油菜抗旱基因高通量克隆及功能分析

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31470085
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    30.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1305.作物逆境生物学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Rapeseed, as an important oil crop, is inclined to be subjected drought injury due to its relatively sensitive to drought stress among the primary crops. Using transcriptome sequencing (RNA-Seq) with comparative genomic analysis, 68 genes were screened out maybe involving in drought stress response in Brassica napus. these 68 genes were intrduced into Arabidopsis to construct rape FOX Arabidopsis mutant library by Gateway and FOX hunting system, including 378 FOX strains. In this study, take these rape FOX Arabidopsis mutants as materials, select drought-tolerant rape FOX transformants by high throughput far-infrared thermal imaging technology. Combining with drought-resistant phenotypic, physiological and cytological analysis, isolate candidate genes related drought stress from rape FOX Arabidopsis plants by PCR and sequencing. By gene expression analysis and according to the model plant Arabidopsis thaliana drought stress signal transduction networks, primarily explore key genes for drought stress responce in Brassica napus. Then use the genome editing techniques -CRISPR/Cas9 system and multi-gene over expression technology -MISSA system for the key genes functional verification in oilseed rape, preliminary elucidate the molecular mechanisms of these genes and collaborative regulatory mechanisms in drought-resistance in canola, and provide important gene resources for rapeseed drought genetic engineering.
油菜是我国重要的油料作物,同时又是耐旱性较差的作物,干旱严重制约其生产的发展。本课题组运用转录组测序(RNA-Seq)结合比较基因组学分析,筛选到68个可能参与油菜干旱胁迫响应的基因,并运用高通量的Gateway技术和FOX hunting system将68个基因全长cDNA转入拟南芥,获得包含378个转基因株系的油菜FOX拟南芥突变体库。本研究以这些油菜FOX植株为材料,运用高通量的远红外热成像技术筛选抗旱的油菜FOX突变株,结合抗旱表型、生理及细胞学分析,克隆获得相应的油菜干旱相关基因。通过基因表达分析并借助油菜近缘模式植物拟南芥干旱胁迫信号转导网络,发掘油菜干旱响应的关键节点基因。

结项摘要

本研究运用转录组测序(RNA-Seq)结合比较基因组学分析,筛选到68个可能参与油菜干旱胁迫响应的基因,并运用高通量的Gateway技术和FOX hunting system将68个基因全长cDNA转入拟南芥,两批次共获得包含727个转基因株系的油菜FOX拟南芥突变体库。以这些油菜FOX植株为材料,运用高通量的远红外热成像技术,结合抗旱表型、生理及细胞学分析,克隆获得20个油菜干旱相关基因,并全部转入油菜,正在进行转基因油菜纯合体鉴定和抗逆性分析。对其中7个基因进行了组织特异性表达分析和逆境诱导表达分析,结果表明,这7个基因均在子叶和根中高表达,并受干旱和盐的诱导表达。其中2个基因的亚细胞定位结果表明它们定位于细胞核中,是一类型转录因子。由于油菜生长周期长,项目执行期只有两年,进一步的机制分析仍在进行中。发表论文2篇,其中SCI(IF=5.228)1篇;育成杂交油菜新品种1个:开油1208,已通过河南省农作物品种审定委员会审定;申请专利2项;参与项目的毕业研究生2个、在读研究生3名。在研期间主持人由副教授晋升为教授,一名骨干成员由实验师晋升为高级实验师。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
油菜抗逆相关基因FOX拟南芥文库构建
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    植物生理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨翠玲;柴冬梅;董龙;李艳萍
  • 通讯作者:
    李艳萍
Transcriptomic basis for drought-resistance in Brassica napus L.
甘蓝型油菜抗旱的转录组学基础。
  • DOI:
    10.1038/srep40532
  • 发表时间:
    2017-01-16
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Wang P;Yang C;Chen H;Song C;Zhang X;Wang D
  • 通讯作者:
    Wang D

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其他文献

干热河谷泥石流流域不同分区土壤养分特征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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    --
  • 作者:
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    --
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王道杰;杨翠玲;刘展;董龙
  • 通讯作者:
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杜锟;林勇明;马瑞丰;王道杰
  • 通讯作者:
    王道杰
Method for high-flux rapidly cloning of rape draught-resistant gene
油菜抗旱基因高通量快速克隆方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    邵树枞

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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