尿液微粒转录组学标志物在糖尿病肾病早期诊断中的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81900698
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    22.0万
  • 负责人：
    周乐汀
  • 依托单位：
    南京医科大学
  • 学科分类：
    H0511.泌尿系统疾病研究新技术与新方法
  • 结题年份：
    2022
  • 批准年份：
    2019
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Diabetic nephropathy(DN) is a main cause of end-stage kidney disease. Unfortunately, there is still a lack of early accurate diagnostic biomarkers. Our previous studies have shown that urinary microparticle（MP）RNA detection may provide a novel and effective method for early non-invasive diagnosis of DN. However, how to avoid the interference of transcripts from non-kidney sources remains a major problem. This project intends to establish a DN-specific transcriptomic profile using urinary kidney intrinsic cell specific RNA screening method based on our large sample-size (n=251) transcriptome database. Secondly, through three-stage screening studies, including cell model study, animal model study and the clinical cross-sectional study, we intend to select candidate biomarkers and analyze the their relationship with the main pathophysiological changes in DN. Finally,a combined biomarker will be established by machine learning method based on the selected molecules. This study will provide a novel theoretical and experimental basis for clinical application of urinary MP RNA in assisting the diagnosis of DN.
糖尿病肾病（DN）是终末期肾脏病的主要病因之一，尚缺乏早期精准诊断生物标志物。我们前期研究表明，尿液微粒mRNA检测可能为DN早期无创诊断提供新颖有效的手段。然而如何避免尿液非肾脏来源转录本干扰，发现DN特征性尿液微粒转录组学标志物是亟待解决的关键问题。本项目拟基于课题组前期构建的大样本（n=251）肾脏病理转录组学数据集，运用尿液肾脏固有细胞特异性mRNA筛选方法，构建DN特征性转录组学表达谱。继而通过细胞实验、模式动物和临床样本等三阶段筛选研究，系统探讨DN尿液微粒转录组学的时空变化规律及其与DN主要病理生理变化的关联，鉴定具有临床应用潜力的生物标志物。最后，运用机器学习方法建立联合生物标志物，评估其在DN早期诊断中的价值，从而为临床应用尿液MP mRNA辅助诊断DN提供新颖的理论和实验依据。

结项摘要

糖尿病肾病（DN）是终末期肾脏病的主要病因之一，尚缺乏早期精准诊断生物标志物。我们前期研究表明，尿液微粒（MP） mRNA检测可能为DN早期无创诊断提供新颖有效的手段。本项目基于大样本高通量数据，利用生物信息学方法描绘出DN特异性转录组学表达谱，进而通过体内外试验初步验证其作为DN早期生物标志物的潜在价值，最后在临床研究中进行验证。主要成果包括：.（1）.本项目开展了大样本CKD肾活检组织转录组芯片数据的生物信息学分析，鉴定出DN特征性表达谱， 通过功能注释、通路富集分析、蛋白质互作网络和核心基因筛选等方法，探讨了DN特有的发病机制。.（2）.通过比较转录组学方法，系统研究了人类与DN动物模型转录组的异同。为后续临床特异性分子筛选提供更为特异的数据库来源。.（3）.研究了DN铁死亡与免疫微环境（IME）的相关性，发现铁死亡可能由IME失调引起，并加速了DN进展。以为探索潜在分子机制提供新线索。.（4）.通过生物信息学、体内外试验等进一步鉴定了CCL19等基因可能是DN的新型生物标志物。.（5）.结合前述筛选结果，在包含160例受试者的队列中测定候选尿液MP mRNA表达水平。结果发现，尿液MP CCL19 mRNA、ALOX5及纤维化相关mRNA（VIM、LMNA）在DN患者中显著升高，可作为DN的潜在生物标志物。

项目成果

期刊论文数量（6）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（1）
专利数量（0）
The Correlation between Ferroptosis and m6A Methylation in Patients with Acute Kidney Injury
急性肾损伤患者铁死亡与m6A甲基化的相关性
  • DOI：
    10.1159/000524900
  • 发表时间：
    2022-08-01
  • 期刊：
    KIDNEY & BLOOD PRESSURE RESEARCH
  • 影响因子：
    2.8
  • 作者：
    Ni, Lihua;Bai, Rui;Wu, Xiaoyan
  • 通讯作者：
    Wu, Xiaoyan
IL-10基因-819T/C多态性与糖尿病肾病易感性的Meta 分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
    医学信息
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    胡玲;王思思;周乐汀;孙铸兴
  • 通讯作者：
    孙铸兴
Expression of Ferroptosis-Related Genes is Correlated with Immune Microenvironment in Diabetic Kidney Disease.
糖尿病肾病铁死亡相关基因表达与免疫微环境相关
  • DOI：
    10.2147/dmso.s388724
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
    Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
PLA2R-IgG4 antibody as a predictive biomarker of treatment effectiveness and prognostic evaluation in patients with idiopathic membranous nephropathy: a retrospective study.
PLA2R-IgG4 抗体作为特发性膜性肾病患者治疗效果和预后评估的预测生物标志物：一项回顾性研究
  • DOI：
    10.7717/peerj.14193
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
    PeerJ
  • 影响因子：
    2.7
  • 作者：
    Huang Y;Zhou J;Zhou K;Huang B;Xue J;Zhang X;Liu B;Zhang Z;Zhou L;Cai T;Zhang Y;Hu Z;Wang L;Liu X
  • 通讯作者：
    Liu X
Identification of CCL19 as a Novel Immune-Related Biomarker in Diabetic Nephropathy.
鉴定 CCL19 作为糖尿病肾病的新型免疫相关生物标志物
  • DOI：
    10.3389/fgene.2022.830437
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
    Frontiers in genetics
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Chen H;Zhang Z;Zhou L;Cai T;Liu B;Wang L;Yang J
  • 通讯作者：
    Yang J

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其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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