纳米操作机器人探测癌症分子靶向药物耐药性差异机理与统计优化分析

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    61903265
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    F0309.机器人学与智能系统
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

In the targeted therapy for cancer, due to individual differences, the same therapeutic schedule has different curative effects on different patients. What’s more, the same schedule may have toxic and side effect on some patients. Therefore, this difference has become a huge challenge for clinical therapy of cancer. Aiming at this problem, taking the targeted therapy for lymphoma as the research object, in this project, the research of bidirectional molecular force of CD20 monoclonal antibody based on nanomanipulation robots will be proposed. The effectiveness model between the molecular binding forces (CD20 molecular-drug and NK cell target protein-drug) and the curative effect will be built. Moreover, the resistance mechanism for targeted drugs and the ADCC action mechanism will be illuminated. Furthermore, a drugs combination optimization algorithm based on Markov chain will be proposed to establish the coupling model between the targeted therapy schemes (different drugs, concentrations, and time intervals) and the curative effect, so as to realize the global search for the optimal scheme. The research contents include: efficient cells separation methods cancer cells, NK cells and red blood cells based on robot technology; performance evaluation of CD20 monoclonal antibody at single molecules level based on molecular bidirectional action mechanism; drugs combination optimization method based on Markov chain. In this project, a drug resistance analysis and prediction method based on single molecule and single cell for the targeted therapy for cancer will be built. And a formulation of optimal drugs combination therapy scheme will be developed in this study. Therefore, this project should be of great significance for the development of clinical personalized therapy and drug research.
癌症的靶向治疗中,由于个体差异,同一治疗方案对不同患者存在不同疗效,甚至对一些患者有副作用,这给临床治疗带来了极大的困难。针对该问题,本申请以淋巴癌靶向治疗为研究对象,提出基于纳米操作机器人的CD20单抗靶向药物双向分子力研究方法,建立癌细胞CD20分子-药物、NK细胞靶点蛋白-药物这两种分子间结合力与疗效之间的效能模型,阐明靶向药物耐药性机理及ADCC作用机制;提出基于Markov链的药物组合优化算法,建立靶向治疗方案(不同药物种类、浓度、用药时间间隔)与疗效偶联模型,实现最优方案全局搜索。研究内容包括:机器人化癌细胞、NK细胞、血红细胞高效分离方法;基于双向机制的单分子水平CD20单抗生物效能评估;基于Markov链的药物组合优化方法。通过本研究,将发展一种基于单分子、单细胞的癌症靶向治疗耐药性分析预测方法,及最优药物组合治疗方案制定手段,对临床“个性化”治疗及新药研发具有重要意义。

结项摘要

癌症的靶向治疗中,由于个体差异,同一治疗方案对不同患者存在不同疗效,甚至对一些患者有副作用,这给临床治疗带来了极大的困难。本项目面向癌症靶向治疗中所面临的实际问题,以开展纳米操作机器人在癌症靶向治疗中的应用为核心,在单分子/单细胞操纵、检测与数理统计分析、建模优化等方面开展了相关理论与技术研究。围绕癌症靶向治疗中所面临的个体差异性研究挑战,提出了活体细胞电液动力学模型,实现了淋巴瘤细胞、血红细胞、及NK细胞的免标记高效无损分离,解决了传统基于免疫荧光标记方法所面临的分离效率低、以及造成细胞损伤的难题,为多种混合细胞高速分离的临床实现提供技术基础;开展了具有双向机制的分子力测试方法研究,实现了CD20单抗靶向药物的ADCC机制涉及到的CD20-药物和FcγRIIIa-药物两种分子结合力的精准测定,为进一步阐明单抗药物的作用机制,以及揭示淋巴瘤靶向药物产生耐药性差异机理奠定基础;建立了基于Markov链的靶向药物组合优化模型,开展了靶向治疗方案(不同药物种类、浓度、用药时间间隔)与疗效偶联关系研究,实现了最优方案快速全局搜索,为临床靶向治疗提供了新的可以借鉴的潜在方案。.将上述技术应用于医药研究,可在单细胞/单分子尺度上探索药物的耐药性机理,这不仅可以提高药物的靶向性和适用性,还能够显著缩短新药的研发周期和成本;在重大疾病临床治疗(也包括淋巴癌治疗以外的靶向治疗)应用中,可以在单分子、单细胞、多细胞尺度上开展患者对不同靶向药物耐药性的前期预测,从而为实现个性化诊疗、提高治疗功效、减小药物毒副作用、缩短治疗周期奠定必要的理论与技术基础。该项目对提升我国医药研发水平、提高临床治疗效果、推动生物医学、机器人学等多学科交叉领域的发展具有重要的科学意义和潜在的应用价值。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(10)
会议论文数量(2)
专利数量(2)
In Situ High-Resolution AFM Imaging and Force Probing of Cell Culture Medium-Forming Nanogranular Surfaces for Cell Growth
用于细胞生长的细胞培养基形成纳米颗粒表面的原位高分辨率 AFM 成像和力探测
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    IEEE Transactions on NanoBioscience
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Mi Li;Ning Xi;Yuechao Wang;Lianqing Liu
  • 通讯作者:
    Lianqing Liu
Multiparametric atomic force microscopy imaging of single native exosomes
单个天然外泌体的多参数原子力显微镜成像
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Acta Biochimica et Biophysica Sinica
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Mi Li;Xinning Xu;Ning Xi;Wenxue Wang;Xiaojing Xing;Lianqing Liu
  • 通讯作者:
    Lianqing Liu
Nanoscale imaging and mechanical analysis of viral infection on cells by atomic force microscopy
原子力显微镜对细胞病毒感染的纳米级成像和机械分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Acta Biochimica et Biophysica Sinica
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Bin Liu;Dan Dang;Yang Yang;Peng Yu;Mi Li
  • 通讯作者:
    Mi Li
Dynamic Characterization of Single Cells Based on Temporal Cellular Mechanical Properties
基于时间细胞力学特性的单细胞动态表征
  • DOI:
    10.1109/tnb.2021.3136198
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    IEEE Transactions on NanoBioscience
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Shuang Ma;Xiaofang Zhang;Dan Dang;Wenxue Wang;Yuechao Wang;Lianqing Liu;Tianlu Wang
  • 通讯作者:
    Tianlu Wang
Concentration optimization of combinatorial drugs using Markov chain‑based models
使用基于马尔可夫链的模型优化组合药物的浓度
  • DOI:
    10.1186/s12859-021-04364-5
  • 发表时间:
    2021-09-21
  • 期刊:
    BMC Bioinformatics
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Ma S;Dang D;Wang W;Wang Y;Liu L
  • 通讯作者:
    Liu L

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其他文献

巴西橡胶树产胶基因 HbREF、HbHMGR1 与 MYCs 转录因子互作
  • DOI:
    doi:10.13271/j.mpb.018.004253
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    分子植物育种
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    党丹;翟金玲
  • 通讯作者:
    翟金玲

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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