻内镜入路与外部切口入路孰优孰劣
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    中华眼科杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    杨华胜;叶慧菁
  • 通讯作者：
    叶慧菁

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败，请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题，我已根据课题信息分析并撰写以下内容，帮您拓宽课题思路：

AI项目思路

AI技术路线图

杨华胜的其他基金

血浆及脂肪组织巨噬细胞外泌体介导细胞间通讯在甲状腺相关眼病中的作用及机制研究
  • 批准号：
    82371099
  • 批准年份：
    2023
  • 资助金额：
    49 万元
  • 项目类别：
    面上项目
调节性B细胞对甲状腺相关眼病免疫调节作用的机制研究
  • 批准号：
    81670887
  • 批准年份：
    2016
  • 资助金额：
    57.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
单核细胞及其IGF-1R信号通路在甲状腺相关眼病发病机制中作用的研究
  • 批准号：
    81470664
  • 批准年份：
    2014
  • 资助金额：
    70.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者：{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
关闭
close
客服二维码