苯丙氨酸变位酶区域选择性氨化3-芳香丙烯酸的分子机制及酶分子改造

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31671797
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    63.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2002.食品生物化学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The phenylalanine aminomutase(PAM) can catalyze regioselective amination of 3-arylpropenoic acid at α and β site to synthesize the β-arylalanine with high additional value. However, the the products are mixture of α, β-arylalanine, which results form the low regioselectivity of PAM, and it is difficult to obtain highly pure β-arylalanine. Therefore, there is necessary to improve the regioselectivity of PAM using molecular modification. In order to successfully modify the enzyme, we first need to solve two key scientific problems concerning the molecular mechanism of adding ammonia and accurately identifying the sensitive domain which manipulate the regioselectivity of PAM. In this project, we plan to verify the adding mode of amino group and hydrogen proton by TaPAM from Taxus using NMR and GC/EI-MS, and adopt structure alignment and molecular docking to find out sensitive domain of which manipulate the regioselectivity. On this basis, the efficient screening method was designed to screen the mutant gene, the CAST mutagenesis technique was used to reshape the domain of TaPAM, finally fulfill the modification of TaPAM. The aim of this project is to resolve the industrial application bottlenecks of PAM and provide scientific basis and methodical reference for molecular modification of other enzyme.
苯丙氨酸变位酶(PAM)催化3-芳香丙烯酸不饱和双键区域选择性的加氨,用于生产高附加值β-芳香丙氨酸,但存在区域选择性低的缺陷,产物是α,β-芳香丙氨酸的混合物,难以获得高纯度的β-芳香丙氨酸,因而迫切需要对酶进行改造,提高区域选择性。为成功实现酶分子改造,首先需要解决加氨的分子机制及鉴定操控酶区域选择性的敏感部位这两个关键科学问题。本项目以来源于紫杉(Taxus)的苯丙氨酸变位酶(TaPAM) 为研究对象,利用NMR和质谱研究TaPAM催化反应中氨基和质子的添加模式,解析加氨的分子机制,并对酶的序列和结构进行比对,分子对接等,准确鉴定操控酶区域选择性催化的敏感部位及关键氨基酸残基。在此基础上,设计高效的突变基因筛选方法,利用CAST突变技术对操控酶区域选择性催化的关键部位进行重构,完成酶的分子改造。本项目旨在解决制约PAM工业应用的瓶颈问题,并为其它酶分子改造提供科学依据和方法学的参考。

结项摘要

苯丙氨酸变位酶(PAM)属于MIO(the 4-methyleneimidazol-5-one)家族酶,以MIO为内源性辅因子,催化3-芳香丙烯酸不饱和双键区域选择性的加氨加氢,工业上用于生产β-芳香丙氨酸,但存在区域选择性低的缺陷,产物是α,β-芳香丙氨酸的混合物,难以获得高纯度的β-芳香丙氨酸。为解决工业应用问题,需要对该酶进行分子改造提高酶的区域选择性。本项目解决了两个关键科学问题及解析酶区域选择性催化机制及探明操控酶区域选择性的敏感部位,在此基础上进行酶的分子改造。本项目分别以三种来源(Streptomyces maritimus、Taxus chinensis、Pantone agglomerans)的苯丙氨酸变位酶为研究对象,采用基因克隆、异源表达高效制备重组酶并进行性质表征,利用NMR和质谱研究PAM催化反应中氨基和质子的添加模式,解析酶的区域选择性催化的的分子机制,结果表明酶催化过程是底物α-苯丙氨酸的氨基与β位的pro-3R氢发生分子内交换,从而合成β-苯丙氨酸。通过对酶的序列和结构进行比对,分子对接等,准确鉴定操控酶区域选择性催化的敏感部位及关键氨基酸残基,结果表明酶活性中心455位的苯丙氨酸残基参加操控酶区域选择性催化过程,参与酶催化中间产物反式肉桂酸的羧基酸与酶活性中心的结合方式从而实现操控酶的区域选择性催化。在此基础上,成功对来源Taxus chinensis和Pantone agglomerans 来源的PAM进行分子改造,获得高区域选择性的突变体,区域选择性提高了近5.2倍,β-苯丙氨酸的产率达到83%。同时在研究过程中发现Taxus chinensis和Pantone agglomerans来源的PAM催化合成不同立体构型的β-芳香丙氨酸,并深入研究了催化合成各种构型产物的产率及影响因素。本项目为解决制约PAM工业应用问题提供了借鉴,并为其它酶分子改造提供科学依据和方法学的参考。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Streptomyces maritimus苯丙氨酸变位酶的制备、表征及催化合成β-芳香丙氨酸
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016-12
  • 期刊:
    高等学校化学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朱龙宝;陶玉贵;葛飞;李婉珍;刘义;堵国成
  • 通讯作者:
    堵国成
成团泛菌苯丙氨酸氨基变位酶的性质表征及用于合成β-苯丙氨酸
  • DOI:
    10.13550/j.jxhg.20180834
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    精细化工
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朱龙宝;杨瑾;葛飞;陶玉贵;宋平
  • 通讯作者:
    宋平
Modulating the pH Activity Profiles of Phenylalanine Ammonia Lyase from Anabaena variabilis by Modification of Center-Near Surface Residues
通过修饰中心-近表面残基来调节多变鱼腥藻苯丙氨酸氨裂解酶的 pH 活性曲线。
  • DOI:
    10.1007/s12010-017-2458-8
  • 发表时间:
    2017-03
  • 期刊:
    Applied Biochemistry and Biotechnology
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Zhang Fan;Huang Nan;Zhou Li;Cui Wenjing;Liu Zhongmei;Zhu Longbao;Liu Yi;Zhou Zhemin
  • 通讯作者:
    Zhou Zhemin
One step synthesis of unnatural beta-arylalanines using mutant phenylalanine aminomutase from Taxus chinensis with high beta-regioselectivity
使用来自红豆杉的突变苯丙氨酸氨基变位酶一步合成非天然β-芳基丙氨酸,具有高β-区域选择性
  • DOI:
    10.1016/j.enzmictec.2018.03.006
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Enzyme and Microbial Technology
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Zhu Longbao;Ge Fei;Li Wanzhen;Song Ping;Tang Hongjin;Tao Yugui;Liu Yi;Du Guocheng
  • 通讯作者:
    Du Guocheng
One-Pot Enzymatic Synthesis of d-Arylalanines Using Phenylalanine Ammonia Lyase and l-Amino Acid Deaminase
使用苯丙氨酸氨裂解酶和 l-氨基酸脱氨酶一锅法酶法合成 d-芳基丙氨酸
  • DOI:
    10.1007/s12010-018-2794-3
  • 发表时间:
    2018-06
  • 期刊:
    Applied Biochemistry and Biotechnology
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Zhu Longbao;Feng Guoqiang;Ge Fei;Song Ping;Wang Taotao;Liu Yi;Tao Yugui;Zhou Zhemin
  • 通讯作者:
    Zhou Zhemin

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其他文献

苯丙氨酸变位酶的制备、性质表征及催化合成β-芳香丙氨酸
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    高等学校化学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朱龙宝;陶玉贵;葛飞;李婉珍;刘义;堵国成
  • 通讯作者:
    堵国成

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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