一种新型凝集素液相芯片系统的建立及其在肝癌血清肽组学糖谱中的应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21305018
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0404.化学与生物传感
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Glycomics is the study of comprehensive structural elucidation and characterization of all glycoforms found in nature and their dynamic spatiotemporal changes that are associated with biological processes. Relative to genomics and proteomics, glycomics is just growing out of infancy with great potential in biomedicine for biomarker discovery, diagnosis, and treatment. However, the immense diversity and complexity of glycan structures and their multiple modes of interactions with proteins pose great challenges for development of analytical tools for delineating structure function relationships and understanding glycocode. Several tools are being developed for glycan profiling based on chromatography and mass spectrometry, which was limited in high-throughput methodologies to study the structural and functional aspects of glycan structures. Lectins, which have long been used in glyco-immunology, printed on a microarray provide a versatile platform for rapid high throughput analysis of glycoforms of biological samples. A novel sensitivity lectin suspension microarray and a suspension array assay using dendrimer signal amplification allowed rapid, sensitivity, high-throughput are needed for glycan profiling analyses and clinical application. The peptidome and peptidomics as logical extension to proteome and proteomics were caught more attention by scientists and provided diagnostic and prognostic information on cancer and other diseases. However, few reports on glycan profiling of peptidome can be found although the awareness on the importance of the peptidome has greatly increased. Therefore, preparation of a novel sensitivity, high-throughput and fast lectin suspension microarray system was urgent need for overall and real-time glycan profiling analyses of sample. The serum peptidome glycan profiling of hepatocellular carcinoma will be established and have great potential in biomarker discovery, diagnosis, and prognostic evaluation.
继基因组学、蛋白质组学之后,糖组学在分子标志物发现、疾病诊断以及预后具有潜在的价值。面对多样和复杂的糖链结构研究,凝集素芯片作为糖的解码器成为一种高灵敏、高通量的糖链分析平台,可以快速筛查并区分糖蛋白质的糖谱,在糖组学的研究中具有广阔的生物学、临床应用价值。因而建立一种新型高密度凝集素液相芯片,有效降低固定探针微珠的团聚,并通过信号放大检测方式提高凝集素液相芯片的检测灵敏度,为糖谱研究及其在临床诊断等方面的应用奠定基础。作为蛋白质组学的重要分支,多肽组学在诸多生物过程中具有举足轻重的地位。但目前针对肽组学糖谱的研究却无人涉足,建立一种高灵敏、高通量、高速的凝集素芯片,对肝癌血清中内源性肽或低分子量蛋白质的糖谱进行总体、即时的观察,建立肽组学糖谱,为糖组学的研究提供一个新的分析方法,为肝癌的发生、诊断以及预后评估奠定基础。

结项摘要

本项目通过多聚赖氨酸有机长链分子辅助,将凝集素成功键合到荧光磁性微球上,成功建立了新型凝集素液相芯片。由于亲水性多直链辅助,降低了凝集素液相芯片微珠的团聚现象;同时,提高了凝集素的固载量,从而提高了凝集素液相芯片的灵敏度。我们首次将新型凝集素芯片用于糖肽糖基化修饰的定量分析,其中以标准糖蛋白的Lys酶切肽段为分析物,进行了糖肽糖基化芯片分析方法的建立和评价。该项目首次将新型凝集素芯片应用到肝内胆管细胞癌(ICC)血清糖肽谱建立,以含有24种特异性新型凝集素芯片为基础,检测到ICC血清中糖肽谱中识别Con A、EBL、PSA、s-WGA、WFL、PHA-E、DSL、RCA的糖肽有明显升高趋势,而识别UEA-Ⅰ的糖肽却又相反趋势,其余15种凝集素响应信号没有显著变化。我们对其中部分凝集素响应进行了Dot-blot验证。通过LC-MS进一步的对低分子量糖肽对应蛋白进行了鉴定。从而最终为ICC的临床诊断与发病机制提供了理论依据。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Recent advances in the fabrication and detection of lectin microarrays and their application in glycobiology analysis
凝集素微阵列的制备和检测及其在糖生物学分析中的应用的最新进展
  • DOI:
    10.1039/c3ay41974f
  • 发表时间:
    2014-01-01
  • 期刊:
    ANALYTICAL METHODS
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Li, Hong;Wei, Liming;Yang, Pengyuan
  • 通讯作者:
    Yang, Pengyuan

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其他文献

苦荞株型相关性状的遗传分析及其对产量的影响
  • DOI:
    10.13836/j.jjau.2020099
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    江西农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李春花;尹桂芳;黄金亮;王艳青;卢文洁;孙道旺;王春龙;郭来春;魏黎明;加央多拉;任长忠;王莉花
  • 通讯作者:
    王莉花
自交可育红花甜荞种质资源创新利用研究
  • DOI:
    10.3969/j.issn.2095-1191.2021.10.015
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    南方农业学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李春花;加央多拉;田娟;孙墨可;王春龙;董玉迪;郭来春;魏黎明;孙连池;任长忠
  • 通讯作者:
    任长忠
苦荞农艺性状遗传多样性分析及综合评价
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    作物研究
  • 影响因子:
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  • 作者:
    李春花;加央多拉;吴晗;孙墨可;田娟;王春龙;郭来春;魏黎明;贾云峰;任长忠
  • 通讯作者:
    任长忠
心源性卒中炎症相关生物标志物的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    医学研究杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    龙海宁;朱望舒;魏黎明;赵俊功
  • 通讯作者:
    赵俊功
甜荞品种(系)表型遗传多样性分析及综合评价
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    山东农业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李春花;加央多拉;吴晗;黄金亮;王春龙;郭来春;魏黎明;任长忠
  • 通讯作者:
    任长忠

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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