早期EB病毒阳性T/NK细胞淋巴组织增生性疾病转归的遗传学标记物研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81900195
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0810.淋巴瘤与淋巴细胞疾病
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

EBV-positive T/NK lymphoproliferative disease (EBV-T/NK-LPD) is spectrum of diseases associated with EBV infection, with diverse clinical manifestations and poor prognosis. There are many similarities in morphology, immunophenotype and clinical manifestations. There are still controversial definitions in WHO Classification of Tumours of Haematopoietic and Lymphoid Tissues. Therefore, pathologists often faced with great challenges in daily work when make the diagnosis. In the early stage of disease, it is often confused with infectious mononucleosis of T/NK type and delayed treatment. In the previous work, we optimized the diagnostic framework of EBV-T/NK-LPD and proposed the diagnosis of systemic acute EBV infection (SAEBV) to avoid early misdiagnosis. In addition, our targeted sequencing of SAEBV suggests the effect of genetic changes on progression and/or transformation of the diseases. Therefore, this study aims to screen suitable genetic markers for indicating progression and/or tranformation in the early stage of EBV-T/NK-LPD by using Whole genome sequencing (WGS) technique of SAEBV, and to establish a predictive model for EBV-T/NK-LPD progression and/or transformation. This study can prompt the precise diagnosis , further optimize the EBV-T/NK-LPD diagnostic framework, indicate the progression and/or transformation of disease and guide treatment.
EB病毒阳性T/NK细胞淋巴组织增生性疾病(EBV-T/NK-LPD)是一组与EB病毒感染相关,临床表现多样,预后较差的疾病。其形态学、免疫表型及临床表现等方面具有诸多相似性,在WHO淋巴造血系统肿瘤分册中对其定义仍存在争议,因此对该谱系疾病的诊断在日常工作中常面临巨大挑战。在疾病早期,常与传染性单核细胞增多症T/NK表型混淆而延误治疗。在前期工作中,我们优化了EBV-T/NK-LPD的诊断架构,提出了系统性急性EB病毒感染(SAEBV),以避免疾病的早期误诊。此外,我们对SAEBV进行的靶向测序提示了遗传学改变对疾病转归的影响。因此,本研究旨在通过对SAEBV的全基因组测序(WGS)技术筛选出合适早期EBV-T/NK-LPD转归遗传学标记物,并建立EBV-T/NK-LPD转归预测模型。该研究可提示疾病的诊断,进一步优化EBV-T/NK-LPD诊断框架;提示疾病转归,指导临床决策。

结项摘要

EB病毒阳性T/NK细胞淋巴组织增生性疾病(EBV-T/NK-LPD)其形态学、免疫表型及临床表现等方面具有诸多相似性,在WHO淋巴造血系统肿瘤分册中对其定义仍存在争议,因此对该谱系疾病的诊断在日常工作中常面临巨大挑战。在疾病早期,常与传染性单核细胞增多症T/NK表型混淆而延误治疗。本研究通过对SAEBV进行测序及随访发现SAEBV中未出现疾病迁延/进展的病例未检出确切体细胞和胚系突变,而出现疾病迁延/进展的病例常出现STAT3、KMT2D、DDX3X、SOCS1、KMT2C等体细胞突变;以HLH为首发症状(且出现迁延/进展)的病例常见PHLH相关基因杂合突变,常见突变基因为UNC13D、STXBP、PRF1、LYST等。基于基因检测和随访结果可对SAEBV进一步分类:IM-T/NK、EBV+HLH、HLH-onset CAEBV、Pre-tumor lesion和SAEBV-U。该分类是对本研究团队前期提出的EBV-T/Nk-LPD诊断框架的优化,缩小了SAEBV-U这一模糊诊断的范围,对该疾病谱系的深入理解和精准诊断有实际意义。 为建立预测模型,本研究团队改良开发了可适用于小样本高维数据的人工智能算法,该算法在进行sEBV+T/NK-LPD疾病风险评估中取得了良好表现,在训练集、验证集以及文献队列中均显示出稳定结果。将其应用于基于遗传学标志物的EBV-T/NK-LPD 转归预测模型建立中,在目前已有的训练集中取得了较为满意的结果。该集成算法可应用有限的数据训练出稳定的模型,其推广应用可惠及更多罕见病患者。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Staging challenges in extranasal and juvenile extranodal NK/T-cell lymphoma
鼻外和幼年结外 NK/T 细胞淋巴瘤的分期挑战
  • DOI:
    10.1038/s41375-020-0975-x
  • 发表时间:
    2020-07
  • 期刊:
    Leukemia
  • 影响因子:
    11.4
  • 作者:
    Guan Pujun;Dong Tian;Zhang Li;Zhao Sha;Liu Rongbo;Chen Zihang
  • 通讯作者:
    Chen Zihang
Flow Cytometry-Assessed PD1/PDL1 Status in Tumor-Infiltrating Lymphocytes: A Link With the Prognosis of Diffuse Large B-Cell Lymphoma.
流式细胞术评估肿瘤浸润淋巴细胞中的 PD1/PDL1 状态:与弥漫性大 B 细胞淋巴瘤预后的联系
  • DOI:
    10.3389/fonc.2021.687911
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in oncology
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Chen Z;Deng X;Ye Y;Zhang W;Liu W;Zhao S
  • 通讯作者:
    Zhao S
Extranodal natural killer/T-cell lymphoma of the breast: a retrospective clinicopathological analysis of a consecutive 11-year case series.
乳腺结外自然杀伤/T细胞淋巴瘤:连续 11 年病例系列的回顾性临床病理学分析
  • DOI:
    10.1186/s13023-021-02110-x
  • 发表时间:
    2021-11-18
  • 期刊:
    Orphanet journal of rare diseases
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Liu W;Chen Z;Li F;Zhang W;Liu W;Zhao S
  • 通讯作者:
    Zhao S
Accumulating Knowledge of EBV-positive T-Cell and NK-Cell Lymphoproliferative Diseases of Childhood
积累儿童 EBV 阳性 T 细胞和 NK 细胞淋巴细胞增殖性疾病的知识
  • DOI:
    10.1097/pas.0000000000001700
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    American Journal of Surgical Pathology
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Zihang Chen;Sha Zhao;Weiping Liu
  • 通讯作者:
    Weiping Liu
Angioimmunoblastic T-cell lymphoma with predominant CD8+ tumor-infiltrating T-cells is a distinct immune pattern with an immunosuppressive microenvironment.
以 CD8 肿瘤浸润 T 细胞为主的血管免疫母细胞 T 细胞淋巴瘤是一种具有免疫抑制微环境的独特免疫模式
  • DOI:
    10.3389/fimmu.2022.987227
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    FRONTIERS IN IMMUNOLOGY
  • 影响因子:
    7.3
  • 作者:
    Chen, Zihang;Zhu, Qiqi;Deng, Xueqin;Yao, Wenqing;Zhang, Wenyan;Liu, Weiping;Tang, Yuan;Zhao, Sha
  • 通讯作者:
    Zhao, Sha

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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