HIF基因3'UTR区SNP参与胰腺癌HIF-1α表达调控的分子机制及功能研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81302082
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1804.肿瘤遗传与进化
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Pancreatic cancer is a highly aggressive disease with a grim prognosis. HIF-1α expression correlates with clinicopathological parameters of pancreatic cancer, such as tumor's grades, stages and lymph-node metastasis. HIF-1α protein was constitutively expressed in pancreatic cancer tissues and cell lines. The molecular events underlying this remain poorly defined. We have found that Polymorphisms in the hypoxia-inducible factor-1α gene confer susceptibility to pancreatic cancer. MicroRNAs (miRNAs) are evolutionarily conserved small non-coding RNAs that regulate gene expression. MiRNAs play key roles in regulating the translation and degradation of mRNAs through base pairing to partially complementary sites in the 3'UTR of the message. Polymorphisms in 3'UTR of several genes have been reported to affect gene expression, but the mechanism is not fully understood. In this study, we investigated the effect of SNPs, which locate in the 3'UTR of HIF-1α. We want to use the molecular biology experiments to test the regulation mechanisms of the SNP, and evaluation the SNP genotypes, which was a risk genotype for pancreatic cancer development and was also associated with pancreatic cancer clinicopathological parameters and poor survival. This study may provide a new tumor marker or potential target for pancreatic cancer treatment.
胰腺癌是严重危害人类健康的恶性肿瘤。HIF-1α表达水平与胰腺导管腺癌的病理分级、淋巴结转移和不良预后呈正相关,但其在胰腺癌中独特的组成型高表达的机制尚不明确。课题组前期研究发现多个 HIF-1α相关SNP参与胰腺癌HIF-1α表达调控,部分SNP被证明作为胰腺癌易感基因型。近年研究发现micro-RNA是参与细胞内转录后调控的重要分子,靶序列的单核苷酸多态性变异会破坏micro-RNA的结合与转录后调控,影响靶基因的表达。本项目选取胰腺癌乏氧微环境核心调控因子 HIF-1α 3'非编码区micro-RNA靶序列相关SNP,探讨不同等位基因型对胰腺癌细胞HIF-1αmRNA及蛋白表达水平的影响,进一步探索micro-RNA相关SNP对胰腺癌细胞恶性生物学行为的影响,并通过分子生物学和细胞学功能实验分析其作用模式和调控机制,这些研究将为探索胰腺癌分子标志物和寻找治疗靶标提供有益帮助。

