高致病性H5N1禽流感病毒PA相互作用宿主蛋白的鉴定及功能分析

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31502076
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1802.兽医病毒学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Highly pathogenic H5N1 avian influenza virus (AIV) remains a substantial threat to public health. Therefore, it is crucial to explore the molecular basis and host mechanism for the high virulence of H5N1 AIV in mammals. Our previous study demonstrated that the PA gene-mediated lethal dissemination contribute to the high virulence of a H5N1 AIV strain in mice. However, it is unclear which host factors contribute to the virulence caused by PA gene. In this study, to further understand the pathogenesis of the PA gene, we will identify the host proteins that interact with PA protein and explore the potential biological significance of the interaction. The following experiments will be performed. First, we will construct the recombinant AIVs with His tag insertion in its PA-coding region based up a pair of AIVs that differ greatly in their virulence in mice. Second, cellular proteins interacting with PA will be identified by affinity chromatography and LC-MS/MS and bioinformatics. Third, the interaction of the cellular protein and PA protein will be confirmed by GST-pull down, co-immunoprecipitation and confocal microscopy assays. Finally, studies were also carried out to identify the molecular mechanism and biological significance of these interactions. This study may accelerate our understanding of the pathogenesis of the influenza virus.
高致病性H5N1禽流感病毒(AIV)能致死哺乳动物并可能获得气溶胶传播的能力。因此,迫切需要了解AIV致死哺乳动物的病毒和宿主机制。我们前期的研究发现PA基因所介导的病毒致死性扩散是H5N1 AIV致死小鼠的关键病毒机制。然而,PA基因发挥该功能的潜在宿主机制还不清楚。本研究旨在通过挖掘病毒感染过程中与PA相互作用的宿主蛋白并阐明其生物学意义从而进一步探索PA基因的致病机理。研究内容主要包括:(1)以对小鼠致病性差异显著的1对模式病毒为骨架,分别构建PA上融合表达His标签的嵌合病毒;(2)利用亲和层析结合液相色谱-串联质谱全面筛选与PA互作的宿主蛋白,用IPA等软件对宿主蛋白进行生物信息学分析;(3)用Co-IP、GST-pull down和激光共聚焦技术对相互作用进行验证;(4) 对互作机制以及互作蛋白的生物学功能进行分析和鉴定。研究结果将进一步加深对禽流感病毒致病机理的了解。

结项摘要

PA蛋白在流感病毒生命周期和致病性中发挥关键作用。然而,其发挥以上功能的宿主因素还不清楚。项目目标:① 全面筛选与模式病毒PA蛋白相互作用的差异宿主蛋白。② 差异宿主蛋白的鉴定和功能分析,阐明PA基因影响流感病毒致病性的潜在宿主机理。. 主要研究进展和重要结果:.1. 基于CK10病毒进行PA互作宿主蛋白的筛选和分析. 筛选到278种可能与CK10病毒PA互作的人类细胞蛋白。IPA、GO以及KEGG等生物信息学分析结果表明所筛选的互作宿主蛋白与流感病毒感染密切相关。Co-IP及细胞共定位发现NCL和eEF1A1与PA存在相互作用。.2. 基于模式病毒(CK10和GS10)进行PA互作差异宿主蛋白的筛选和分析. 基于由PA决定致病性差异的模式病毒进行PA差异互作蛋白的筛选,发现与低致病性的GS10相比,共有160种蛋白能与高致病性CK10病毒的PA蛋白特异性结合,包括eEF1A1。生物信息学分析结果表明这些差异宿主蛋白主要参与翻译、基因表达、病毒转录和病毒感染等生物学进程。Co-IP结果进一步证实eEF1A1只与CK10的PA存在互作。.3. PA与宿主细胞蛋白eEF1A1相互作用的生物学意义研究. 发现干扰eEF1A1显著提高CK10的复制效率、RNP活性、PA和NP核聚集能力、病毒mRNA、cRNA、vRNA合成、病毒诱导的细胞因子表达、抑制细胞坏死;而过表达eEF1A1显著降低CK10的复制效率。另外,eEF1A1也抑制H5N6和H7N9病毒复制,表明eEF1A1抑制流感病毒复制的广谱性。RNA-seq结果显示干扰eEF1A1后,多种炎症及免疫相关通路组分以及负调控细胞死亡相关基因表达上调,这与eEF1A1在CK10病毒感染期间抑制病毒复制、降低细胞因子表达和促进细胞坏死结果吻合,进一步证实表明eEF1A1的抗病毒作用。.4. PA与宿主细胞蛋白NCL相互作用的生物学意义研究. 进一步探索了NCL在CK10病毒感染人源细胞期间的潜在作用。发现NCL具有抗病毒作用,表现为抑制CK10病毒的复制效率、降低病毒的RNP活性、削弱病毒RNA的合成、抑制病毒诱导的细胞凋亡与坏死以及细胞因子免疫应答反应。

