我国新发现的14、55型腺病毒的生物学特性与基因组重组机制的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31370199
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    77.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0107.病毒学
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Acute respiratory disease infection outbreaks caused by human adenovirus types 14 and 55 (HAdV-14 and -55) were reported in China and other countries recently. HAdV-55 is a recombinant between HAdV-11 and -14, about which little is known. Based on our work on adenovirus molecular epidemiology, comparative genomics and recombinant adenovirus construction, the whole genomes of several new adenovirus isolates will be sequenced, including two of HAdV-14 and five of HAdV-55. Comparative genomic analyses are then used, with archived GenBank genomes, to reveal further the specific characteristics of genome variability. Secondly, comparative studies of adenovirus virulence, replication kinetics, infectivity, toxicity and receptors of both types will facilitate the evaluation of the differences of biological characteristics and clarify the importance of recombination in the genesis of future adenovirus pathogens. Finally, the in vitro genome recombination mechanism will be studied by the co-infection of host cells with HAdV-11 and -14, followed by continuous passages under simulated natural selection with antiserum immune pressure. The viral genomic variations will be monitored and recombination hotspots and frequencies will be quantitated. The mechanism of viral genome recombination centers on the hypothesis that "co-infection by two types of adenoviruses may result in genome recombination which enhances immune evasion under immune pressure". This will be validated and understood better. This research on adenovirus biological characteristics, comparative genomics and in vitro genome recombination mechanism will provide a scientific basis for adenoviral disease prevention and control, particularly for predicting future recombinants should there be hotspots, and also for vaccine development in future.
近年来人14、55型腺病毒引起的急性呼吸道感染在我国及世界上频频暴发,55型腺病毒由11、14型腺病毒重组产生,对该病毒知之甚少。本课题在前期腺病毒分子流行病学、比较基因组学、重组病毒构建等工作基础上,①对新分离的2株14型、5株55型腺病毒,通过全基因组测序和比较基因组学分析,揭示病毒基因组变异特点;②对病毒的毒力、复制动力学、感染性与毒性、受体等进行对比研究,评价两种型别腺病毒的生物学特性及差异,阐明重组对病毒的影响;③通过11、14型腺病毒共感染宿主细胞,在抗血清免疫压力作用下连续传代,模拟自然选择,监测病毒基因组变异,寻找重组热点及频率,探索腺病毒基因组的重组机制,验证"异型腺病毒共感染,在免疫压力作用下发生基因组重组、增强免疫逃逸"的假说。通过以上对腺病毒生物学特性、比较基因组学、体外基因组重组机制的研究,为今后腺病毒性疾病防控、疫苗研制特别是预测可能的重组腺病毒提供科学依据。

