基于应用长时空域运行特征的图数据存储组织及系统优化研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    61772216
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    62.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    F0204.计算机系统结构与硬件技术
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Due to the universal expression ability, graph data has been widely used in transportation logistics, finance, bio-information, social networking, e-commerce, public security and many other important areas. With the rapidly popularized and applied technologies, such as mobile Internet, smart terminals and social media, graph data grows rapidly in size. However, due to the complexity and the large-scale size of the graph data, there are some serious challenges during the processes of storage management and computation analysis. Existing graph-processing systems fail to support various types of graph algorithms with different features efficiently, thus leading to the low efficiency of the graph-processing cluster. Because they usually organize external storage data by using a single static and their data access scheme is inefficiently. Hence, it is one of the most important problems to organize the large-scale graph data efficiently, involving the techniques of storage, index, update and query. Based on the problem of the mismatching between the in-memory/external data organizations and the execution features of graph applications, this project proposes a long space-time application runtime characteristics based method of dynamic memory graph data organization and the external graph data organization scheme that is based on the benefit evaluation, to reduce the data access cost in the computation process, thus making the graph-processing systems more energy-efficient when processing large-scale graph-computing jobs.
图数据具有一般性表示能力,被广泛应用到交通物流、金融、生物信息、社交网络、电子商务、以及公共安全等众多重要领域。随着移动互联网、智能终端和社交媒体等技术的快速普及应用,图数据亦呈现爆炸式增长。而图数据的关系复杂性和大规模的数据量,给图数据的存储管理和计算分析带来重大技术挑战。目前图处理系统静态单一的内外存数据组织方式、低效的数据访问模式,无法高效地支持种类多样、特征各异的图算法应用,也进一步导致了大规模图处理集群系统能效不高。针对大规模图数据的高效组织,如存储、索引、更新、查找等,已成为急待解决的问题。本项目针对图数据内外存组织形态与图应用运行特征失配的问题,提出基于应用长时空域运行特征的图数据动态内存组织和基于收益评价的图数据外存组织模式,降低计算过程中数据访问开销,支持构建高效、绿色的大规模图处理系统。

