藏猪稀有遗传资源评价模型建立及优先保护顺序评估

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31101682
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1701.畜牧学基础
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

藏猪是青藏高原特有猪种,在高寒、低氧的特殊生境下经过几千年驯化造就了丰富的基因资源宝库。由于近年藏猪遗传资源受外来猪种排挤和杂交导致基因流失而开展本项研究。本研究拟采用藏猪mtDNA作为分子标记,分别通过SNPs和系统进化分析阐明其遗传多样性丰富程度和遗传资源分布规律,揭示藏猪母系起源、驯化历程和系统发生关系;重点根据mtDNA D环SNPs信息、稀有单倍型对总体遗传多样性的贡献率及母系进化关系,尝试建立遗传变异综合模型及遗传差异和遗传贡献率双模型,并结合已经广泛应用的遗传贡献率模型对藏猪稀有遗传资源优先保护顺序进行评估,从而确定遗传多样性最丰富、单倍型稀有性最强和具备稀有母系起源的优先保护群体,为确保藏猪遗传资源保护的人力、财力和物力合理配置、以最小代价获得最佳保护效果提供理论上的参考依据。

结项摘要

藏猪是青藏高原特有猪种,在高寒、低氧的特殊生境下经过几千年驯化造就了丰富的基因资源宝库,近年藏猪遗传资源受外来猪种排挤和杂交导致基因流失。项目采用分子遗传学的方法,对藏猪遗传资源进行了研究与保护评价。研究表明:瓶颈效应、人工选择、引入猪种入侵共同导致了藏猪遗传多样性流失。项目构建了遗传变异综合模型:Fz= 0.713F1+0.287F2(F1=0.328ZX1+ 0.667ZX2+0.668ZX3;F2=0.945ZX1-0.234ZX2-0.232ZX3)、遗传贡献率模型: CRT (k) =(RT(K)- RT(平均))/ RT和选育猪种入侵模型:h= Sc/S×100%。遗传变异综合模型评价表明:在西藏、云南、四川、甘肃和青海的11个藏猪群体,综合遗传多样性集中在合作、昌都、玛曲、山南和阿坝等五个群体中,应尽可能建立保护区,防止外来猪种入侵及数量减少,其他6个群体遗传多样性较低,需要与其他藏猪群体进行交流,并防止近亲交配;遗传贡献率模型评价表明:合作、甘孜、迪庆、林芝、玛曲、昌都等藏猪对藏猪遗传变异贡献为正效应,藏猪的遗传变异主要集中在这六个群体;以上六个群体中除昌都群体外,其他五个群体对遗传独特性贡献为正效应及整体遗传贡献率均为正效应;引入猪种侵蚀模型评估表明:藏猪的甘孜、林芝、日喀则、碌曲、青海、玛曲、山南、昌都、合作、迪庆、阿坝等群体受选育猪种影响依次增大,保护必要性依次降低。以上三个模型从不同角度评估了藏猪遗传资源优先保护的顺序,在具体研究和保护工作中,需要根据不同的保护目的参照相应的评估依据。为探索藏猪开发利用途径,根据藏猪遗传背景及其适应性,研究了藏猪与选育猪种在抗病性(腹泻)和耐低氧的遗传差异,揭示其中抗性相关基因在DNA水平与选育猪种(长白猪、大白猪和杜洛克猪)存在显著差异。项目执行过程中,参与制定了《藏猪》国家品种中合作猪类群的具体内容,改进了传统DNA提取方法,并就此申请国家发明专利。项目取得的研究成果为藏猪遗传资源保护提供了理论上的参考依据,从而确保投入到藏猪遗传资源保护中的人力、财力和物力实现合理配置,以最小代价获得最佳保护效果。并为挖掘藏猪种质资源、应用其对环境变化的适应能力、保护青藏高原生态系统稳定提供理论和技术支撑。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)
藏猪遗传多样性及系统关系研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    国外畜牧学.猪与禽
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    蔡原;赵生国
  • 通讯作者:
    赵生国
4猪种Nramp1基因第6内含子多态性研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    中兽医医药杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    赵生国;赵海;潘虹;周艳红;滚双宝
  • 通讯作者:
    滚双宝
合作猪肌肉氨基酸含量测定及营养价值评价
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    中兽医医药杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    蔡原;赵生国
  • 通讯作者:
    赵生国
Association between Genetic Polymorphism in the Swine Leukocyte Antigen-DRA Gene and Piglet Diarrhea in Three Chinese Pig Breeds
我国三个猪品种猪白细胞抗原DRA基因多态性与仔猪腹泻的相关性
  • DOI:
    10.1016/j.jconrel.2018.04.040
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yang; Q. L.;Zhao; S. G.;Wang; D. W.;Feng; Y.;Jiang; T. T.;Huang; X. Y.;Gun; S. B.
  • 通讯作者:
    S. B.
猪SLA-DQA基因外显子4多态性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    华北农学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孔晶晶;滚双宝;杨巧丽;王国旺;刘丽霞;李峰松;姜天团;封洋;赵生国
  • 通讯作者:
    赵生国

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其他文献

冬夏两季环境温度对藏猪生理特征及相关基因表达的影响
  • DOI:
    10.16431/j.cnki.1671-7236.2021.03.011
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    中国畜牧兽医
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李倩文;杨榛;杨雅楠;王正文;文禹粱;蔡原;赵生国
  • 通讯作者:
    赵生国
PAN接枝改性纳米SiO_2吸附Cu~(2+)的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    西北师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    马世泰;赵生国;李婷婷;周敏
  • 通讯作者:
    周敏
SPF大白猪和长白猪群体生理生化特性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    中国实验动物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    权金强;高彩霞;江新杰;李昌文;路小野;赵生国;陈洪岩
  • 通讯作者:
    陈洪岩
绒山羊皮肤毛囊兴盛前期组织形态、chi-miR-107-3p与RHBDF2基因表达分析
  • DOI:
    10.16431/j.cnki.1671-7236.2021.06.004
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    中国畜牧兽医
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王立忠;吴铁成;马跃军;李玉荣;乌亚罕;何托雅;赵生国;刘斌
  • 通讯作者:
    刘斌
藏猪EGLN1基因exon 4及部分内含子变异研究
  • DOI:
    10.19556/j.0258-7033.20181210-08
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    中国畜牧杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李卓航;寸博文;文禹粱;赵生国;蔡原
  • 通讯作者:
    蔡原

其他文献

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赵生国的其他基金

藏猪II型肺泡上皮细胞(ATII)响应高原低氧环境的生理适应模式及其调控机制
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    36 万元
  • 项目类别:
藏猪肺组织响应高原低氧胁迫特异miRNA鉴定及转录组表达调控网络构建
  • 批准号:
    31760644
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    40.0 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目

相似国自然基金

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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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