项目成果

期刊论文数量(18)
专著数量(0)
科研奖励数量(5)
会议论文数量(2)
专利数量(1)
The virulence factor PA protein of highly pathogenic H5N1 avian influenza virus inhibits NF-kappa B transcription in vitro
高致病性H5N1禽流感病毒毒力因子PA蛋白体外抑制NF-κB转录
  • DOI:
    10.1007/s00705-017-3496-9
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    ARCHIVES OF VIROLOGY
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Cui Zhu;Hu Jiao;Wang Xiaoquan;Gu Min;Liu Xiaowen;Hu Shunlin;Hu Zenglei;Liu Huimou;Liu Wenbo;Chen Sujuan;Peng Daxin;Jiao Xinan;Liu Xiufan
  • 通讯作者:
    Liu Xiufan
两株小鼠致病性差异显著的 H5 N 1禽流感 病毒PA 蛋白差异互作宿主蛋白研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国家禽
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    高照;胡娇;刘秀梵
  • 通讯作者:
    刘秀梵
Internal Gene Cassette from a Genotype S H9N2 Avian Influenza Virus Attenuates the Pathogenicity of H5 Viruses in Chickens and Mice.
基因型 S H9N2 禽流感病毒的内部基因盒可减弱 H5 病毒对鸡和小鼠的致病性
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2017.01978
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Frontiers in microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Hao X;Wang J;Hu J;Lu X;Gao Z;Liu D;Li J;Wang X;Gu M;Hu Z;Liu X;Hu S;Xu X;Peng D;Jiao X;Liu X
  • 通讯作者:
    Liu X
The PA‑interacting host protein nucleolin acts as an antiviral factor during highly pathogenic H5N1 avian infuenza virus infection
PA-相互作用宿主蛋白核仁素在高致病性 H5N1 禽流感病毒感染过程中充当抗病毒因子
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Archives of virology
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Zhao Gao;Jiao Hu;Xiaoquan Wang;Qian Yan;Yanyan Liang;Chunxi Ma;Dong Liu;Kaituo Liu;Xiaoli Hao;Min Gu;Xiaowen Liu;Xin‑an Jiao;Xiufan Liu
  • 通讯作者:
    Xiufan Liu
Genetic analysis and biological characteristics of different internal gene origin H5N6 reassortment avian influenza virus in China in 2016
2016年中国不同内部基因来源H5N6重排禽流感病毒遗传分析及生物学特性
  • DOI:
    10.1016/j.vetmic.2018.04.023
  • 发表时间:
    2018-06-01
  • 期刊:
    VETERINARY MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Sun, Wenqiang;Li, Jiaxin;Liu, Xiufan
  • 通讯作者:
    Liu, Xiufan

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    秦立公;胡娇;朱可可
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李莉

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宿主LncRNA#61与病毒PA-X蛋白互作抑制禽流感病毒复制的分子机制
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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