基于磁性氟氟相互作用的翻译后修饰蛋白质选择性分离富集新技术新方法的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21275033
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0404.化学与生物传感
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Many vital living processes are controlled by post-translational modifications with specific spatial and temporal distributions. Consequently,it is important for comprehending complex biological functions of proteins to reveal the post-translational modification occurrence.Because of the low stoichiometry and broad dynamic range,research on the post-translational modified proteins is still a big technical challenge. Development of novel techniques for separation and enrichment of post-translational modified proteins is extremely urgent. The main purpose of this research is that we aim to develop a novel technique for post-translational modifications enrichment and detection based on fluorous functional magnetic materials. These methodologies rely on fluorine-fluorine interactions between the fluorous modified peptides and the fluorous modified magnetic material. Typically, target proteins with PTMs (such as phosphorylation and glycosylation) are first digested. The modified peptides are then selectively labeled with fluorous tags through chemoselective reactions. After incubation in a minimum amount of organic solvent, the labeled peptides will bind strongly to a fluorous-bonded magnetic microspheres, while the unlabeled compounds remain unbound. After elution, the labled modified peptides are analyzed by LC-MS. Finally the post-translational modified proteins were identified by the analysis of mass spectrometrum. In this way, the fluorous-labeled modified peptides from different modified proteins can be captured at the same time,using the same fluorous modified magnetic material. Therefre, the proposed technique is useful for all the modified proteins.Finally, the proposed technique will be applied to the study of the post-translational modified proteins in liver cancer samples. We expect, new and important post-translational modified protein biomarkers will be found in liver cancer.
蛋白质的翻译后修饰对生物功能的发挥有着至关重要的作用,开展翻译后修饰蛋白质组学研究有重要的科学意义。翻译后修饰蛋白质大多数为中低丰度蛋白,现有的蛋白质组学技术还不能对生物体内的修饰蛋白质进行全面的规模化分析,因此发展翻译后修饰蛋白质的选择性分离富集技术迫在眉睫。本研究拟发展基于磁性氟氟作用的修饰蛋白质分离富集通用型新技术。修饰蛋白(如糖蛋白质和磷酸化蛋白质)酶解得到的修饰肽段经选择性高氟标记后,用亲水性好的固定高氟的磁性碳微球进行高选择性分离富集。从磁碳球上洗脱下来的标记高氟的修饰肽段经色谱质谱分析,最后鉴定修饰蛋白质。不同修饰蛋白质的修饰肽段采用不同的高氟探针进行标记,用相同的固定高氟的磁性微球可以同时进行分离富集,因此该技术是通用性的翻译后修饰蛋白质分离富集新技术。最后,我们把这通用性的分离分析鉴定技术平台将应用于肝癌的修饰蛋白质组学研究中,分析鉴定新的疾病标记的修饰蛋白质。

结项摘要

在国家自然科学基金的支持下,我们开展了基于氟氟相互作用的磷酸化肽/糖基化肽选择性分离富集新技术新方法的研究。高氟烷基修饰的磁性介孔微球被设计及合成,并通过氟氟相互作用被应用于氟相衍生的磷酸化肽的高特异性富集。高氟材料成功地从β-casein酶解液、β-casein酶解液与蛋白的混合溶液和人体血清中选择性富集了氟相衍生的磷酸化肽。这个新型复合材料取得了对于非磷酸化肽摩尔比1:1000的选择性,并被证明对于人血清样品中内源性磷酸化肽的富集同样可行(Proteomics, 2016, 16, 1051-1058)。在糖基化肽段富集研究方面,我们合成了高氟烷基键合的、介孔硅包覆的磁性纳米颗粒,并用于N-糖链的特异性富集。这个基于磁性纳米颗粒的FSPE策略成功从0.5 μg/μL的OVA酶解液中鉴定到22条氟相衍生的N-糖链,并取得了5 ng/μL的检测限(从中检测到16条N-糖链)。这个方法还展示了良好的重复性(不同实验日所得实验结果之间)。该方法所取得的对BSA蛋白的选择性是摩尔比1:200,展现了良好的体积排阻效果。另外,该方法被证明对于人血清酶解液的分析也有效,为生物环境中糖链与蛋白质其它翻译后修饰检测提供了新视角(Talanta, 2016, 159, 111-116)。.此外,我们还开展了功能化磁性石墨烯@聚多巴胺新复合材料固定酶新技术和低丰度肽富集新方法;系统发展了MOF功能化磁性材料的磷酸化肽分离富集新方法;发展了碳修饰的石墨烯介孔硅等新型材料的糖链分离富集新方法;发展了聚苯硼酸的大孔介孔硅复合材料和两性亲水复合纳米材料用于糖肽富集的研究等。研究成果将为大规模蛋白质组学研究提供了很好的样品前处理新技术和新方法。.总的来说,在国家自然科学基金的支持下,本课题在蛋白组学分析样品预处理方面做了大量研究工作,科研成果丰硕。我们在国际核心期刊上发表SCI论文30余篇,包括著名化学与材料期刊 Angew. Chem. Int. Ed. (1篇),蛋白质组学期刊Proteomics(6篇),Chem. Commun. (1篇)等;申请并获授权专利3项,另有两项发明专利已公开;培养了6名硕士研究生,2位博士研究生。.由于出色研究工作, 我们受邀撰写了相关研究的综述发表于 Chem. Soc. Rev., 2013, 42, 8517-8539

