新显微活细胞微操方法的建立以及在细菌生物被膜研究中的应用

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21774117
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    64.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0309.高分子物理与高分子物理化学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Micromanipulation of living cell is a modern technique that can precisely manipulate the positions or morphologies of multiple living cells, thus has been broadly applied in bio-related studies. However, the methods that can manipulate the genes expressions, signal transductions or phenotypes of living cells in a high throughput, non-invasion as well as in single-cell scale manners are rather limited. By using a combination of interactive micro-projection and optogenetics tools, here, we first propose a research plan that can 1) simultaneously monitor and manipulate the genes expressions, the concentrations of the second messengers and small RNAs (sRNA) in the single bacteria; and 2) precisely control the bacterial behaviors (i.e., surface motilities, surface attaching/detaching and microcolonies formations) on the surface and the morphologies of mature biofilms. By using this novel method, second, we will systemically investigate the interrelatedness among the bacterial behaviors, the specific genes expressions, the concentrations of the second messengers and sRNA during the Pseudomonas aeruginosa biofilms formation. Finally, we will try to precisely guide the biofilms formation in a programmable way using our method.
现代显微活细胞微操技术是一种集成了可对活细胞状态进行精确操纵、表征的重要研究手段。现今的显微活细胞微操技术多数只能对活细胞的空间位置以及形貌进行操控,而无法高通量、无损伤的对细胞内的基因表达、信号通路以及细胞生理行为进行精确操控。因此,我们拟将显微光学、光遗传学和微生物学中多种技术相结合,开发一整套新显微活细胞微操技术并将该技术应用于与细菌生物被膜相关的基础研究中。从而在细菌生物被膜形成过程中高通量、无损伤的实现:1)对菌内多种重要基因表达、第二信使分子浓度以及小RNA浓度的正交操控和监测;2)通过对以上因素的精确控制,实现对细菌的运动行为、粘附状态、细菌间菌落形成等关键细菌行为以及后续所形成生物被膜结构的精确控制。我们将以铜绿假单胞菌为模型通过所建立的新方法对菌内重要基因表达、第二信使分子浓度以及小RNA浓度的实施精确控制,从而进一步揭示其生物被膜形成、发展、成熟的内在分子机制。

结项摘要

现代显微活细胞微操技术是一种集成了可对活细胞状态进行精确操纵、表征的重要研究手段。现今的显微活细胞微操技术多数只能对活细胞的空间位置以及形貌进行操控,而无法高通量、无损伤的对细胞内的基因表达、信号通路以及细胞生理行为进行精确操控。因此,我们将显微光学、光遗传学和微生物学中多种技术相结合,开发一整套新显微活细胞微操技术并将该技术应用于与细菌生物被膜相关的基础研究中。从而在细菌生物被膜形成过程中高通量、无损伤的实现:1)在单细胞水平对菌内第二信使分子浓度的连续正交操控和监测,揭示了铜绿假单胞菌表面感知的异质性引起种群劳动的分工;2)通过对关键基因、第二信使分子浓度的精确控制,实现对细菌的运动行为、粘附状态、细菌间菌落形成等关键细菌行为以及后续所形成生物被膜结构的精确控制;3)通过显微活细胞微操技术实现高精度的活菌3D打印;4)建立多色荧光报告质粒工具箱及多色荧光成像信号分离的方法,实现高通量监测单细菌内多个基因组成的网络。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
合成生物学在感染性疾病防治中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    合成生物学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    蒲潞;黄亚佳;杨帅;金帆
  • 通讯作者:
    金帆
Simultaneous Visualization of Multiple Gene Expression in Single Cells Using an Engineered Multicolor Reporter Toolbox and Approach of Spectral Crosstalk Correction
使用工程化的多色报告工具箱和光谱串扰校正方法同时可视化单细胞中的多个基因表达
  • DOI:
    10.1021/acssynbio.9b00223
  • 发表时间:
    2019-11-01
  • 期刊:
    ACS SYNTHETIC BIOLOGY
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Han, Jundong;Xia, Aiguo;Jin, Fan
  • 通讯作者:
    Jin, Fan
Optogenetic Modification of Pseudomonas aeruginosa Enables Controllable Twitching Motility and Host Infection
铜绿假单胞菌的光遗传学修饰可实现可控的抽搐运动和宿主感染
  • DOI:
    10.1021/acssynbio.0c00559
  • 发表时间:
    2021-03-05
  • 期刊:
    ACS SYNTHETIC BIOLOGY
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Xia,Aiguo;Qian,Mingjie;Jin,Fan
  • 通讯作者:
    Jin,Fan
Engineering Gac/Rsm Signaling Cascade for Optogenetic Induction of the Pathogenicity Switch in Pseudomonas aeruginosa
工程 Gac/Rsm 信号级联用于光遗传学诱导铜绿假单胞菌致病性开关
  • DOI:
    10.1021/acssynbio.1c00075
  • 发表时间:
    2021-06-02
  • 期刊:
    ACS SYNTHETIC BIOLOGY
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Cheng, Xinyi;Pu, Lu;Jin, Fan
  • 通讯作者:
    Jin, Fan
Imaging the Separation Distance between the Attached Bacterial Cells and the Surface with a Total Internal Reflection Dark-Field Microscope
使用全内反射暗场显微镜对附着的细菌细胞与表面之间的间隔距离进行成像
  • DOI:
    10.1021/acs.langmuir.9b01378
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Langmuir
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Xia Aiguo;Yang Shuai;Zhang Rongrong;Ni Lei;Xing Xiaochen;Jin Fan
  • 通讯作者:
    Jin Fan

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    --
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  • 通讯作者:
    金帆

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铜绿假单胞菌胞外聚合物性质及功能的高通量原位研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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