YTHDF2通过识别m6A甲基化修饰的LINC00473参与先天性巨结肠的机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81900460
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0301.消化系统结构、功能与发育异常
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Hirschsprung disease (HSCR) is a congenital gut motility disorder that is caused by deficits in migration and proliferation of enteric neural crest cells. We found in a lncRNA chip study that the expression level of LINC00473 was drastically decreased in HSCR patients. Knockdown of LINC00473 significantly affected the proliferation and migration of SK-N-BE(2) cells, indicating that LINC00473 is implicated in the pathogenesis of HSCR. Human YTH domain family 2 (YTHDF2) protein recognizes the N6-Methyladenosine (m6A) modification on RNA and regulates its stability. It is reported that LINC00473 could be recognized and bound with YTHDF2. We found in cell model that YTHDF2 negatively regulated the expression level of LINC00473. Further, we found that the LINC00473 may affect cell migration by competing with miR-195. Low level of LINC00473 may release miR-195 to down regulate DIEXF, which lead to impaired cell migration. This study will thoroughly investigate the role and mechanism of YTHDF2/LINC00473/miR-195/DIEXF in the impaired cell migration and proliferation seen in HSCR.
先天性巨结肠(HSCR)是一种肠神经嵴细胞迁移和增殖障碍导致的先天性消化道畸形。课题组前期在芯片研究中发现LINC00473在病变组织中低表达,细胞实验证明敲低LINC00473可抑制神经细胞的增殖和迁移,提示LINC00473低表达可能与HSCR发生相关。通过生物信息学网站预测提示LINC00473可能发生m6A甲基化,其低表达可能与m6A甲基化识别蛋白YTHDF2介导RNA降解有关。通过RNAi实验发现YTHDF2对LINC00473具有负性调控作用。进一步,课题组通过生物信息学网站预测及细胞实验发现低表达的LINC00473可能作为ceRNA,通过释放miR-195,抑制靶基因DIEXF表达,从而抑制细胞增殖和迁移。本研究将深入研究YTHDF2通过识别并降解m6A甲基化修饰的LINC00473,通过调节miR-195/DIEXF从而参与HSCR发生的机制。

结项摘要

先天性巨结肠(Hirschsprung disease,HSCR)是一种肠神经系统发育异常导致的先天性消化道畸形。LINC00473在HSCR组织中低表达,其可以促进细胞的增殖和迁移。m6A甲基化是RNA修饰的普遍形式,其水平在HSCR中下降。m6A甲基化识别蛋白YTHDF2可降低靶基因的稳定性。RIP实验证实YTHDF2可直接与LINC00473结合,由此提出假设:YTHDF2与LINC00473结合可能通过降低其稳定性下调LINC00473的表达。胞浆胞核分离实验证实LINC00473位于胞浆中,提示其发挥ceRNA作用的可能。低表达的LINC00473可以通过miR-195抑制靶基因DIEXF的表达,从而抑制细胞增殖和迁移。本研究将深入研究YTHDF2通过识别m6A甲基化修饰的LINC00473影响肠神经嵴细胞迁移和增殖在HSCR中的作用机制,为疾病的诊断和治疗提供新思路。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
m6A demethylase ALKBH5 suppresses proliferation and migration of enteric neural crest cells by regulating TAGLN in Hirschsprung's disease
m(6)A去甲基化酶ALKBH5通过调节先天性巨结肠中的TAGLN抑制肠神经嵴细胞的增殖和迁移
  • DOI:
    10.1016/j.lfs.2021.119577
  • 发表时间:
    2021-05-10
  • 期刊:
    LIFE SCIENCES
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Wang, Binyu;Fang, Xiang;Tang, Weibing
  • 通讯作者:
    Tang, Weibing

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其他文献

小鼠肠神经前体细胞培养、转染和功能研究
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  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中华小儿外科杂志
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  • 作者:
    朱中贤;杜春霞;谢华;李红星;唐维兵
  • 通讯作者:
    唐维兵
一种新型红外GaAs/GaAlAs探测器的研究
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    杜春霞;邓军;沈光地
  • 通讯作者:
    沈光地
新型8-14μm GaAs/GaAlAs红外探测器数值模拟和分析
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  • 通讯作者:
    沈光地

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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