窒息死亡特异性microRNA标志物和死亡时间推断内参指标的鉴定

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81373242
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2501.法医病理学及法医临床学
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31
  • 项目参与者:
    马开军; 薛爱民; 贺盟; 江洁请; 张恒; 吕叶辉; 潘晖;
  • 关键词:

项目摘要

The estimation of asphyxia and the postmortem interval are the difficult and hotspot areas all the time. Currently, more and more published papers mentioned that the methods of using fluorescence quantitative PCR detection of the housekeeping gene mRNA levels to estimate postmortem interval. In the previous study, we had used sacrificed rat model to build up the spline function. However, the accuracy of this method largely depends on the stability of the internal reference genes. Meanwhile, we found that the mRNA levels of housekeeping genes vary widely in different causes of death. MicroRNA is a short-chain molecules, having considerable stability from degradation after death. In this study, using miRNA microarray, we will focus on human samples, detecting the hypoxia-sensitive brain tissues, to identify microRNA markers of asphyxia and reference marker of postmortem interval. We set up the mechanical asphyxia as the experimental group, traumatic brain injury, hemorrhagic shock and sudden death as different death caused control groups. The purpose of this study are screening the special changes of miRNA (such as extraordinarily high or low levels of miRNA) as indicators of asphyxia to speculate the cause of death and screening stable miRNA as the internal reference marker in the estimating of postmortem interval, these parameters will ultimately be used on the optimizing of our previous buildup postmortem interval spline function. The target genes of these miRNA will be identified and validated,to elucidate the mechanisms of the miRNA expression changes in hypoxia caused asphyxia and death. Our study will provide new insight for analysis the cause of death of mechanical asphyxia and the estimating of postmortem interval.
窒息死亡原因分析和死亡时间推断一直是法医学研究的重点和难点。近年来,利用荧光定量RT-PCR检测管家基因mRNA水平来分析死因和进行死亡时间推断已逐渐成为研究热点。我们前期利用建立的大鼠断颈处死模型获得了推测死亡时间的样条函数方程,但发现其精确性很大程度上依赖于稳定的内参指标;同时,发现不同死因的管家基因mRNA的水平差异很大。MicroRNA作为短链小分子,性质稳定,不易降解。本课题拟利用miRNA表达谱芯片,以人体样本为研究材料,将机械性窒息作为实验组,颅脑损伤、失血性休克和猝死作为不同死因的对照组,通过检测对缺氧敏感的大脑组织,分别筛选出差异明显的miRNA作为窒息死亡原因推测的指标,并通过靶基因的确定和验证,明确缺氧与miRNA表达变化之间的机制,最终将之应用于窒息死亡原因推测;同时,筛选出表达稳定的miRNA作为死亡时间推断的内参指标,用于进一步优化已有的推测死亡时间的样条函数。

结项摘要

机械性窒息死亡是法医病理学中一大类死亡,因其缺乏特异性标志物,死因诊断只能是“符合性”。找到窒息死亡特异性标志物具有重要的法医学意义。目前推断机械性窒息死亡的研究较少,一般只针对单个或少数几个mRNA或蛋白指标,未涉及miRNA的研究,部分研究仅限在动物实验,未在人体样本验证。.本课题通过高通量miRNA芯片分析技术检测不同死因的人体组织的miRNA的表达、大量人体样本验证以及排除性别、年龄、环境温度和死亡时间的影响,发现了一批机械性窒息组对比颅脑损伤组、失血性休克组和其他死因组有显著性差异的指标,并对某些指标进行了深入研究,找到了其在机械性窒息组差异表达的可能机理。我们在研究过程中增加了mRNA指标的筛选,为窒息死亡的死因诊断提供了更多的指标。.研究成果如下:(1)通过对人体样本进行高通量miRNA芯片表达谱检测及RT-qPCR的定量,挑选出了组织特异性的适合进行机械性窒息死因推断的指标,机械性窒息对颅脑损伤及失血性休克有差异性表达的miRNA:脑组织中有miR-1246、miR-1250;心肌组织中有miR-122-3p、miR-1228、miR-3185等。同时也挑选出了在两种组织中均适合进行机械性窒息死因推断的指标,如miR-122、miR-1281。(2)通过用RT-qPCR、Western Blot及双荧光素报告基因对特异性下调的mir-122的靶基因验证后发现,ALDOA、G6PC3及CS在mRNA和蛋白水平均呈上调趋势。这3个靶基因是葡萄糖无氧酵解及有氧氧化等糖代谢的关键酶,表明机械性窒息特异性下调表达的mi-122可能通过调控靶基因ALDOA、G6PC3及CS等糖代谢关键酶的上调来参与机械性窒息死亡进程中的葡萄糖代谢及能量代谢调控。(3)通过RefFinder内参评估软件,发现在所有人体样本中稳定性最高的18sRNA适合作为内参指标。(4)通过mRNA芯片检测及定量分析,找到心肌组织中机械性窒息对比颅脑损伤及失血性休克均有差异性表达的mRNA有DUSP1和KCNJ2,可以作为心肌组织中特异的指标。.本研究具有较大创新性,找到一批机械性窒息死亡的特异性指标,并对某些指标进行了机制研究,为机械性窒息死亡诊断提供了理论依据,有望解决困扰法医学界的机械性窒息死因诊断问题。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
mRNA和microRNA在机械性窒息死推断中的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国法医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    潘晖;吕叶辉;张恒;陈龙
  • 通讯作者:
    陈龙
Death from a special mechanical asphyxia during suspect restraint: A case report
嫌疑人被束缚期间因特殊机械性窒息死亡:病例报告
  • DOI:
    10.4323/rjlm.2014.81
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Romanian Journal of Legal Medicine
  • 影响因子:
    0.4
  • 作者:
    Pan Hui;Lv Yehui;Zhang Heng;Xue Aimin;Chen Long
  • 通讯作者:
    Chen Long
缺氧相关microRNA在窒息死亡原因推断中的意义
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    法医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    曾颜;马剑龙;陈龙
  • 通讯作者:
    陈龙
Retrospective analysis of 319 hanging and strangulation cases between 2001 and 2014 in Shanghai
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  • DOI:
    10.1016/j.jflm.2016.05.001
  • 发表时间:
    2016-08-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF FORENSIC AND LEGAL MEDICINE
  • 影响因子:
    1.5
  • 作者:
    Ma, Jianlong;Jing, Haojia;Chen, Long
  • 通讯作者:
    Chen, Long
G6PC3, ALDOA and CS induction accompanies mir-122 down-regulation in the mechanical asphyxia and can serve as hypoxia biomarkers.
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  • DOI:
    10.18632/oncotarget.12931
  • 发表时间:
    2016-10-26
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zeng Y;Lv Y;Tao L;Ma J;Zhang H;Xu H;Xiao B;Shi Q;Ma K;Chen L
  • 通讯作者:
    Chen L

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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