结项摘要

胰腺癌是严重危害人类健康的恶性肿瘤。HIF-1α表达水平与胰腺导管腺癌的不良预后呈正相关,但其在胰腺癌中独特的组成型高表达的机制尚不明确。课题组前期研究发现多个HIF-1α相关SNP参与胰腺癌HIF-1α表达调控,部分SNP被证明作为胰腺癌易感基因型。近年研究发现micro-RNA是参与细胞内转录后调控的重要分子,靶序列的单核苷酸多态性变异会破坏micro-RNA的结合与转录后调控,影响靶基因的表达。本项目选取胰腺癌乏氧微环境核心调控因子HIF-1α3’非编码区micro-RNA靶序列相关SNP,探讨不同等位基因型对胰腺癌细胞HIF-1αmRNA及蛋白表达水平的影响,进一步探索micro-RNA相关SNP对胰腺癌细胞恶性生物学行为的影响,并通过分子生物学和细胞学功能实验分析其作用模式和调控机制,为探索胰腺癌分子标志物和寻找治疗靶标提供有益帮助。HIF-1α rs2057482单核苷酸多态性(SNP)在410个PDAC病例和490个健康对照中进行基因分型。与CT / TT等位基因组相比,CC基因型SNP HIF-1α与PDAC风险(OR = 1.719,95%CI:1.293-2.286)和较短的总体存活率(OS,P <0.0001)显着相关。 rs2057482的C / T变体(位于HIF-1α中的miR-199a结合位点附近的SNP)可以导致miR-199a对HIF-1α的差异调节。具体来说,rs2057482的C等位基因削弱了miR-199a诱导的HIF-1α表达对mRNA和蛋白质水平的抑制。在PDAC组织中,具有rs2057482-CC基因型的个体比具有rs2057482-CT / TT基因型的个体表达显着更高水平的HIF-1α蛋白(P <0.0001)。 SNP HIF-1α的CC基因型和增加的HIF-1α表达与PDAC患者的OS更短显着相关。通过TNM分期,分化等级和CA19-9水平调节后,SNP HIF-1α和HIF-1α表达均对OS具有高度显着性(P <0.0001)。总结起来讲,我们的研究表明宿主遗传变异可以扰乱miR-199a / HIF-1α调节环的调节,并改变PDAC风险和不良预后,rs2057482-CC基因型增加对PDAC的易感性并与癌症进展相关,这提示种系遗传变异对调节HIF-1α基因和PDAC风险中miRNA基因调控环节稳态的重要性。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Inhibition of HIF-1α by PX-478 enhances the anti-tumor effect of gemcitabine by inducing immunogenic cell death in pancreatic ductal adenocarcinoma.
PX-478 对 HIF-1α 的抑制通过诱导胰腺导管腺癌中的免疫原性细胞死亡来增强吉西他滨的抗肿瘤作用。
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.2948
  • 发表时间:
    2015-02-10
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhao T;Ren H;Jia L;Chen J;Xin W;Yan F;Li J;Wang X;Gao S;Qian D;Huang C;Hao J
  • 通讯作者:
    Hao J
Arsenic trioxide plus PX-478 achieves effective treatment in pancreatic ductal adenocarcinoma
三氧化二砷联合PX-478有效治疗胰腺导管腺癌
  • DOI:
    10.1016/j.canlet.2016.05.016
  • 发表时间:
    2016-08-10
  • 期刊:
    CANCER LETTERS
  • 影响因子:
    9.7
  • 作者:
    Lang, Mingxiao;Wang, Xiuchao;Ren, He
  • 通讯作者:
    Ren, He
Co-delivery of HIF1alpha siRNA and gemcitabine via biocompatible lipid-polymer hybrid nanoparticles for effective treatment of pancreatic cancer.
通过生物相容性脂质聚合物混合纳米颗粒共同递送 HIF1α siRNA 和吉西他滨,有效治疗胰腺癌。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Biomaterials
  • 影响因子:
    14
  • 作者:
    Ren, He;Chen, Jing;Nie, Guangjun;Hao, Jihui
  • 通讯作者:
    Hao, Jihui
Single nucleotide polymorphism in the microRNA-199a binding site of HIF1A gene is associated with pancreatic ductal adenocarcinoma risk and worse clinical outcomes.
HIF1A 基因 microRNA-199a 结合位点的单核苷酸多态性与胰腺导管腺癌风险和较差的临床结果相关
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.7263
  • 发表时间:
    2016-03-22
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang X;Ren H;Zhao T;Ma W;Dong J;Zhang S;Xin W;Yang S;Jia L;Hao J
  • 通讯作者:
    Hao J
LASP1 is a HIF1α target gene critical for metastasis of pancreatic cancer.
LASP1 是 HIF1α 靶基因,对胰腺癌转移至关重要
  • DOI:
    10.1158/0008-5472.can-14-2040
  • 发表时间:
    2015-01-01
  • 期刊:
    Cancer research
  • 影响因子:
    11.2
  • 作者:
    Zhao T;Ren H;Li J;Chen J;Zhang H;Xin W;Sun Y;Sun L;Yang Y;Sun J;Wang X;Gao S;Huang C;Zhang H;Yang S;Hao J
  • 通讯作者:
    Hao J

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    --
  • 作者:
    王秀超;李逢战;王紫微;刘旭峰
  • 通讯作者:
    刘旭峰

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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