中北盐湖区内蒙古东部盐湖亚区放线菌资源勘探和新抗生素的发现

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81703476
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.1万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3411.药物资源
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Due to the widely spread of the drug-resistance bacteria, new antibiotics are urgently needed. Actinomycetes are one of the most important antibiotics-producing pharmaceutical resources. Studies have shown that the posibility of discovery for new antibiotics from actinomycetes inhabited in special environments was higher. Saline lakes are special water-bodies with a relatively high concentration of dissolved salts. Previous studies have shown that actinomycetes from saline lakes is a potential resource for drugs discovery, since the actinomycetes from saline lakes are rich in diversity & novelty and a wide range of biological activities. Based on the previous studies on saline lake actinomycetes, the proposal is intended to dig actinomycetes as pharmaceutical resource collected in eastern Inner Mongolia subregion, north-central region of Chinese saline lakes with unique environmental factors, which has not been reported and few studied. Samples of sediments and soil from dried lake basin will be collected; actinomycetes including halophilic and halotolerant actinomycetes will be obtained by the method of pure culture; isolates will be analyzed by comparison of 16S rRNA gene sequences to explore the diversity and novelty of the culturable actinomycetes; the bioactive strains against drug-resistance bacteria will be selected by antimicrobial assay and screening of antibiotics biosynthetic genes; the novel actinobacteria species with bioactivity will be identified by the polyphasic taxonomic approaches and antibiotics will be purified and identified by the different chromatographies and the modern spectral techniques. The research aims will focus on discovery of new actinomycete species and new antibiotics, which will lay the foundation for drugs discovery.
细菌耐药形势严峻,亟待新型抗生素投入使用。以放线菌为主的药用微生物是抗生素的重要来源,研究表明从特殊环境放线菌中获得新型化合物的几率更大。盐湖是一种特殊的高盐生境,既往研究表明:盐湖放线菌物种多样、新资源丰富、生物活性广泛,是极具开发潜力的药物资源。在项目组前期盐湖放线菌研究的基础上,本项目选择环境独特、鲜有报道的我国中北盐湖区内蒙古东部盐湖亚区,采集盐湖沉积物和干涸湖盆的土壤,采用纯培养方法进行放线菌(包括耐盐、嗜盐放线菌)分离;通过16S rRNA 基因序列比对分析,探究其中可培养放线菌的物种多样性和新颖性;综合抗耐药菌活性及抗生素生物合成基因筛选,发现优质有潜力的放线菌药用资源;对具有抗耐药菌活性的新颖放线菌资源进行多相分类;利用色谱和波谱技术对优质药用菌株进行活性次级代谢产物的纯化和鉴定。本项目旨在发现新的放线菌资源、新的优质药用菌株和新型的活性化合物,为新抗生素的发现奠定基础。

结项摘要

细菌耐药形势严峻,亟待新型抗生素投入使用。以放线菌为主的药用微生物是抗生素的重要来源。盐湖是一种特殊的高盐生境,既往研究表明:盐湖来源放线菌物种多样、新资源丰富、生物活性广泛,是极具开发潜力的药物资源。. 本项目从锡林郭勒盟的高原盐湖中分离获得了隶属于8个目15个科28个属的365株放线菌,以链霉菌属和拟诺卡氏菌属为优势菌属。分离获得潜在新的放线菌分类单元28个,其中链霉菌新分类单元20个。链霉菌新颖性突出,15株链霉菌与有效发表菌株的16S rRNA基因的最高同源性低于98.0%。综合菌株的新颖性、抗菌活性和抗生素生物合成基因的检测结果,初步筛选出9株可用于进一步研究的药用菌株,其中4株对G+和G-病原菌均有明显活性。对菌株J5903和抗MRSA活性菌株XMNu-373进行了多相分类学鉴定。推荐菌株J5903为Planctomonas属新种,命名为Planctomonas psychrotolerans;推荐菌株XMNu-373为Phytoactinopolyspora属新种,命名为Phytoactinopolyspora mesophila。对潜在链霉菌新种XMNu-116的抗MRSA活性主产物进行了分离和鉴定,获得两个已知抗生素,Griseoviridin和Etamycin A。同时运用GNPS质谱分子网络及数据库比对预测到4个未知同系化合物。. 本项目对内蒙古东部盐湖亚区的主要分布地——锡林郭勒盟的高原盐湖中可培养放线菌资源的多样性、新颖性、抗菌活性、活性代谢产物进行了初步评价及分析。研究过程中储备了大量放线菌菌株,获得了多株优质抗菌药用放线菌菌种。研究结果揭示了该区域盐湖含有宝贵的药用放线菌菌种资源,丰富了我国盐湖药用放线菌资源的研究成果。本研究为盐湖来源新抗菌药物的研发储备了菌种资源和积累了理论基础。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Phytoactinopolyspora mesophila sp. nov., isolated from a saline-alkaline soil
植物放线多孢菌 mesophila sp.
  • DOI:
    10.1099/ijsem.0.004274
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Feng Xue-Mei;Zhai Xue-Han;Liu Shao-Wei;Wang Chun-Miao;Sun Cheng-Hang;Zhou Xue;Zhang Ya-Jie;Li Xiao-Jun
  • 通讯作者:
    Li Xiao-Jun
Planctomonas psychrotolerans sp. nov., isolated from rhizosphere soil of Suaeda salsa.
耐冷浮单胞菌 sp.
  • DOI:
    10.1093/ndt/gfz129
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Li Xiao-Jun;Wang Chun-Miao;Feng Xue-Mei;Liu Shao-Wei;Qiao Hai-Xia;Chang Yue-Li;Sun Cheng-Hang
  • 通讯作者:
    Sun Cheng-Hang

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其他文献

塔克拉玛干沙生植物来源放线菌抗铜绿假单胞菌活性的筛选及菌株38-7L-1活性产物的研究
  • DOI:
    10.13461/j.cnki.cja.005487
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    中国抗生素杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈川;刘佳萌;蒋忠科;李小俊;刘少伟;庹利;戴素娟;杨桂柳;王飞飞;黄大林;姜明国;孙承航
  • 通讯作者:
    孙承航
河北九莲城淖尔可培养放线菌多样性及抗菌活性筛选
  • DOI:
    10.13344/j.microbiol.china.150907
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    微生物学通报
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    --
  • 作者:
    李小俊;吴越;张伟铭;李静;刘少伟;蒋忠科;黄大林;孙承航
  • 通讯作者:
    孙承航
广西北仑河口红树林植物根际土壤放线菌多样性及抗菌活性研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    中国抗生素杂志
  • 影响因子:
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  • 作者:
    吴越;李小俊;陈建宏;蒋莲秀;何玉林;韦晗宁;乔永超;何义;郑红芸;孙承航;黄大林
  • 通讯作者:
    黄大林
放线菌R2A14A-1的活性代谢产物分离及菌株鉴定
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国抗生素杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王飞飞;庹利;刘佳萌;刘少伟;董艳萍;蒋忠科;夏曼;李小俊;陈川;戴素娟;许敏;姜蓉;孙承航
  • 通讯作者:
    孙承航
两株红树林根际土壤放线菌的鉴定和抗菌活性研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    中国药理学通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴越;李小俊;陈建宏;蒋莲秀;何玉林;韦晗宁;孙承航;黄大林
  • 通讯作者:
    黄大林

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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