整合素miRNA靶基因3'UTR内SNPs与胃癌侵袭与转移的关系及后续功能分析

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81101326
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2605.分子生物学检验
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31
  • 项目参与者:
    王军; 李冬冬; 周易; 魏永刚; 刘博; 陈克霏; 刘嘉铭; 张君龙; 周娟;
  • 关键词:

项目摘要

近期研究表明,miRNA 靶基因3′UTR 内存在的SNPs影响了miRNA 与靶基因结合导致基因表达失调,与胃癌的侵袭与转移之间具有显著相关性,但SNPs调控胃癌侵袭与转移的分子机制尚不清楚。申请者前期研究发现,整合素基因的3′UTR 区miRNA靶点内SNPs与胃癌的局部浸润深度具有显著相关性。为探讨miRNA 靶基因3′UTR 内SNPs是否以及如何参与与胃癌侵袭与转移,本课题拟采用生物信息学方法在整合素基因的3′UTR 内预测目前已知miRNA的结合靶点,在靶点内筛选候选SNPs。利用HRM技术,在不同临床程度的胃癌患者与正常对照人群中对候选SNPs进行基因分型,筛选出差异性SNPs,并验证其与胃癌侵袭与转移的关联性,通过分子生物学方法深入研究这些SNPs在胃癌侵袭与转移发生过程中的分子信号通路以及与相关miRNA的作用机制,为最终阐明遗传变异影响胃癌侵袭与转移的分子机理奠定基础。

结项摘要

本课题研究了整合素miRNA靶基因3'UTR内SNPs与胃癌侵袭与转移的关联性,探讨这些SNPs在胃癌侵袭与转移发生过程中的分子信号通路以及与相关miRNA的作用机制。6个SNPs的基因分型结果显示:rs2675位点CC基因型个体较AA基因型个体患胃癌风险明显降低,提示携带rs2675位点AA基因型的个体有较高的患胃癌的风险。分析SNPs与胃癌侵袭与转移以及其它临床资料的关系,结果显示:携带rs2675 AA基因型和rs17664 GG基因型和G等位基因的个体胃癌分期处于1b期的风险明显低于1a期;携带rs17664 GG基因型和G等位基因的个体胃癌淋巴结转移处于3b期的风险明显高于0期;携带rs3809865 AA基因型和A等位基因的个体胃癌临床分期处于4期的风险明显高于1a期。SNP功能研究结果显示:miR124-3p与整合素基因3'UTR区SNP rs3809865结合,上调基因表达,miR-124-3p与rs3809865A的结合能力显著强于rs3809865T;miR-578与整合素基因3'UTR区SNP rs2675结合,上调基因表达,miR-578与rs2675A的结合能力显著强于rs2675C;miR-4484与整合素基因3'UTR区SNP rs17664结合,上调基因表达,miR-4484与rs17664G的结合能力显著强于rs17664A。调控miRNA成熟通路相关基因SNPs与胃癌的关系研究,结果显示:rs3742330位点GG基因型个体较AA基因型个体患胃癌风险明显降低,携带rs3742330 G等位基因较A等位基因患胃癌风险降低27%。提示携带rs3742330位点AA基因型和A等位基因的个体有较高的患胃癌的风险。rs3742330位于DICER 3'UTR 区hsa-miR-632结合靶点区,G等位基因通过破坏DICER mRNA的局部结构改变了miRNA-mRNA结合的亲和力,从而上调DICER表达。携带rs3742330 AA基因型的个体胃癌淋巴结转移处于1期的风险明显低于0期;携带rs7813 CC基因型和C等位基因的个体胃癌淋巴结转移处于3期的风险明显低于0期;携带rs7813 CT基因型的个体不易发生胃癌远处转移。在本课题的资助下,已发表SCI论文6篇,国内核心期刊5篇。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(8)
专利数量(0)
miRNA成熟通路相关基因SNPs与精分的相关性研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    J Mol Neurosci
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周易
  • 通讯作者:
    周易
肌钙蛋白 T 和 CRP 在急性心肌梗死中的应用价值
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    现代中西医结合杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    胡宏章;车辉娟;唐虹;等
  • 通讯作者:
strongAssociation between SNPs in microRNA-machinery genes and tuberculosis susceptibility in Chinese Tibetan population/strong
microRNA-机器基因中的SNP与中国藏族人群结核病易感性的关联
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Molecular Biology Reports
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Zhou Y;Hu X;Zhou J;Lu X;Wang J;Hua W;Ye Y;Ying B;Wang L
  • 通讯作者:
    Wang L
Evaluation of Six SNPs of MicroRNA Machinery Genes and Risk of Schizophrenia
MicroRNA机械基因的6个SNP与精神分裂症风险的评估
  • DOI:
    10.1007/s12031-012-9887-1
  • 发表时间:
    2013-03
  • 期刊:
    Journal of Molecular Neuroscience
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Zhou Y, Wang J, Lu X, Song X, Ye Y, Zhou J, Ying B, Wang L.
  • 通讯作者:
    Zhou Y, Wang J, Lu X, Song X, Ye Y, Zhou J, Ying B, Wang L.
Association between polymorphisms of microRNA-binding sites in integrin genes and gastric cancer in Chinese Han population
中国汉族人群整合素基因microRNA结合位点多态性与胃癌的相关性
  • DOI:
    10.1007/s13277-014-2903-z
  • 发表时间:
    2015-04-01
  • 期刊:
    TUMOR BIOLOGY
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Song, Xingbo;Zhong, Huiyu;Wang, Lanlan
  • 通讯作者:
    Wang, Lanlan

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    范红
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 作者:
    丁柳;周易;宋兴勃;刘显中;陆小军;应斌武
  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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