基于分泌蛋白质组学的香蕉枯萎病菌致病分子机理解析

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31600663
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    19.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2103.生命组学技术
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Banana Fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f.sp. cubense (Foc), is one of the most important diseases that causes the greatest reductions in banana yield worldwide. Despite the global importance, little is known about the mechanisms of Foc pathogenesis. Secreted proteins can act as pathogenicity factors and play important roles in the Foc-banana interactions. With the completion of Foc genome sequences and continued refining of the gene annotation, secretome is becoming an increasingly powerful tool for the investigation of complex pathogenesis in this important fungal pathogen. In order to access the secretome of Foc, race 1 and race 4 of Foc (Foc1 and Foc4) were grown in liquid culture with banana plant extracts as the sole nutrient source to mimic the host-pathogen interaction. A gel-free proteomics approach was employed to identify the proteins secreted into the culture medium by using isobaric tags for relative and absolute quantitation (iTRAQ)-based comparative secretomic approaches. The prediction of the protein function and the analysis of their biological function will also be conducted by bioinformatics analysis, gene knockout and functional complementation. The better understanding of the changes of secreted proteins in Foc1 and Foc4 under different conditions may provide new insights into the pathogenesis mechanisms of Foc. To our best knowledge, it is the first attempt to analyze Foc secretome on proteome-wide scale in the current proposal, which will help to understand the mechanism of the Foc-banana interactions.
尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f. sp. cubense,Foc)引起的枯萎病是香蕉的毁灭性病害,目前对于其致病机理尚不清楚。分泌蛋白作为一类重要的致病因子,已被证实在Foc与香蕉的相互作用中起着重要作用,但目前还没有关于Foc分泌蛋白整体上的研究报道。Foc基因组测序及注释的完成,为Foc分泌蛋白质组研究提供了便利。本项目以危害我国植蕉区的2个重要Foc小种(Foc1和Foc4)为对象,通过分泌蛋白的诱导和提取,采用基于iTRAQ的蛋白质组学技术,比较分析不同诱导条件下Foc分泌蛋白的表达差异;通过生物信息学技术对Foc分泌蛋白进行功能预测和致病相关因子的筛选,并应用基因敲除与功能互补等技术对重要Foc分泌蛋白进行生物学功能分析。本项目对于更全面了解Foc的致病分子机理及不同生理小种间的致病性差异具有重要意义,也有利于更好地了解Foc与香蕉的早期互作机理。

结项摘要

尖孢镰刀菌古巴专化型引起的枯萎病是香蕉的毁灭性病害,目前对于其致病机理尚不清楚。分泌蛋白作为一类重要的致病因子,已被证实在Foc与香蕉的相互作用中起着重要作用,但目前还没有关于Foc分泌蛋白整体上的研究报道。本项目以危害我国植蕉区的2个重要Foc小种(Foc1和Foc4)为对象,通过分泌蛋白的诱导和提取,采用基于质谱的定量蛋白质组学技术,比较分析了不同诱导条件下Foc分泌蛋白的表达差异。在香蕉根组织诱导条件下,获得Foc4差异表达的分泌蛋白质210个,Foc1差异表达分泌蛋白质154个;通过生物信息学分析,这些差异表达分泌蛋白主要参与了代谢过程、程序性细胞死亡、生物过程调控和应激反应等重要生物学过程,其中次生代谢产物合成和酪氨酸代谢途径等与致病性相关的通路受显著影响。应用基因敲除与功能互补等技术对其中4个Foc4差异分泌蛋白进行生物学功能分析,发现敲除突变体∆Focwm和∆Fopdcd5对巴西蕉的致病力显著降低,FoCWM和FoPDCD5分泌蛋白可能为香蕉枯萎病菌的致病因子。本项目对于更全面了解Foc的致病分子机理及不同生理小种间的致病性差异具有重要意义,也有利于更好地了解Foc与香蕉的早期互作机理。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(4)
香蕉枯萎病菌1号小种分泌蛋白与效应子的预测与分析
  • DOI:
    10.13926/j.cnki.apps
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    植物病理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    何艳秋;颜瑞;蒙姑;杨文静;王振中;李云锋;聂燕芳
  • 通讯作者:
    聂燕芳
香蕉枯萎病菌热带4号小种基因组规模分泌蛋白的预测与分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    江苏农业学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    聂燕芳;黄嘉瑶;周玲菀;涂晓欢;陈慧妍;王振中;李云锋
  • 通讯作者:
    李云锋
香蕉枯萎病的发生及防控研究现状
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    华南农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李华平;李云锋;聂燕芳
  • 通讯作者:
    聂燕芳

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其他文献

稻瘟菌二肽基肽酶V基因MoDppV的功能分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    植物保护学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    聂燕芳;冷梅钦;李冠军;李洁玲;李华平;李云锋
  • 通讯作者:
    李云锋
外源茉莉酸甲酯诱导的水稻叶片蛋白质差异表达分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    植物病理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张智慧;聂燕芳;何磊;高元媛;李云锋;王振中
  • 通讯作者:
    王振中
水稻叶片质膜的纯化及质膜蛋白质双向电泳分析
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    华南农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    何磊;CAO Yan;LI Yun-feng;WANG Zhen-zhong;聂燕芳;高元媛;曹燕;李云锋;王振中;HE Lei;NIE Yan-fang;GAO Yuan-yuan
  • 通讯作者:
    GAO Yuan-yuan
外源水杨酸诱导水稻相关防御酶活性及内源水杨酸含量的变化
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    华中农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张智慧;聂燕芳;何磊;李云锋;王振中
  • 通讯作者:
    王振中
外源茉莉酸甲酯诱导水稻抗瘟性相关防御酶和内源水杨酸的变化
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    植物病理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张智慧;聂燕芳;何磊;李云锋;王振中
  • 通讯作者:
    王振中

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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