项目成果

期刊论文数量(31)
专著数量(0)
科研奖励数量(2)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Synthesis of Fe3O4/Graphene/TiO2 Composites for the Highly Selective Enrichment of Phosphopeptides from Biological Samples
Fe3O4/石墨烯/TiO2 复合材料的合成用于生物样品中磷酸肽的高选择性富集
  • DOI:
    10.1021/am401662b
  • 发表时间:
    2013-08-14
  • 期刊:
    ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES
  • 影响因子:
    9.5
  • 作者:
    Lu, Jin;Deng, Chunhui;Yang, Pengyuan
  • 通讯作者:
    Yang, Pengyuan
Design and synthesis of magnetic binary metal oxides nanocomposites through dopamine chemistry for highly selective enrichment of phosphopeptides
通过多巴胺化学设计和合成磁性二元金属氧化物纳米复合材料,用于高选择性富集磷酸肽
  • DOI:
    10.1002/pmic.201500277
  • 发表时间:
    2016-03
  • 期刊:
    Proteomics
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Wang, Mengyi;Sun, Xueni;Li, Yan;Deng, Chunhui
  • 通讯作者:
    Deng, Chunhui
Immobilized metal ion affinity chromatography ZipTip pipette tip with polydopamine modification and Ti4+ immobilization for selective enrichment and isolation of phosphopeptides
固定化金属离子亲和层析 ZipTip 移液器吸头,经过聚多巴胺修饰和 Ti4 固定,用于选择性富集和分离磷酸肽
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Talanta
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Shi, Chenyi;Deng, Chunhui
  • 通讯作者:
    Deng, Chunhui
Designed synthesis of MOF-derived magnetic nanoporous carbon materials for selective enrichment of glycans for glycomics analysis
MOF 衍生的磁性纳米多孔碳材料的设计合成,用于选择性富集用于糖组学分析的聚糖
  • DOI:
    10.1039/c5nr00244c
  • 发表时间:
    2015-01-01
  • 期刊:
    NANOSCALE
  • 影响因子:
    6.7
  • 作者:
    Sun, Nianrong;Zhang, Xiangmin;Deng, Chunhui
  • 通讯作者:
    Deng, Chunhui
Facile synthesis of Cu2+-modified mesoporous silica-coated magnetic graphene composite for enrichment of microcystin-LR followed by mass spectrometry analysis
轻松合成 Cu2 修饰的介孔二氧化硅涂覆的磁性石墨烯复合材料,用于富集微囊藻毒素-LR,然后进行质谱分析
  • DOI:
    10.1016/j.talanta.2016.03.064
  • 发表时间:
    2016-07-01
  • 期刊:
    TALANTA
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Liu, Shasha;Deng, Chunhui;Zhang, Xiangmin
  • 通讯作者:
    Zhang, Xiangmin

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一种基于竞争型群体优化的数据聚类方法
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  • 发表时间:
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    --
  • 作者:
    秦映波;曹步清;邓春晖
  • 通讯作者:
    邓春晖

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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