IGSF4甲基化致珠蛋白合成障碍在地中海贫血中的作用及机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81300496
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0419.胎儿相关性疾病与胎源性疾病
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

There are greater differences in the clinical manifestations for thalassemia, oftenly showing the Mild or asymptomatic after the birth of homozygous children in the clinical,which brings a tremendous challenge on whether to terminate the pregnancy.It's also suggested a non-classical genetic pathway involved in the regulation for the clinical phenotype in thalassemia.It had been shown that hypermethylation of IGSF4 gene with its CpG islands and there was the positive correlation between its methylation differences and clinical severity in thalassemia. Study shows high expression of the key regulator CD45 in erythroid differentiation pathway can inhibit the production of globins, and IGSF4 can regulate the expression of CD45 negatively.Combined with bioinformatics, we speculate hypermethylation of gene IGSF4 in its promoter may affact its expression,which can promote the expression of CD45. Eventually lead to different severity of clinical manifestations in thalassemia.To evaluate the regulation of transcription and translation for gene IGSF4、CD45 and globins by collecting the peripheral blood of pregnant women and to cultivate various types of erythroid precursor cells in thalassemia.And meanwhile, using the method of interference suppression with CD45-siRNA to observe the expression of CD45 to explore the molecular mechanisms with hypermethylation of IGSF4 gene in different phenotypes for thalassemia.Our study is expected to clarify the pathogenesis in terms of epigenetics, and provide a novel idea for noninvasive prenatal diagnosis and early intervention in thalassemia
地中海贫血(地贫)临床表现差异较大,常有纯合子型患儿出生后临床表现为轻型或无症状,对是否终止妊娠带来极大挑战,亦提示有非经典遗传途径参与调控地贫的临床表型。项目组前期研究中发现,细胞表面粘附因子IGSF4基因启动子区存在CpG岛甲基化,且其甲基化差异与地贫临床严重程度呈正相关。研究表明红细胞分化途径关键调节因子CD45的高表达可导致珠蛋白合成障碍,且IGSF4负调控CD45的表达。结合生物信息学分析,我们推测:IGSF4基因甲基化后致自身表达下调促CD45过表达,使珠蛋白不同程度生成障碍,进而引起地贫临床表现不同。本项目拟通过采集孕妇外周血及培养各型地贫红系前体细胞,探讨甲基化对IGSF4、CD45及珠蛋白的调节作用;同时利用RNAi干扰技术,观察CD45的表达情况,探讨IGSF4基因甲基化在各地贫表型中的分子机制,从表观遗传学角度阐明其发病机制,为无创性产前诊断及早期干预提供新思路。

结项摘要

项目背景:地中海贫血临床表现差异较大,常有纯合子型患儿出生后临床表现为轻型或无症状,对是否终止妊娠带来极大挑战,亦提示有非经典遗传途径参与调控地贫的临床表型。项目组前期研究中发现,细胞表面粘附因子IGSF4基因启动子区存在CpG岛甲基化,且其甲基化差异与地贫临床严重程度呈正相关。本课题以IGSF4基因启动子甲基化在地贫不同临床表型中的作用为研究切入点,探讨其甲基化导致珠蛋白生成障碍的机制。.主要研究内容和结果:1、利用已建立的基于寡核苷酸芯片的地中海贫血DNA甲基化芯片平台,探讨了IGSF4基因在地中海贫血中甲基化的情况及意义研究,整体水平上表明该基因在重型到轻型地中海贫血中呈逐渐表达降低,且有显著性差异 (ratio=0.18,ratio<0.50);2、利用Sequenom DNA甲基化质谱测序,分别在DNA及RNA水平上研究了IGSF4基因启动子甲基化对IGSF4的调节作用,初步探讨地贫各临床表型中IGSF4基因甲基化作用对其自身表达和翻译的调控机制,在蛋白水平进一步验证IGSF4基因在重型地中海贫血中相对于轻型而言呈低表达;3、利用293 细胞株,然后采用甲基转移酶抑制剂(5-氮杂-2’脱氧胞苷)干预培养,分别比较去甲基化培养前后IGS4及珠蛋白表达差异,即在蛋白水平上深入探讨导致地贫临床表现严重程度不同的分子机制,证实甲基化后珠蛋白及IGSF基因均呈低表达,且珠蛋白较IGSF4表达降低。已完成计划任务书绝大部分内容,相关实验结果已撰写成文正在投稿。.科学意义:本课题探讨IGSF4基因甲基化在各地贫表型中的分子机制,从表观遗传学角度阐明其发病机制,为无创性产前诊断及早期干预提供新思路。

项目成果

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其他文献

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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    矿产保护与利用
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  • 作者:
    苏明如;窦爱春;刘帅;刘彤;高天
  • 通讯作者:
    高天
Mg2 + -CO2 - 3 -Ida2 - -H2 O体系热力学平衡分析
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    矿产保护与利用
  • 影响因子:
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  • 作者:
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    2017
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  • 作者:
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  • 发表时间:
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  • 作者:
    唐俊;高天;梁栋;王年
  • 通讯作者:
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其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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