抗癌海绵天然产物fascaplysin新衍生物的靶向设计、合成和生物活性评价

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    20903058
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    19.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0302.化学模拟与应用
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

Fascaplysin是具有抗肿瘤活性的海绵天然产物,是周期蛋白依赖性激酶 4(cyclin-dependent kinase 4, CDK4)的抑制剂。体外实验研究表明平面结构的fascaplysin与DNA有嵌合作用,但开环的结构改造降低了抑制活性和选择性,相关体内抗肿瘤实验未发现fascaplysin的毒副作用。申请项目拟对fascaplysin保留母环结构,通过在合适位置增加取代基的方式进行结构修饰和优化,综合采用计算机辅助药物设计、有机合成以及生物活性评价等方法和技术,以期得到高活性、高选择性、低毒副作用的新颖CDK4抑制剂,这将为CDK4以及其它类CDK高效抑制剂的研发提供重要理论指导。

结项摘要

项目采用MOE软件对已有的CDK4晶体结构缺失的片段补全,用Gold5.0软件对接得到fascaplysin/CDK4和15b/CDK4复合物结构,结合模式研究显示这两个抑制剂与CDK4的铰链区都形成了两个氢键,fascaplysin的高抑制选择性在于存在正电荷N原子,15b化合物的高抑制选择性在于亚氨基上连接了大体积的刚性基团;我们通过对一系列高活性和高选择性的CDK4抑制剂采用比较分子场分析CoMFA方法建立三维定量构效关系(3D-QSAR)和三维定量构择关系(3D-QSSR)模型,统计结果显示q2为0.776和0.795,r2为0.972和0.942,r2pred为0.603和0.562,CoMFA的等值线图和CDK4的活性口袋的化学性质有助于合理设计fascaplysin的衍生物;我们顺利打通了fascaplysin天然产物的合成和fascaplysin衍生物的合成路线,得到多个fascaplysin的衍生物,并对它们进行药理研究,合成的facaplysin衍生物均有细胞毒性,其中1-(2-溴苯甲酰基)-6-(N-甲基-邻苯二甲酰亚胺基)-β-咔啉内盐的活性好,表现出抑制人脐静脉内皮细胞生长,引起细胞凋亡,该衍生物对诱导细胞早期凋亡的程度随实验加入剂量的增加而明显的加强。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Influences of phosphorylation on Thr14/Tyr15 in CDK5 in the presence of roscovitine/ATP and HHASPRK
roscovitine/ATP 和 HHASPRK 存在下磷酸化对 CDK5 中 Thr14/Tyr15 的影响
  • DOI:
    10.1080/08927022.2011.616503
  • 发表时间:
    2012-01
  • 期刊:
    Molecular Simulation
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Jin, Hai-Xiao1;Zhang, Bing2, 3;Jun, Yan-Xiao1;Xu, Jin-Liang2;Tan, Vincent B.C.3
  • 通讯作者:
    Tan, Vincent B.C.3
Fascaplysin exert anti-tumor effects through apoptotic and anti-angiogenesis pathways in sarcoma mice model
Fascaplysin 通过细胞凋亡和抗血管生成途径在肉瘤小鼠模型中发挥抗肿瘤作用
  • DOI:
    10.1016/j.ejps.2011.04.018
  • 发表时间:
    2011-07-17
  • 期刊:
    EUROPEAN JOURNAL OF PHARMACEUTICAL SCIENCES
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Yan, Xiaojun;Chen, Haimin;Zhu, Peng
  • 通讯作者:
    Zhu, Peng
advances in marine polyphenol analysis
海洋多酚分析的进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Current Analytical Chemistry
  • 影响因子:
    1.8
  • 作者:
    何山;王婷婷;杨锐;顾斌斌;朱鹏;许亚如;金海晓;严小军
  • 通讯作者:
    严小军
海洋活性生物碱fascaplysin对肝癌细胞BeL-7402代谢物的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国药学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郑燕玲;严小军;徐继林;金海晓;陈娟娟;ZHENG Yan-ling1,3,YAN Xiao-jun2,XU Ji-lin2,JIN Hai;2.Key Laboratory of Marine Biotechnology,Ningbo Un;3.Graduate University of the Chinese Academy of Sc
  • 通讯作者:
    3.Graduate University of the Chinese Academy of Sc
PKA酶及其抑制剂balanol的计算化学
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    化学进展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    金海晓;严小军;朱鹏;Jin Haixiao Yan Xiaojun Zhu Peng (Key Laboratory o
  • 通讯作者:
    Jin Haixiao Yan Xiaojun Zhu Peng (Key Laboratory o

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其他文献

微小卡罗藻(Karlodinium micrum)共附生微生物抗菌与细胞毒活性
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    微生物学报
  • 影响因子:
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  • 作者:
    朱鹏;游玉容;褚椒江;金海晓;严小军;Peng Zhu1,2,Yurong You1,2,Jiaojiang Chu1,2,Haixiao
  • 通讯作者:
    Peng Zhu1,2,Yurong You1,2,Jiaojiang Chu1,2,Haixiao
海洋细菌Pseudoalteromonas sp.NJ631中NRPS基因簇及核心模件的发掘
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    微生物学报
  • 影响因子:
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  • 作者:
    陈威;朱鹏;何山;金海晓;严小军;Wei Chen,Peng Zhu,Shan He,Haixiao Jin,Xiaojun Yan
  • 通讯作者:
    Wei Chen,Peng Zhu,Shan He,Haixiao Jin,Xiaojun Yan

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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