TTX合成相关基因在河鲀体内各种产TTX共生细菌间的水平转移规律

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41176108
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

与河鲀等共生的细菌具有生产河鲀毒素(TTX)的能力,而对于河鲀等含TTX的真核生物是否具有合成TTX的能力,目前还没有定论。此外,目前也不清楚TTX生物合成的具体途径。进化关系不是很密切的细菌具有产TTX能力,表明与TTX生物合成相关的基因主要通过水平转移方式在细菌间进行传递,前期的研究显示这种水平转移方式与接合性质粒有关,可极大地缩小TTX合成相关基因的筛选范围。本项目拟通过分析一株产TTX气单胞菌的接合性质粒序列,通过缺失突变的功能分析,鉴定出与TTX合成相关的基因。调查河鲀基因组中是否具有该基因,明确河鲀自身是否具有合成TTX的能力,调查TTX合成相关基因在河鲀体内各种产TTX共生细菌中的分布情况,确定该基因在产TTX细菌之间的水平转移规律,为进一步明确河鲀TTX来源,理解TTX生物合成途径和产TTX细菌间的基因水平转移机制提供理论基础。

结项摘要

河鲀毒素在河鲀等鲀毒鱼类中具有重要的生态作用,河鲀毒素本身也是重要的潜在临床药物,但目前人们对河鲀毒素生物合成的底物和合成所需的酶都非常不清楚,使人们难以确定鲀毒鱼类本身是否具有合成河鲀毒素的能力,也不清楚如何使细菌能高效生产河鲀毒素,以及理解不同产河鲀毒素细菌之间存在的基因水平转移的现象。本项目发现一株产河鲀毒素的气单胞菌质粒的拷贝数与其产毒能力密切相关,发现该质粒基因组中含有成套的可编码IV型分泌系统移动遗传元件,表明此株产河鲀毒素细菌具有潜在的接合和传染能力,不同产河鲀毒素细菌的转录组中也发现存在移动遗传元件,表明产河鲀毒素细菌之间具有基因水平转移现象。更为重要的是,在不同产河鲀毒素细菌的转录组中我们共鉴定出与28个与河鲀毒素合成通路相关的基因,这些基因中并不包括与贝类毒素合成相关的酶,如脒基转移酶、非核糖体肽合成酶、聚酮合酶,表明河鲀毒素虽然结构和贝类毒素类似,但合成通路差异较大。这么多基因跟河鲀毒素相关,表明河鲀毒素合成需要多个步骤,而不太可能是由脂糖或异戊烯焦磷酸基团连接到精氨酸上一步就可生成的。这28个基因也没有在红鳍东方鲀基因组中存在同源基因,提示河鲀本身不可能具有全套合成河鲀毒素的能力。精氨酸被推测为河鲀毒素的底物,本研究通过在培养基中添加L-精氨酸或其前体谷氨酸,发现能提高细菌产河鲀毒素的能力,进一步的同位素示踪标记的谷氨酸,能基本确定谷氨酸可能作为精氨酸的底物,成为河鲀毒素合成的前体。本项目这些结果,大大推进了对河鲀毒素合成通路的底物及合成酶的了解,为全面揭示细菌合成河鲀毒素的合成通路奠定了非常好的基础,较好地完成了项目的预期目标。此外,本项目意外发现产河鲀毒素的气单胞菌同时具有降解河鲀毒素的能力,表明产细菌体内存在维持河鲀毒素数量稳定的未知机制。另外,首次从累毒鱼类云斑裸颊虾虎鱼中分离到2株产河鲀毒素的细菌,表明云斑裸颊虾虎鱼体内的河鲀毒素也是细菌来源,丰富了人们关于鲀毒鱼类与产河鲀毒素细菌之间共生关系的理解。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
产河鲀毒素细菌水平转移相关基因的鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    上海海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘静;杨桂梅;鲍宝龙
  • 通讯作者:
    鲍宝龙
Production level of tetrodotoxin in Aeromonas is associated with the copy number of a plasmid
气单胞菌中河豚毒素的产生水平与质粒的拷贝数有关
  • DOI:
    10.1016/j.toxicon.2015.04.009
  • 发表时间:
    2015-07-01
  • 期刊:
    TOXICON
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Liu, Jing;Wei, Fen;Bao, Baolong
  • 通讯作者:
    Bao, Baolong
Identification of tetrodotoxin-producing bacteria from goby Yongeichthys criniger
虾虎鱼产河豚毒素细菌的鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Toxicon
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    鲍宝龙
  • 通讯作者:
    鲍宝龙
云斑裸颊虾虎鱼体内各组织河鲀毒素的含量
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    上海海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    鲍宝龙
  • 通讯作者:
    鲍宝龙

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其他文献

牙鲆纤维蛋白原相关蛋白(FREP1)基因的克隆和表达分析
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    鲍宝龙
饥饿状态下真鲷仔鱼早期阶段的高温、低盐耐力和浮力
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    上海水产大学学报
  • 影响因子:
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  • 作者:
    鲍宝龙;苏锦祥等
  • 通讯作者:
    苏锦祥等
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  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    动物学杂志
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    --
  • 作者:
    廖永冠;李育媚;鲍宝龙
  • 通讯作者:
    鲍宝龙
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    上海海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    谢彩霞;邢巨斌;鲍宝龙
  • 通讯作者:
    鲍宝龙
黑化牙鲆不同部位皮肤黑色素细胞和鳞片形态的比较
  • DOI:
    10.12024/jsou.20190502632
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    上海海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    彭康康;张博;鲍宝龙;龚小玲
  • 通讯作者:
    龚小玲

其他文献

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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