发现胰腺癌血清O-连接聚糖生物标记物的新方法

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30900254
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    20.0万
  • 负责人：
    赵亮
  • 依托单位：
    中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
  • 学科分类：
    C0506.糖、脂生物化学
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

胰腺癌中晚期发现生存率极低，早期发现五年生存率高，但早期诊断非常困难。当前影像学手段尚不适用于直径1cm以下的早期胰腺癌，常用的血清标记物如CA19-9等又存在敏感性低，特异性差等问题。血清中O-连接聚糖的变化与胰腺癌等腺癌的发生密切相关，国外最新文献报道分别在乳腺癌和卵巢癌中发现O-连接聚糖糖组血清标记物，能够较好区分癌症患者和对照，但上述研究也存在样品用量较多，分离体系不稳定等问题。目前学术界尚无在胰腺癌中开展类似研究的报道。本项目以胰腺癌血清为研究对象，旨在发展稳定、高效糖组水平监测血清O-连接聚糖变化的研究平台，挖掘O-连接聚糖胰腺癌标记物。项目组通过改进β消除反应体系，运用创新的自制固相萃取分离体系，改进MALDI点样基质，已突破O糖链研究关键瓶颈，实现选择性断裂O-糖苷键，实验样本微量化，反应分离体系稳定化。该研究的深入将发现特异性胰腺癌标记物为胰腺癌早期诊断提供新的选择。

结项摘要

胰腺癌中晚期发现生存率极低，早期发现五年生存率高，但早期诊断非常困难。当前影像学手段尚不适用于直径1cm以下的早期胰腺癌，常用的血清标记物如CA19-9等又存在敏感性低，特异性差等问题。。本项目以胰腺癌血清为研究对象，旨在发展稳定、高效糖组水平监测血清O-连接聚糖变化的研究平台，挖掘O-连接聚糖胰腺癌标记物。.分别收集正常人、胰腺炎病人、胰腺癌病人血清样本，设立正常人、胰腺炎、胰腺癌三组对照，采用β消除反应选择性的断裂O-糖苷键，然后应用固相萃取技术富集分离O-连接聚糖，然后使用MALDI-TOF-MS对所得糖组进行分析。建立反映从慢性肝炎到肝癌各阶段间动态变化的O-聚糖谱。发现O-糖链特征标记物，解析差异O-糖链组成。通过数据分析得到以下胰腺炎癌-正常组差异糖链峰712.1、848.5、874.3、 910.1、 915.4、 962.8、 1077.7、 1118.6、 1137.5、 1197.5、1239.5、 1280.5、 1299.5、 1307.9、 1340.6、1442.9、1503.1、 1563.1、 1665.6。对这些糖链分别进行串联质谱分析发现均为糖链结构。所发现差异糖链与多篇文献所报道其它癌症中的差异O-连接糖链相一致。这些一致糖链很可能是在多种癌症中有共性的功能物质，值得今后深入研究。这些共同糖链不但是可以作为重要的肿瘤标记物，还有可能对癌症治疗研究揭示作用。.为研究差异糖链结构，本课题参照已有糖链结构特点和在质谱环境下断裂特征，自行开发质谱糖链分析软件——Glycan Explorer。该软件对糖链结构可进行半自动分析，在糖组学研究中快速提取具有糖链的实验谱图，并对每个谱图进行糖链组成的合理推断，结合网上数据库预测糖链结构。软件将谱图质量数的去卷积化、构建糖链相关质量数网络、特定质量数糖链组成预测和质量数的组合式预测融合在一个流水线操作中，并实现以清晰的图和表的方式展现预测过程和结果。软件的分析过程直观，简洁，能大幅度提高解析糖链的效率。

项目成果

期刊论文数量（5）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
基于质谱技术研究黑色素瘤血清特异性O-糖链
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国科学:化学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    白晨;吴刚;赵亮
  • 通讯作者：
    赵亮
评估几种降维分类器应用于生物质谱数据的性能
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国科学:生命科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    罗凯旋;钟凡;赵亮;贺福初
  • 通讯作者：
    贺福初
Mass spectrometry analysis of melanoma related O-glycans in sera
血清中黑色素瘤相关 O-聚糖的质谱分析
  • DOI：
    10.1007/s11426-010-0057-4
  • 发表时间：
    2010-05
  • 期刊：
    Science China Chemistry
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Bai Chen;Wu Gang;Zhao Liang
  • 通讯作者：
    Zhao Liang
卵巢癌细胞中hCTR1的表达与细胞对顺铂耐药的相关研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Tumor
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    于海林;姜燕;赵亮;鹿欣
  • 通讯作者：
    鹿欣

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  • 通讯作者：
    徐胜军
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  • 作者：
    仲崇权;赵亮
  • 通讯作者：
    赵亮

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
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          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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