植物内质网介导的蛋白质降解机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31730019
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    278.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2022-12-31

项目摘要

A correct spatial conformation is crucial for the physiological functions of a protein. Eukaryotic organisms have evolved a conserved endoplasmic reticulum-mediated protein quality control (ERQC) system to allow misfolded membrane proteins or secretory proteins to be retained in the endoplasmic reticulum (ER) and subsequently degraded by ER-associated degradation (ERAD). Accumulation of misfolded proteins in the ER disrupts protein homeostasis, which has been linked to altered physiological or pathological response in organism. Despite primary understanding of the mechanisms associated with ERQC/ERAD has been ascertained through investigating yeast and mammalian cells, the functional studies of the plant ERQC/ERAD processes remained rather limited. Recent studies revealed plant ERQC/ERAD systems played critical roles in regulating important physiological processes of plants, such as abiotic stress tolerance and plant defense. Moreover, it is indicated that more plant-specific components are requires in ERAD machinery. In this study, we will focused on two Arabidopsis ER-localized E3 ligase, HRD1 and DOA10, to screen and identify the plant-specific components involved in ERAD by using proteomics methods combined with genetics and biochemical approaches. Investigating the biological functions of these ERAD components and elaborating their roles in ERAD complexes would help us to better understand ERQC mechanisms in plant and throw light on ERAD research in yeast and mammalian.
蛋白质空间构象的正确形成对其生理功能行使至关重要。生物体在长期进化过程中形成了保守的内质网蛋白质质量监控机制,对错误折叠的膜蛋白和分泌蛋白进行修复和降解。由此引发的相关生理、病理改变加深了对该领域研究的关注。尽管当前对哺乳动物细胞和酵母中这一过程的作用机制有一定的认识,但是在植物中的研究却非常有限。近年来研究表明植物内质网介导的蛋白质降解参与了植物逆境胁迫和防御反应等重要生理过程,并且植物在进化中还产生了参与降解的特异组分。本申请主要利用蛋白质组学技术,结合遗传学、生物化学研究手段,围绕拟南芥两个内质网定位的E3泛素连接酶HRD1和DOA10,发掘并鉴定参与植物内质网介导蛋白质降解的新组分,研究它们的生物学功能,解析植物内质网介导的蛋白质降解机制,同时研究该降解过程与植物逆境胁迫之间的关系。该研究有助于我们更好的认识植物内质网蛋白质质量控制机制,同时为哺乳动物细胞和酵母的研究提供参考。

结项摘要

蛋白质三维空间结构的正确形成对其功能的正常行使至关重要。生物体在长期进化过程中形成了相对保守的蛋白质质量监控机制,对错误折叠的蛋白进行修复和降解。对于膜蛋白和分泌蛋白而言,由内质网介导的蛋白质质量监控(ERQC)和相关的降解机制研究(ERAD)是细胞生物学领域的热点。在植物中,ERQC和ERAD过程与植物响应逆境胁迫和防御反应紧密相关。本项目主要利用蛋白质组学、遗传学、生物化学和细胞生物学研究方法和手段,发掘并鉴定植物内质网介导蛋白质降解系统的新组分,研究这些组分的生物学功能,解析植物内质网介导的蛋白质降解机制,同时研究该降解过程与植物逆境胁迫之间的关系。在本项目的资助下首次发现并鉴定了植物ERAD复合体新组分PAWH1/PAWH2,研究了其在HRD1复合体中与HRD1和EBS7之间的调控关系和作用机制;鉴定到一个受HRD1复合体介导降解的新底物蛋白TIN1,其在高温下受诱导和降解的分子机制降解机制的解析回答了长期以来对内质网未折叠蛋白反应(UPR)与ERAD之间调控关系不明确的问题;鉴定了植物中两个参与内质网糖基化蛋白降解的关键酶EDEM1和EDEM2,研究了其在错误折叠蛋白降解中的作用;系统总结了植物中内质网胁迫、UPR信号和N-糖基化蛋白降解机制的研究进展,以及内质网与其它细胞器互作共同调控植物响应非生物胁迫的分子机理。本项目的开展为我们更好的认识植物内质网蛋白质质量监控系统,深入理解内质网中蛋白质稳态平衡调节奠定了理论基础,为今后改良和提高植物抵御逆境胁迫提供了新思路。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
PAWH1 and PAWH2 are plant-specific components of an Arabidopsis endoplasmic reticulum-associated degradation complex
PAWH1 和 PAWH2 是拟南芥内质网相关降解复合物的植物特异性成分
  • DOI:
    10.1038/s41467-019-11480-7
  • 发表时间:
    2019-08-02
  • 期刊:
    NATURE COMMUNICATIONS
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Lin, Liangguang;Zhang, Congcong;Li, Jianming
  • 通讯作者:
    Li, Jianming
A Predominant Role of AtEDEM1 in Catalyzing a Rate-Limiting Demannosylation Step of an Arabidopsis Endoplasmic Reticulum-Associated Degradation Process.
AtEDEM1 在催化拟南芥内质网相关降解过程限速脱甘露糖基化步骤中的主要作用
  • DOI:
    10.3389/fpls.2022.952246
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Frontiers in plant science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
  • 通讯作者:
Communications Between the Endoplasmic Reticulum and Other Organelles During Abiotic Stress Response in Plants
植物非生物胁迫反应期间内质网与其他细胞器之间的通讯
  • DOI:
    10.3389/fpls.2019.00749
  • 发表时间:
    2019-06-12
  • 期刊:
    FRONTIERS IN PLANT SCIENCE
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Liu, Linchuan;Li, Jianming
  • 通讯作者:
    Li, Jianming
The Crucial Role of Demannosylating Asparagine-Linked Glycans in ERADicating Misfolded Glycoproteins in the Endoplasmic Reticulum.
去甘露糖化天冬酰胺连接聚糖在消除内质网中错误折叠糖蛋白中的关键作用
  • DOI:
    10.3389/fpls.2020.625033
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Frontiers in plant science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Zhang J;Wu J;Liu L;Li J
  • 通讯作者:
    Li J
Endoplasmic Reticulum Stress and Unfolded Protein Response Signaling in Plants.
植物内质网应激和未折叠蛋白反应信号
  • DOI:
    10.3390/ijms23020828
  • 发表时间:
    2022-01-13
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Manghwar H;Li J
  • 通讯作者:
    Li J

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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    南方医科大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    柳玉红;丁彦青;李建明;周军
  • 通讯作者:
    周军

其他文献

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拟南芥泛素连接酶ROBIN1在BR信号通路中的功能与机制研究
  • 批准号:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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