结项摘要

本研究针对近年来在我国及世界上频频暴发的人14、55型腺病毒,在前期腺病毒分子流行病学、比较基因组学、重组病毒构建等工作基础上,对新分离的14型、55型腺病毒,开展了全基因组测序和比较基因组学分析,发现我国新发的 14型腺病毒可能是由国外传入我国;此外我们还发现55型腺病毒可引起严重的家庭聚集性呼吸道感染甚至是致死性肺炎;55型腺病毒基因组相对比较保守,衣壳蛋白基因无明显变异,因此有助于今后疫苗的研发。进一步对父本的11、14型腺病毒进行病毒的毒力、复制动力学、感染性与毒性、受体等对比研究,发现三种型别的腺病毒的生物学特性无明显差异;进一步构建11、14型腺病毒共感染宿主细胞的细胞模型,通过测序监测病毒基因组的变异,发现腺病毒基因组的重组热点位于六邻体基因,重组频率最高的位置位于六邻体基因的HVR6和HVR7之间,这表明异型腺病毒共感染,极易发生基因组的重组,重组易发生在六邻体基因内。以上对腺病毒生物学特性、比较基因组学、体外基因组重组机制的研究,为今后腺病毒疾病防控、疫苗研制特别是预测可能出现的新的重组腺病毒提供了有力的科学依据。本课题在执行期间,在专业学术期刊上以通讯作者发表SCI论文4篇:影响因子大于4的论文3篇,大于5的论文1篇。项目负责人入选广东省特支计划“青年拔尖人才”,广东省优秀青年教师,并受聘为中国微生物学会医学微生物学专委会、中国微生物学会病毒学专委会:青年委员,中华医学会全国儿科临床病毒学协作组委员。已培养硕士研究生3名,博士研究生1名,在读硕士生4名,博士3名,即将毕业硕士1名、博士1名。项目负责人先后8次在国内和国际学术会议上做大会报告,并到美国哈佛大学医学院访学,邀请美国教授来我校做学术交流,这大大推动了中国腺病毒的研究,也加深了国内外同行对中国腺病毒研究的关注。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(16)
专利数量(0)
Comparative genomic analysis of two emergent human adenovirus type 14 respiratory pathogen isolates in China reveals similar yet divergent genomes.
中国两种新出现的人类腺病毒 14 型呼吸道病原体分离株的比较基因组分析揭示了相似但不同的基因组
  • DOI:
    10.1038/emi.2017.78
  • 发表时间:
    2017-11-01
  • 期刊:
    Emerging microbes & infections
  • 影响因子:
    13.2
  • 作者:
    Zhang Q;Jing S;Cheng Z;Yu Z;Dehghan S;Shamsaddini A;Yan Y;Li M;Seto D
  • 通讯作者:
    Seto D
Pitfalls of restriction enzyme analysis in identifying, characterizing, typing, and naming viral pathogens in the era of whole genome data, as illustrated by HAdV type 55
全基因组数据时代限制性内切酶分析在识别、表征、分型和命名病毒病原体方面的缺陷(如 HAdV 55 型所示)
  • DOI:
    10.1007/s12250-016-3862-x
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Virologica Sinica
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Zhang Qiwei;Dehghan Shoaleh;Seto Donald
  • 通讯作者:
    Seto Donald
Re-emergent human adenovirus genome type 7d caused an acute respiratory disease outbreak in Southern China after a twenty-one year absence.
人类7d基因组腺病毒在消失二十一年后再次出现,在中国南方引发了急性呼吸道疾病的爆发。
  • DOI:
    10.1038/srep07365
  • 发表时间:
    2014-12-08
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Zhao S;Wan C;Ke C;Seto J;Dehghan S;Zou L;Zhou J;Cheng Z;Jing S;Zeng Z;Zhang J;Wan X;Wu X;Zhao W;Zhu L;Seto D;Zhang Q
  • 通讯作者:
    Zhang Q
Fatal Community-acquired Pneumonia in Children Caused by Re-emergent Human Adenovirus 7d Associated with Higher Severity of Illness and Fatality Rate.
由重新出现的人类腺病毒 7d 引起的致命儿童社区获得性肺炎与较高的疾病严重程度和死亡率相关
  • DOI:
    10.1038/srep37216
  • 发表时间:
    2016-11-16
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Yu Z;Zeng Z;Zhang J;Pan Y;Chen M;Guo Y;Yu N;Chodosh J;Fu N;Che X;Zhang Q
  • 通讯作者:
    Zhang Q

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

其他文献

肠出血型大肠埃希菌O157:H7espF基因缺失株和回补株的构建
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    南方医科大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    华颖;孙琦;王湘雨;杜艳丽;邵娜;张其威;赵卫;万成松
  • 通讯作者:
    万成松

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败,请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题,我已根据课题信息分析并撰写以下内容,帮您拓宽课题思路:

AI项目思路

AI技术路线图

张其威的其他基金

人腺病毒免疫抑制小鼠感染模型的建立及其致病机制的研究
  • 批准号:
    31570155
  • 批准年份:
    2015
  • 资助金额:
    62.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
人3型、7型腺病毒双价减毒重组疫苗候选株的构建及免疫原性研究
  • 批准号:
    31100133
  • 批准年份:
    2011
  • 资助金额:
    21.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
关闭
close
客服二维码