乳酸乳球菌N8基因组精简与高产nisin生物合成的适配微调及功能肽的修饰研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31770102
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2102.合成生物学与生物改造技术
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Lactococcus lactis N8 is a recognized as food-grade microorganism which can produce natural antimicrobial peptides - nisin. Synthetic biology technology can be used to streamline the genome for constructing the optimal genomic cell chassis. The synergistic effect and the stable inheritance of product regulatory pathway can be achieved through combining the efficient promoter and the functional module adapter. The application of the food-grade L.lactis can be expanded, especially in terms of safe food and pharmaceutical products. This project intends to use synthetic biology techniques to reduce L. lactis genome. With the knockout of immune tolerance related genes irpT and feuD and the over-expression of immunity genes of nisI and nisFEG may improve nisin production in the cell chassis. Deletion of PKSs gene clusters such as pksC, pksB, pksA in L. lactis N8 and the genetic complement of those genes, respectively to reveal the coordinate regulation mechanism between synthesis of ribosomal peptide Nisin and non-ribosomal peptide PKSs. Finally achieving optimized genome chassis strains with high yield of nisin to provide reliable support to improve the level of industrialization of nisin and meet the needs of food preservatives of antimicrobial peptides in China. Using an optimized genome chassis with high nisin productivity could modify heterologous functional peptides in vivo efficiently, which can provide a new technical method to increase the stability and yield of drug based functional peptides.
乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)N8是公认食品级微生物,它可产生天然抗菌肽-乳链菌肽(Nisin)。利用合成生物学可精简基因组构建最优基因组底盘,通过与高效启动原件及功能模块适配可实现产物调节通路的协同及稳定遗传,可拓宽其在安全食品和重要医药等领域发挥更重要作用。本项目拟利用合成生物学技术手段,连续删减N8基因组构建底盘菌株;对nisin免疫耐受相关基因irpT和feuD敲除及nisI、nisFEG过表达微调N8免疫耐受能力,提高底盘细胞nisin产量;对N8菌中PKSs基因簇中pksC、pksB、pksA敲除及遗传互补,研究核糖体肽nisin与非核糖体肽PKSs合成之间协调机制。最终获得nisin高产最优基因组底盘菌株,提高nisin产业化水平,满足我国食品业对防腐剂需求。探索利用高产nisin优选底盘对外源功能肽有效环化修饰,为新型稳定性好生物多肽药物开发提供新技术。

