报春百合染色体重排与其群体分化关系研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31860107
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    39.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0309.环境与生物演化
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

How species become divergent or new species is one of the fundamental and crucial issues in evolutionary biology. Despite the fact that chromosomal rearrangements play important roles in speciation, the ways in which they contribute to speciation remain less understood. Lilium primulinum includes three varieties: var. primulinum, var. burmanicum and L. primulinum var. ochraceum, distributed on the two sides of the important bioggeographic boundary ‘Tanaka Line’,, where the largely environmental heterogeneity existed. Our previous study suggested that strong chromosomal rearrangements existed both in inter-species and intraspecific populations within these varieties. Here, on the basis of extensive population sampling, we aim to deeply observe and compare the variation of chromosomal rearrangements within all populations, to examine the levels of genetic differentiation and gene flow between varieties and among populations based on SSR genotyping, and finally together with ecological niche modeling and experiments of reproductive isolation, to explore how chromosomal rearrangements contribute to the population differentiation within L. primulinum. Together, these investigation would add our understanding of the significance of chromosomal rearrangements promoting species divergence and speciation within Lilium, and help to provide greater insight into adaptive evolution for species distributed in Southwest China.
物种分化和形成的机制一直是进化生物学中最基础也是最重要的一个问题。染色体重排在物种分化和形成中扮演重要角色,但我们对其作用机制还知之甚少。报春百合种下包含3个变种(原变种、紫喉百合、川滇百合),分布在重要的生物地理分界线“田中线”两侧,分布区具有较大的环境异质性。另外,我们前期的研究发现:其在变种间以及部分居群间都存在着强烈的染色体重排的现象。本项目拟以报春百合为研究对象,广泛采集居群样品,深入观察和比较3个变种居群间的染色体重排的方式和差异程度;利用微卫星分型的手段检测变种及居群间的遗传分化及基因流水平;在此基础上,结合生态位模拟及生殖隔离实验,探讨居群间染色体重排在报春百合种群分化中的作用。研究结果将增加我们对染色体重排在百合属物种分化与形成中的意义,有助于进一步理解中国西南地区分布物种的适应性进化。

结项摘要

染色体重排在物种分化和形成中扮演重要角色,但对其作用机制还知之甚少。本研究以报春百合作为研究材料,利用多种手段探讨了不同因素对于报春百合种分化中的影响。核型以及分子显带结果表明,报春百合变种间染色体有明显的分化,这与群体遗传学结果一致。适生区分析结果表明不同的适宜环境生态因子是导致报春百合变种间分布差异的重要原因,这也是导致其染色体重排的重要因素。蛋白质组学的研究结果确认了变种间的表达蛋白有明显差异,这种表达差异与生境不同有关。生境对报春百合变种间的分化还得到了叶表皮研究结果的支持,该结果表明报春百合气孔变化和生境有关,和类群无关。花粉活性及结实率观察揭示了报春百合不同变种下居群的低繁殖率,并支持居群间的低基因流结果。另外还通过叶绿体基因组以及根际微生物组成,讨论了紫斑百合的系统关系,该种被长期认为和报春百合密切相关。该研究结果有助于进一步理解中国西南地区分布物种的适应性进化。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
The complete plastome sequence of Lilium primulinum var. burmanicum, an ornamental and medicinal plant endemic to China.
报春百合 (Lilium primulinum var.) 的完整质体序列。
  • DOI:
    10.1080/23802359.2022.2086494
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA. Part B, Resources
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
A reevaluation of the status of Lilium nepalense based on complete chloroplast genome sequences
基于完整叶绿体基因组序列的尼泊尔百合状态重新评估
  • DOI:
    10.4236/ajps.2022.134030
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    American Journal of Plant Sciences
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Genshen Yin;Shilong Wang;Shuangshuang Zhang;Wenlei Cheng;Minghua Dong
  • 通讯作者:
    Minghua Dong
Characteristics of Leaf Epidermis of 22 Lilieae (Liliaceae) under Different Altitudes in China.
我国不同海拔22种百合科植物叶表皮特征。
  • DOI:
    10.4236/ajps.2023.141003
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
    American Journal of Plant Sciences
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Genshen Yin;Shuangshuang Zhang;Wenlei Cheng;Minghua Dong;Ye Chen
  • 通讯作者:
    Ye Chen

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其他文献

中国特有珍稀濒危水生植物海菜花大孢子发生及雌配子体发育
  • DOI:
    10.15889/j.issn.1002-1302.2017.16.056
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    江苏农业科学
  • 影响因子:
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  • 作者:
    翟书华;殷根深;侯思名;杨晓虹;刘加伟
  • 通讯作者:
    刘加伟
海菜花小孢子发生及雄配子体发育的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    北方园艺
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    翟书华;殷根深;董晓琼;侯思名;杨晓虹
  • 通讯作者:
    杨晓虹

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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