基于内源siRNA的东方百合花青素合成途径的转录后沉默机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31672191
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1507.观赏园艺学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Flower color is one of the most important quality traits for ornamental plants. Anthocyanins are the most important pigments for flower coloration and the target molecular for color modification in flower breeding. Oriental hybrid lilies with the variety of anthocyanin are good materials to study anthocyanin metabolic mechanism. Base on the strong preliminary work, we are struggling to uncover post-transcriptional gene silencing (PTGS) of anthocyanin synthase pathway caused by endogenous siRNA with white ‘Siberia’ and pink ‘Sorbonne’. Analyze the tepal pigments using HPLC and build the relation between anthocyanin and flower color. Identify the structure gens and regulatory genes in anthocyanin synthase pathway. Determine the expression pattern of those genes in nine developmental stages of tepal with different color using qRT-PCR and find the key candidate genes. Analyze the protein-DNA interaction between transcription factors (MYB and bHLH) and promoters of candidate gens. Compare the expression level of candidate gene pre-mRNA and mature-mRNA to confirm the occurrence of PTGS of candidate genes during the coloration process. Through small-RNA sequencing, screen the siRNAs causing PTGS of candidate genes. And confirm the function of candidate gene siRNAs during the tepal coloration by VIGS and genetic transformation with stable gene interference. This project will uncover a new regulation mechanism on anthocyanin synthase pathway and provide guidance to color modification in molecular breeding of lilies.
花色是观赏花卉主要品质性状之一,花青素苷是花色形成的主要色素类群之一,是花色改良的主要调控物质。东方百合花青素苷含量在品种间存在显著差异,是探讨植物花青素苷代谢机制的良好试材。本项目在前期研究基础上,选择东方百合粉色品种‘索邦’和白色品种‘西伯利亚’,研究siRNA介导的花青素苷合成途径的转录后沉默机制。测定各样本色素成分和含量并分析其与花色表型的关系;分离花青素苷合成相关的结构基因和调节基因,分析其在呈色过程中的表达模式,筛选关键的差异表达基因;分析差异基因启动子与转录因子的互作关系;比较前体mRNA和成熟mRNA丰度并进行Northern杂交分析,证明差异基因发生转录后沉默过程;利用小RNA测序,筛选出差异基因的siRNA;利用VIGS系统和稳定的基因干扰株系,验证siRNA的功能。本项目研究对阐明百合花被片花青素苷合成途径的表达调控机制有重要意义,也为百合花色改良的分子育种提供依据。

结项摘要

花色是观赏花卉主要品质性状之一,花青素苷是花色形成的主要色素类群之一,是花色改良的主要调控物质。东方百合花青素苷含量在品种间存在显著差异,是探讨植物花青素苷代谢机制的良好试材。本项目以东方百合粉色品种‘索邦’和白色品种‘西伯利亚’为研究材料,花被片解剖观测表明,西伯利亚中无可见色素分布,索邦中可见色素不均匀分布。UPLC-MS/MS分析结果显示,是否含有花青素类物质决定了两个百合品种花色性状的差异。克隆了两个品种中花青素合成通路中的结构基因和转录因子,两个品种的序列高度相似,不是花色差异的原因。在转录组测序结果基础上比较这些基因在两个品种花被片发育中的表达变化,发现CHS、F3’H和MYB12是关键的差异基因。小RNA组和转录组的联合分析表明,有9个差异表达的miRNA靶向7个花青素相关基因(包含了MYB12、F3’H、ANS等),西伯利亚中上调的siRNA与下调的转录本(CHS,DFR和FLS)高度相关。酵母双杂交试验表明,MYB12的R3结构域是与bHLH2发生蛋白互作必须的。在烟草和拟南芥中过量表达MYB12,均强烈诱导花青素的大量合成,在茎、叶、花中花青素苷含量显著提高。本项目研究对阐明百合花被片花青素苷合成途径的表达调控机制有重要意义,也为百合花色改良的分子育种提供依据。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
百合转录因子MYB12的克隆与表达分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    植物科学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨捷;张星;彭梦笛;贾桂霞;何恒斌
  • 通讯作者:
    何恒斌
Physical mapping of 45S rDNA loci in Lilium OT hybrids and interspecific hybrids with Lilium regale
百合 OT 杂交种和百合种间杂交种 45S rDNA 位点的物理定位
  • DOI:
    10.1016/j.scienta.2019.03.035
  • 发表时间:
    2019-06
  • 期刊:
    Scientia Horticulturae
  • 影响因子:
    4.3
  • 作者:
    Cao Qinzheng;Lian Yuqin;Wang Lianjuan;Zhang Qian;Zhao Yuqian;Jia Guixia;He Hengbin
  • 通讯作者:
    He Hengbin
百合黄烷酮3-羟化酶基因LhSorF3H的克隆与表达
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    西北植物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张星;杨捷;彭梦笛;贾桂霞;何恒斌
  • 通讯作者:
    何恒斌
东方百合索邦组蛋白去乙酰化酶LoSorHDA1的克隆与表达分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    西北农业学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    何恒斌
  • 通讯作者:
    何恒斌
百合VAL2基因的克隆与表达分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    西北植物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    何恒斌
  • 通讯作者:
    何恒斌

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    何恒斌;贾桂霞
  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
    何恒斌;张惠娟;贾桂霞;郝玉光
  • 通讯作者:
    郝玉光
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    北京林业大学学报,录用
  • 影响因子:
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  • 作者:
    何恒斌;郝玉光;丁琼;贾桂霞
  • 通讯作者:
    贾桂霞

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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