基于空间统计理论与潜变量模型的先天性心脏病易感基因-地理环境因素交互效应研究

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基本信息

  • 批准号:
    81602928
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    17.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

The study of the interaction of gene and geographical environment factors has become the focus of congenital heart disease (CHD). The data on gene and geographical environmental factors is characterized by high dimension and spatial heterogeneity. Previous study lacked of quantitative analysis of latent structure, overall effects and spatial dimensions of gene and geographical environmental factors, which may lead to bias. To solve this problem, in this study we will combine the data on CHD from case control study in Shaanxi Province and spatial data of sampling sites obtained through GIS, and use the latent variable analysis method to find out the latent structure and overall effects of gene and geographical environmental factors, investigate the comprehensive features of gene and geographical environmental factors; and then utilize spatial statistical method to investigate the spatial distribution of gene and geographical environmental factors;by combining the results of latent variables and spatial analysis, build the evaluation model to uncover the interaction mechanism behind gene and geographical environmental factors from the perspective of the space. We expect the study can provide evidence for the etiology, susceptibility assessment, early screening and warning of CHD, and find a new way to solve other public health problems.
遗传和地理环境交互作用是先天性心脏病病因研究中需解决的重要问题。易感基因与地理环境因素具有高维度、多层次、空间异质性等特征,既往研究缺乏对基因与地理环境因素潜在结构与整体效应的评价,也忽视了空间异质性的存在,无疑会给先天性心脏病易感基因-地理环境因素交互效应评价带来偏性。针对此问题,申请人将已收集的陕西省先天性心脏病病例对照研究资料与通过GIS获取的空间数据相结合,基于潜变量模型分析先天性心脏病易感基因和地理环境因素的整体效应,考察遗传特征与地理环境因素的综合特征;继而利用空间统计理论考察先天性心脏病易感基因和地理环境因素的空间分布特征;综合空间统计及潜变量分析结果,构建先天性心脏病易感基因与地理环境因素交互效应评估模型,从空间角度阐明地理环境因素与易感基因的交互效应,为先天性心脏病病因研究、易感性评价、早期预警和干预策略制定提供理论依据,同时也为更加科学客观的解决其他健康问题提供新思路。

结项摘要

遗传和地理环境交互作用是先天性心脏病病因研究中需解决的重要问题。易感基因与地理环境因素具有高维度、多层次、空间异质性等特征,既往研究缺乏对基因与地理环境因素潜在结构与整体效应的评价,也忽视了空间异质性的存在,无疑会给先天性心脏病易感基因-地理环境因素交互效应评价带来偏性。针对此问题,本项目采用广义地理加权回归和潜变量分析相结合的思路,取得了以下主要成果:(1)分析了先天性心脏病影响因素的内在关联和潜在结构。首先筛选出先天性心脏病的可能影响因素,利用分类潜变量模型提取了一个三分类的综合潜变量,证实了类别3中出生缺陷及先天性心脏病的发生风险最高。(2)分析了先天性心脏病地理环境影响因素的空间异质性,研究证实不良的生活方式是先天性心脏病患病率增加的重要原因,而且存在显著的地区差异。通过地理加权回归分析,结果发现孕期二手烟与先心病在关中和陕南约45.1%的孕妇中有统计学关联。约 60.8%的孕期饮茶的孕妇更可能生育先心病患儿。另外,约25.2%孕期饮酒的母亲分娩先心病患儿的风险较大,而且主要集中在陕北。(3)分析了母亲孕期膳食模式与不良出生结局的关系。利用分类潜变量模型分析了母亲孕期食物摄入的结构模式,得到三种膳食模式即均衡模式、营养模式和零食模式。其中三种膳食模式以关中所占比例最高,陕南次之,陕北最低。地理加权广义线性模型分析显示膳食模式与出生缺陷没有统计学关联,但是出生体重与膳食模式存在统计学关联,其中营养模式在陕南更容易导致出生体重的增加。而零食模式在关中地区对出生体重影响较大。(4)获取了先天性心脏病相关基因数据,初步探讨了相关基因与先天性心脏病的相关关系。研究发现携带BMP4 基因rs762643位点 T等位基因和TT基因型,携带FPN1 基因rs17198983位点 CC基因型,携带FPN1基因rs73047757位点G等位基因和AG基因型的新生儿发生先天性心脏病的风险增加。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
New insights into phenotypic switching of VSMCs induced by hyperhomocysteinemia: role of Rndothelin-1 signaling
高同型半胱氨酸血症诱导的 VSMC 表型转换的新见解:Rndothelin-1 信号传导的作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Biomedicine & Pharmacotherapy
  • 影响因子:
    7.5
  • 作者:
    Yulong Chen;Xingli Su;Qiaohong Qin;Yue Yu;Min Jia;Hongmei Zhang;Huijin Li;Leilei Pei
  • 通讯作者:
    Leilei Pei
Prevalence and risk factors of congenital heart defects among live births: a population-based cross-sectional survey in Shaanxi province, Northwestern China
陕西省活产儿先天性心脏病患病率及危险因素的横断面调查
  • DOI:
    10.3389/fimmu.2021.642807
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    BMC Pediatrics
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Pei Leilei;Kang Yijun;Zhao Yaling;Yan Hong
  • 通讯作者:
    Yan Hong
Using latent class cluster analysis to screen high risk clusters of birth defects between 2009 and 2013 in Northwest China
利用潜在类别聚类分析筛选西北地区2009-2013年出生缺陷高危人群
  • DOI:
    10.1038/s41598-017-07076-0
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Scientific Reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Pei Leilei;Zeng Lingxia;Zhao Yaling;Wang Duolao;Yan Hong
  • 通讯作者:
    Yan Hong

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其他文献

抑郁症患者单核苷酸多态性(SNPs)分布特征的潜在类别分析
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  • 作者:
    裴磊磊;郭小玲;张岩波;张克让;徐勇;孙宁;Pei Leilei;Guo Xiaoling;Zhang Yanbo;et al.Health S
  • 通讯作者:
    et al.Health S
潜在类别模型及数据模拟分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    数理医药学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郭小玲;裴磊磊;张岩波;Guo Xiaoling;et al(Health Statistics department;Sc
  • 通讯作者:
    Sc
基于R语言应用矩阵计算半定量食物频率问卷的营养素摄入量
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  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中国卫生统计
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    米白冰;屈鹏飞;程悦;党少农;裴磊磊;颜虹
  • 通讯作者:
    颜虹

其他文献

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基于隐马尔可夫模型的先天性心脏病风险动态预警与干预优化策略研究
  • 批准号:
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  • 批准年份:
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    48 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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