结项摘要

乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)是公认的食品级微生物,它可以产生天然抗菌肽-乳链菌肽(Nisin)。利用合成生物学手段可精简乳酸乳球菌基因组从而构建最优底盘菌株,随后通过与高效启动元件及功能模块适配,可实现产物调节通路的协同及稳定遗传。通过阐明乳酸乳球菌多重压力耐受性机制,可拓宽其在安全食品和医药等领域的应用。本项目基于合成生物学技术手段成功建立且优化了乳酸乳球菌删减方法并对乳酸乳球菌基因组进行连续删减,构建的底盘菌株达到了目前国际上最大的精简程度;通过转录组的数据分析成功构建了乳酸乳球菌的强启动子元件文库;通过对影响乳酸乳球菌nisin耐受性的基因以及片段(feuD,irpT 和prophage-related fragment)的研究,成功构建了高nisin耐受性的底盘菌株。此外,我们探索了胞内nisin 合成系统对外源功能肽的有效修饰,构建了外源多肽类药物表达质粒pG-PSA,并且在乳酸乳球菌N8中成功的表达了 PSA也检测到环化后的PSA保持了特定的酶活;我们对乳酸乳球菌N8中PKSs基因簇中的pksC、pksB、pksA基因进行了敲除及遗传互补,研究了核糖体肽nisin与非核糖体肽PKSs之间的协调机制;我们还探索了2,3 -丁二醇脱氢酶的调控基因以及证明了乳酸菌生产2,3-丁二醇可能性;我们还利用 L. lactis N8共表达食品安全级抗菌肽nisin Z和leucocin C,扩大乳酸菌的杀菌范围。本项目最终获得的最优基因组底盘菌株减小了代谢负担,这对于nisin的生产以及高附加值的外源蛋白的表达是极为有利的,奠定了乳酸乳球菌作为食品安全级细胞工厂的重要基础;成功利用乳酸乳球菌实现外源功能肽的胞内有效环化修饰,为新型稳定性好的生物多肽药物开发提供新技术。本项目成果的推广将拓宽乳酸菌的安全食品和医药等领域的广泛应用。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Peptide dendrimers G3KL and TNS18 inhibit Pseudomonas aeruginosa biofilms
肽树枝状聚合物 G3KL 和 TNS18 抑制铜绿假单胞菌生物膜
  • DOI:
    10.1007/s00253-019-09801-3
  • 发表时间:
    2019-07-01
  • 期刊:
    APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Han, Xiao;Liu, Yujie;Qiao, Mingqiang
  • 通讯作者:
    Qiao, Mingqiang
Restructured Lactococcus lactis strains with emergent properties constructed by a novel highly efficient screening system
由新型高效筛选系统构建的具有新兴特性的重组乳酸乳球菌菌株
  • DOI:
    10.1186/s12934-019-1249-z
  • 发表时间:
    2019-11
  • 期刊:
    Microbial Cell Factories
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    Liu Fulu;Zhang Yating;Qiao Wanjin;Zhu Duolong;Xu Haijin;Saris Per Erik Joakim;Qiao Mingqiang
  • 通讯作者:
    Qiao Mingqiang
Redox Protein OsaR (PA0056) Regulates dsbM and the Oxidative Stress Response in Pseudomonas aeruginosa
氧化还原蛋白 OsaR (PA0056) 调节铜绿假单胞菌中的 dsbM 和氧化应激反应
  • DOI:
    10.1128/aac.01771-20
  • 发表时间:
    2021-03-01
  • 期刊:
    ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Liu, Yujie;Ma, Yibing;Qiao, Mingqiang
  • 通讯作者:
    Qiao, Mingqiang
Co-expression of Nisin Z and Leucocin C as a Basis for Effective Protection Against Listeria monocytogenes in Pasteurized Milk.
Nisin Z 和 Leucocin C 的共表达是有效预防巴氏杀菌牛奶中单核细胞增生李斯特氏菌的基础
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2018.00547
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Frontiers in microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Fu Y;Mu D;Qiao W;Zhu D;Wang X;Liu F;Xu H;Saris P;Kuipers OP;Qiao M
  • 通讯作者:
    Qiao M
OsaR (PA0056) Functions as a Repressor of the Gene fleQ Encoding an Important Motility Regulator in Pseudomonas aeruginosa
OsaR (PA0056) 作为铜绿假单胞菌中编码重要运动调节因子的基因 fleQ 的抑制子
  • DOI:
    10.1128/jb.00145-21
  • 发表时间:
    2021-08
  • 期刊:
    Journal of Bacteriology
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Ma Yibing;Liu Yujie;Bi Yutong;Han Xiao;Jin Yongxin;Xu Haijin;Qiao Mingqiang
  • 通讯作者:
    Qiao Mingqiang

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其他文献

疏水蛋白rHGFI与rHFBI的发泡能力研究
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  • 影响因子:
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  • 通讯作者:
    乔明强
利用双向电泳技术分离乳酸乳球菌N8菌体蛋白
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    --
  • 发表时间:
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    南开大学学报(自然科学版)
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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Nisin生产菌株Lactococcus lactis N302的发酵优化
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  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    南开大学学报(自然科学版)
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其他文献

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乔明强的其他基金

铜绿假单胞菌DsbM调控抗氧化系统导致细菌耐药机制的研究
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相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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