青少年骨密度的罕见变异和Hi-C研究及其在骨质疏松和骨折中的效应
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:81871831
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:58.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:H0611.运动系统疾病研究新技术与新方法
- 结题年份:2022
- 批准年份:2018
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2019-01-01 至2022-12-31
- 项目参与者:刘克琦; 丛培宽; 赵翩翩; 朱晓薇; 白维扬; 徐锦健; 尹琼; 许学进; 胡丽雅;
- 关键词:
项目摘要
Osteoporosis is characterized by a decrease in bone mineral density and an increased risk of fracture. Peak bone density determines bone strength and fracture risk in adulthood. To date, there have been only two original GWAS in osteoporosis in Han Chinese, and no "rare variant" research has been conducted. In addition, the three-dimensional structure of osteoblast chromosomes has not been studied. The applicant have long been engaged in the genetics study of osteoporosis and identified common and rare variants of WNT6, MEF2C and EN1 gene for bone mineral density and fracture. The applicant was also invited to contribute several review papers on the genetic study of osteoporosis. At present, the applicant is organizing the establishment of Westlake Adolescent Cohort. Based on the previous research experiences, the research objectives of this project are: ①To estimate the heritability of bone mineral density among adolescents in Han Chinese. ② To identify the rare variants for bone mineral density in susceptible areas, which have a large effect on BMD in adolescents in Chinese Han population. ③ By Hi-C sequencing, the three-dimensional structure of the osteoblast chromosome is to be investigated to reveal the regulatory network in the susceptible region in order to determine the "true" pathogenic genes.
骨质疏松症的特点是骨密度降低和骨折风险增加。青少年生长突增所达到骨量峰值是决定成年后骨骼强度和脆性骨折风险的主要因素。迄今为止,在汉族人中,骨质疏松症的基因组遗传变异原始研究只有两个,并没有“罕见变异”研究的开展。另外,成骨细胞染色体上的三维结构研究亦未开展。申请人一直从事骨质疏松遗传变异研究,先后发现了 WNT6,MEF2C, EN1基因的“常见变异”和“罕见变异”对骨密度和骨折的作用。目前,申请人作为负责人正在组建中国青少年研究队列。基于申请人前期的研究基础,本项目的研究目标是:①估计中国汉族人青少年骨密度的遗传度。②在骨密度的易感区域中,鉴定对中国汉族人青少年骨密度影响效应较大的编码“罕见变异”,并在骨质疏松和骨折中加以验证。 ③通过Hi-C测序,研究成骨细胞染色体上的三维结构,揭示易感基因区域远程调控元件介导的分子网络,以期确定骨质疏松症遗传易感区域内“真正”致病基因。
结项摘要
在本项研究中,我们利用本课题组构建的西湖(中国)生物样本数据库(Westlake BioBank for Chinese,WBBC),主要关注青春期晚期研究对象的生长发育和骨健康。我们共招募到14,726名年龄在14-25岁的志愿者,其中4,751名男性和9,975名女性。在该研究中,青年男性的平均身高是172.9cm,女性是160.1cm;男性平均体重65.81kg,女性52.9kg。我们发现女性体重不足的患病率远高于男性,但超重和肥胖的患病率低于男性。14,726名年轻参与者的血清25(OH)D水平平均值为22.4±5.3 ng/ml,男性的血清25(OH)D水平高于女性。总体而言,33.5%的参与者患有维生素D缺乏,其中女性的缺乏比例远高于男性(41.8% vs. 16.4%),参与者患有维生素D不足的更多(58.2%)。研究发现性别和骨密度(Bone mineral density, BMD)显著相关,男性的BMD均大于女性,且女性发生骨质减少的风险高于男性。此外,生活习惯与BMD也有显著相关性,尤其是运动和牛奶摄入,显著提高骨密度,但没有发现吸烟和饮酒对BMD的影响;睡眠质量与BMD呈正相关性,而睡眠障碍和BMD呈负相关性,另外,我们发现起床时间与BMD有负性相关,且是骨质减少的保护作用。在本文中,整体上,维生素D水平与骨密度之间呈正相关性;和维生素D充足的人相比,维生素D缺乏和不足都是骨密度和骨质减少的危险因素。但在性别亚组分析中,上述结果只在男性中显著。此外,本研究获得6,004例全基因组芯片数据和1,200例全基因组测序数据,对中国青少年人群中进行4个常见易骨折部位的骨密度进行全基因组关联分析研究,寻找到一些候选基因和拷贝数变异(CNV)等遗传因素,其中,大部分经典的骨密度相关基因CPED1、WNT16、FAM3C、CCDC170、DKK2等在我们研究中同样得到验证。另外,我们还提供了一些候选CNVs,其中发现的UGT2B17基因拷贝数,已被文献报道跟中国人群骨密度显著相关,其它发现的CNVs也都是跟身体发育性状相关,可以作为候选遗传因素。
项目成果
期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Identification of PIEZO1 polymorphisms for human bone mineral density
人骨矿物质密度 PIEZO1 多态性的鉴定