结项摘要

图数据作为一种重要的数据结构因具有一般性表示能力,被广泛应用到交通物流、金融、生物信息、社交网络、电子商务、以及公共安全等众多重要领域。本项目针对目前图处理系统静态单一的内外存数据组织方式、低效的数据访问模式,无法高效地支持种类多样、特征各异的图算法应用以及大规模图处理集群系统的能效受到限制等问题,开展了一系列基于应用长时空域运行特征的图数据动态内存组织、基于收益评价的图数据外存组织模式和面向不同场景的高能效图计算系统的研究。具体地,(1)对于图数据的动态内存组织的研究,项目组结合了图应用及图数据的动态特征提出了基于图应用特征的高效内存数据布局策略、基于活跃度布局的图处理访存策略以及基于日志结构合并子图的时序图存储模型;(2)对于图数据的外存组织模式研究,项目组通过探寻有效的外存访问收益评价提出了基于索引定位的外存访问策略、基于I/O调度的多任务外存模式图处理系统、面向图处理的粗粒度多外存IO管理策略、基于应用特征的混合I/O 访问和顶点更新策略、外存模式图计算系统的子图构建优化、面向并发多任务的外存模式图计算模型优化以及面向随机游走的分区关联感知I/O管理方法;(3)对于构建高能效的图处理系统,项目从面向大规模图表示学习的高效随机游走算法、面向大规模图的多估测目标抽样技术、面向共享内存三角形计算的轻量压缩技术以及面向高带宽网络的分布式图处理系统的快速消息产生及交换技术等多个应用场景提出了系统优化的解决方案。.基于上述研究成果,本项目共发表学术论文16篇,其中CCF A类会议或期刊论文4篇,申请专利15项,其中获授权8项。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(8)
专利数量(15)
CSMqGraph: Coarse-Grained and Multi-external-storage Multi-queue I/O Management for Graph Computing
CSMqGraph:用于图计算的粗粒度、多外部存储、多队列 I/O 管理
  • DOI:
    10.1007/s10766-019-00651-0
  • 发表时间:
    2019-11
  • 期刊:
    International Journal of Parallel Programming
  • 影响因子:
    1.5
  • 作者:
    Chen Shuo;Shi Zhan;Feng Dan;Liu Shang;Wang Fang;Yang Lei;Yu Ruili
  • 通讯作者:
    Yu Ruili
Reservoir-based sampling over large graph streams to estimate triangle counts and node degrees
对大型图流进行基于水库的采样,以估计三角形计数和节点度
  • DOI:
    10.1016/j.future.2020.02.077
  • 发表时间:
    2020-07
  • 期刊:
    Future Generation Computer Systems-The International Journal of eScience
  • 影响因子:
    7.5
  • 作者:
    Zhang Lingling;Jiang Hong;Wang Fang;Feng Dan;Xie Yanwen
  • 通讯作者:
    Xie Yanwen
Using High-Bandwidth Networks Efficiently for Fast Graph Computation
有效使用高带宽网络进行快速图计算
  • DOI:
    10.1109/tpds.2018.2875084
  • 发表时间:
    2019-05-01
  • 期刊:
    IEEE TRANSACTIONS ON PARALLEL AND DISTRIBUTED SYSTEMS
  • 影响因子:
    5.3
  • 作者:
    Cheng, Yongli;Jiang, Hong;Wu, Yunxiang
  • 通讯作者:
    Wu, Yunxiang
CIC-PIM: Trading spare computing power for memory space in graph processing
CIC-PIM:在图处理中用闲置计算能力换取内存空间
  • DOI:
    10.1016/j.jpdc.2020.09.008
  • 发表时间:
    2021-01
  • 期刊:
    Journal of Parallel and Distributed Computing
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Yongxuan Zhang;Hong Jiang;Fang Wang;Yu Hua;Dan Feng;Yongli Cheng;Yuchong Hu;Renzhi Xiao
  • 通讯作者:
    Renzhi Xiao
An efficient memory data organization strategy for application-characteristic graph processing
用于应用特征图处理的高效内存数据组织策略
  • DOI:
    10.1007/s11704-020-0255-y
  • 发表时间:
    2021-10
  • 期刊:
    Frontiers of Computer Science
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Peng Fang;Fang Wang;Zhan Shi;Dan Feng;Qianxu Yi;Xianghao Xu;Yongxuan Zhang
  • 通讯作者:
    Yongxuan Zhang

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其他文献

GISと言語類型論 - 世界言語地図に基づく言語研究
GIS 和语言类型学 - 基于世界语言地图的语言研究
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    山本 秀樹
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    石海青(石井望の筆名);王芳;山本秀樹;乾秀行;山本秀樹;山本 秀樹;山本 秀樹
  • 通讯作者:
    山本 秀樹
Effect of exopolysaccharides from lactic acid bacteria on the texture and microstructure of buffalo yoghurt
乳酸菌胞外多糖对水牛酸奶质构和微观结构的影响
  • DOI:
    10.1016/j.idairyj.2013.08.007
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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基于激波管校准的冲击波压力传感器动态特性研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    南京理工大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨凡;孔德仁;姜波;孔霖;王芳
  • 通讯作者:
    王芳
TRIM33基因对人胃癌细胞SGC-7901增殖及迁移的影响及意义
  • DOI:
    10.11855/j.issn.0577-7402.2022.03.0219
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    解放军医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴晓婷;路志国;田金成;张卓阳;曹相玫;王芳
  • 通讯作者:
    王芳

其他文献

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王芳的其他基金

杏仁核脑区R-spondin 2阳性记忆痕迹细胞兴奋性异常在创伤后应激障碍中的作用及机制
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相似国自然基金

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  • 批准号:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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