贵州世居少数民族Y-SNP和Y-STR遗传多态性的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31560306
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    40.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0605.遗传与进化
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Y chromosome DNA (Y-DNA) is paternally inherited. Most of Y-DNA’s length, especially, nonrecombining region of Y chromosome(NRY), escapes from recombination,which accumulate more mutation and contain information about the evolutional history of human. Thus NRY contributes to understanding the regularity of human origin,evolution, immigration and forensic practice..Guizhou is rich in ethnic genetic resources, there are 54 ethnic groups and the minority population is more than a third of whole province. Among these groups, 17 have lived there for generations, such as the Miao, Buyi, Tujia, Dong, Yi, Gelao, Shui, Hui, Bai, Zhuang, Yao, Maonan, Mulao, Qiang, Man, She and Mongol. .In modern society, with economic development, the integration of ethnic groups were accelerated in Guizhou, therefore, a number of unique genetic resources disappear gradually. For better understand the structure of the genetic characteristics of ethnic groups in Guizhou , timely grasp the precious genetic resources , we plan to expand the study . To investigate the genetic polymorphism of Y-chromosomal short tandem repeats (STR) loci and Y- chromosome single nucleotide polymorphism (SNP) loci in the 17 native minority and Han population of Guizhou Province. 17 Y-STR loci were co-amplified using AmpFlSTR® Yfiler™ PCR Amplification Kit System, and the PCR products were analyzed by genetic analyzer. 22 Y-SNP loci were genotyped by SNaPshot assay with case material, and their distribution frequency in these populations were observed. Cluster and phylogenic tree analyses were conducted to show the genetic distance among the populations. The results can investigate the relationship between groups and within groups from the perspective of the paternally inherited, molecular evolution and thus provide evidence for the origin and migration of the populations.
Y 染色体非重组(NRY)区严格遵循父系遗传,在减数分裂时不会发生重组,利用其多态性可研究父系进化历史中的突发事件,探讨不同种族或群体的演化历史及相互间的亲缘关系,推测其起源、分化和扩散途径,对法医学、群体遗传学、分子进化、人类生态学和考古学研究都具有重要的意义。贵州有着丰富的少数民族遗传资源,项目组拟在初建贵州17个世居地少数民族DNA库等相关研究基础上,对隶属于汉藏语系、藏缅语族、苗瑶语族、壮侗语族、阿尔泰语系和满-通古斯语族等6个语族的贵州苗、布依、土家、侗、彝、仡佬、水、回、白、壮、瑶、毛南、蒙古、仫佬、羌、满、畲等17个世居地少数民族和汉族共18个人群约1200例男性样本的Y染色体NRY区22个Y-SNP和17个Y-STR进行遗传多态性分析,以期获得人群Y染色体遗传多态性信息和数据,从父系遗传学角度探讨群体间及群体内的相互关系,为民族群体族源研究提供分子进化的证据。

结项摘要

Y 染色体非重组(NRY)区严格遵循父系遗传,在减数分裂时不会发生重组,利用其多态性可研究父系进化历史中的突发事件,对探讨不同种族或群体相互间的亲缘关系及法医学、群体遗传学研究都具有重要的意义。贵州有着丰富的少数民族遗传资源,项目组在初建贵州17个世居地少数民族DNA库等相关研究基础上,对语言学分类上属于汉语族、藏缅语族、苗瑶语族、壮侗语族、蒙古语族和满-通古斯语族等6个语族的贵州苗、布依、土家、侗、彝、仡佬、水、回、白、壮、瑶、毛南、蒙古、仫佬、羌、满、畲等17个世居地少数民族和汉族共18个人群1300余例男性样本的Y染色体NRY区22个Y-STR和21个Y-SNP进行遗传多态性分析,获得上述人群Y染色体遗传多态性信息和数据,结合已有报道其他民族人群数据,从父系遗传学角度探讨群体间的遗传距离。结果显示,贵州18个民族的遗传距离与语言学分类、历史源流及地理分布相吻合,汉语族、藏缅语族、壮侗语族、苗瑶语族聚为一支,蒙古语族与满-通古斯语族聚为一支,相对杂居的民族人群间父系遗传结构存在基因交流;苗、瑶、畲、羌、水、毛南、仫佬等民族人群父系遗传结构单一;壮侗语族的7个民族均含有百越群体特征单倍群(O1a-M119),布依族、侗族、仡佬族间亲缘关系最近;满族和蒙古族既保留了某些北方民族的特征,又与南方民族发生了频繁的基因交流。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Y染色体DNA遗传标记在汉藏语系民族研究中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    贵州医科大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张秀秀;何燕
  • 通讯作者:
    何燕
贵州三个世居少数民族24个Y-STR基因座的遗传多态性及遗传关系
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中华医学遗传学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    国学红;何燕;张秀秀;王婵娟;张婷;官志忠
  • 通讯作者:
    官志忠
贵州3个世居少数民族CCR5基因Δ32多态分布
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    广东医学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    国学红;何燕;张秀秀;王婵娟;张婷;官志忠
  • 通讯作者:
    官志忠
RANKL基因rs9594738位点与贵州燃煤污染型地氟病的相关性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    贵州医科大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    田薇;李鸣;喻艳琴;张秀秀;王婵娟;张婷;单可人;官志忠;何燕
  • 通讯作者:
    何燕
贵州壮族人群25个Y-STR基因座遗传多态性
  • DOI:
    10.13471/j.cnki.acta.snus.2018.03.016
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中山大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    国学红;何燕;张秀秀;张婷;王婵娟;官志忠
  • 通讯作者:
    官志忠

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原子模拟金属锆中点缺陷行为
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  • 发表时间:
    2022
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    刘治明
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李康
电针和艾灸刺激左右“天枢”穴对大鼠胃内压的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
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  • 作者:
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胚胎期暴露氰戊菊酯对中年CD-1小鼠空间学习记忆能力的影响
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    安徽农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    马汉;陈贵海;王飞;陶飞;徐德祥;何燕;李学伟
  • 通讯作者:
    李学伟

其他文献

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何燕的其他基金

贵州世居的12个汉藏语系少数民族遗传结构研究
  • 批准号:
    32360154
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    33 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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