- DOI:--
- 发表时间:2020
- 期刊:Bone
- 影响因子:4.1
- 作者:Bai WY;Wang L;Ying ZM;Hu B;Xu L;Zhang GQ;Cong PK;Zhu X;Zou W;Zheng HF
- 通讯作者:Zheng HF
Comprehensive assessment of the association between genes on JAK-STAT pathway (IFIH1, TYK2, IL-10) and systemic lupus erythematosus: a meta-analysis. (唯一通讯)
- DOI:doi:10.1007/s00403-018-1858-0
- 发表时间:2018
- 期刊:Arch Dermatol Res
- 影响因子:3
- 作者:Yin Q;Wu LC;Zheng L;Han MY;Hu LY;Zhao PP;Bai WY;Zhu XW;Xia JW;Wang XB;Zhang XW;Zheng HF
- 通讯作者:Zheng HF
Genotype imputation and reference panel: a systematic evaluation on haplotype size and diversity (IF=11.622)
基因型插补和参考组:对单倍型大小和多样性的系统评估(IF=11.622)
- DOI:10.1093/bib/bbz108
- 发表时间:2019
- 期刊:Brief Bioinform
- 影响因子:9.5
- 作者:Bai WY;Zhu XW;Cong PK;Zhang XJ;Richards JB;Zheng HF
- 通讯作者:Zheng HF
Systemic evaluation of the relationship between psoriasis, psoriatic arthritis and osteoporosis: observational and Mendelian randomisation study (IF=19.103)
银屑病、银屑病关节炎和骨质疏松症之间关系的系统评估:观察性和孟德尔随机研究(IF=19.103)
- DOI:--
- 发表时间:2020
- 期刊:Ann Rheum Dis
- 影响因子:27.4
- 作者:Xia J;Xie SY;Liu KQ;Xu L;Zhao PP;Gai SR;Guan PL;Zhao JQ;Zhu YP;Tsoi LC;Stuart PE;Nair RP;Yang HQ;Liao YT;Mao K;Qiu MC;Ying ZM;Hu B;Yang ZH;Bai WY;Zhu XW;Cong PK;Elder JT;Ye ZM;Wang B;Zheng HF
- 通讯作者:Zheng HF
Integrative analysis of genomic and epigenomic data reveal underlying superenhancer-mediated microRNA regulatory network for human bone mineral density.
基因组和表观基因组数据的综合分析揭示了潜在的超级增强子介导的 microRNA 对人类骨矿物质密度的调节网络。
- DOI:--
- 发表时间:2021
- 期刊:Hum Mol Genet
- 影响因子:3.5
- 作者:Bai WY;Xia JW;Rong XL;Cong PK;Khederzadeh S;Zheng HF
- 通讯作者:Zheng HF
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:{{ item.doi || "--"}}
- 发表时间:{{ item.publish_year || "--" }}
- 期刊:{{ item.journal_name }}
- 影响因子:{{ item.factor || "--"}}
- 作者:{{ item.authors }}
- 通讯作者:{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:{{ item.authors }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:{{ item.authors }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:{{ item.authors }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:{{ item.authors }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
其他文献
华东某高校青少年人群血清维生素 D 水平:WBBC 数据
- DOI:--
- 发表时间:2018
- 期刊:中华内分泌代谢杂志
- 影响因子:--
- 作者:朱晓薇;白维扬;郑厚峰
- 通讯作者:郑厚峰
骨质疏松症及其相关表型的基因组遗传变异研究
- DOI:--
- 发表时间:2017
- 期刊:中华内分泌代谢杂志
- 影响因子:--
- 作者:朱晓薇;赵翩翩;郑厚峰
- 通讯作者:郑厚峰
以GWAS大数据为基础的孟德尔随机化方法探索脆性骨折的临床风险因素
- DOI:--
- 发表时间:2018
- 期刊:中华内分泌代谢杂志
- 影响因子:--
- 作者:徐锦健;夏江威;郑厚峰
- 通讯作者:郑厚峰
其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:{{ item.doi || "--" }}
- 发表时间:{{ item.publish_year || "--"}}
- 期刊:{{ item.journal_name }}
- 影响因子:{{ item.factor || "--" }}
- 作者:{{ item.authors }}
- 通讯作者:{{ item.author }}
内容获取失败,请点击重试
查看分析示例
此项目为已结题,我已根据课题信息分析并撰写以下内容,帮您拓宽课题思路:
AI项目摘要
AI项目思路
AI技术路线图
请为本次AI项目解读的内容对您的实用性打分
非常不实用
非常实用
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
您认为此功能如何分析更能满足您的需求,请填写您的反馈:
相似国自然基金
{{ item.name }}
- 批准号:{{ item.ratify_no }}
- 批准年份:{{ item.approval_year }}
- 资助金额:{{ item.support_num }}
- 项目类别:{{ item.project_type }}
相似海外基金
{{
item.name }}
{{ item.translate_name }}
- 批准号:{{ item.ratify_no }}
- 财政年份:{{ item.approval_year }}
- 资助金额:{{ item.support_num }}
- 项目类别:{{ item.project_type }}