一个含NB-ARC结构域的水稻抗稻瘟病新基因Pitb的克隆及分子机制研究

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基本信息

  • 批准号:
    31660382
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    39.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Rice blast is one of the most widely distributed and most severe rice disease worldwide. Practice has proved that the discovery of broad-spectrum resistant genes, and the development of broad-spectrum resistant varieties by pyramiding multiple resistant genes through the method of marker-assisted selection is the most effective strategies to control rice blast. Our research group identified a new containing NB-ARC domain dominant major locus rice blast resistance gene Pitb in previous study, So far no containing NB-ARC domain in the research of rice blast resistance gene has been reported. This project attempt to verify its biological function and complete clone via functional complementation experiments, then elucidate molecular mechanism of rice blast resistance via analysis of gene expression patterns, subcellular localization, pathway and protein interaction network. Finally, according to the characteristics of resistance/sensitive gene, develop efficient molecular markers for blast resistance breeding of rice. This study is not only benefit for elucidating the molecular basis of rice against blast infection, but also having important theoretical and practical significance in effectively carrying out the marker assisted selection breeding to resistant varieties in rice.
稻瘟病是分布最广、危害最严重的世界性稻作病害之一。实践证明,发掘广谱抗病基因,利用分子标记辅助选择聚合抗性基因,培育广谱抗性品种,是控制稻瘟病最环保有效的方法。课题组前期通过图位克隆的方法定位到了一个含NB-ARC结构域的显性主效水稻抗稻瘟病新基因Pitb,目前在水稻抗稻瘟病基因的研究中还未见含NB-ARC结构域基因的报道。本项目拟进一步通过功能互补实验,验证其生物功能,完成克隆,并通过剖析基因的表达模式、亚细胞定位、作用通路及蛋白质互作网络,阐明其抗稻瘟病的分子机制,最后根据该基因的抗感差异,开发高效的分子标记,为开展水稻抗稻瘟病育种提供技术储备。本项目的实施在揭示水稻抗稻瘟病的分子机制及有效地开展水稻抗稻瘟病分子标记辅助选择育种等方面具有重要的理论和实践意义。

结项摘要

稻瘟病是分布最广、危害最严重的世界性稻作病害,目前,发掘和利用广谱抗源,通过广谱抗性基因的聚合来培育广谱抗性品种,一直被认为是控制稻瘟病的最有效方法。本研究利用图位克隆的方法挖掘到一个含NB-ARC结构域的水稻抗稻瘟病新基因Pitb,功能分析表明,Pitb基因的表达与稻瘟病的抗性显著相关,蛋白的表达产物分布在细胞质中,蛋白能够与一个线粒体外模孔蛋白结合,而对应的感病基因表达蛋白却不能,因此推测Pitb的抗病机理很有可能是因为能够有效的与该线粒体外模孔蛋白结合,从而运输能量和物质,达到抗病的目的。进一步根据抗感基因差异开发了可应用于辅助选择育种的分子标记,并筛选到了抗性小于1级的水稻品系“井263”。该研究丰富了稻瘟病抗病基因的储备,为有效地开展水稻抗病分子标记辅助选择育种的重要前提和基础。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
水稻遗传多样性及其农艺性状与SSR标记的关联分析
  • DOI:
    10.3969/j.issn.0490-6756.2019.05.029
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    四川大学学报. 自然科学版
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王复标;石军;郑卓;司二杰;黄廷友;孙惠敏
  • 通讯作者:
    孙惠敏
水稻早熟大穗品系7-37二次枝梗数的QTL定位研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    井冈山大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郑 卓;江振方;王复标;孙惠敏
  • 通讯作者:
    孙惠敏
Genetic analysis and gene mapping of a low stigma exposed mutant gene by high-throughput sequencing.
通过高通量测序对低耻辱暴露突变基因进行遗传分析和基因定位
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0186942
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Ma X;Zheng Z;Lin F;Ge T;Sun H
  • 通讯作者:
    Sun H
Characterization of a leaf silicon defective mutant lsdm conferring blast susceptibility in rice
赋予水稻稻瘟病易感性的叶硅缺陷突变体 lsdm 的表征
  • DOI:
    10.1080/07060661.2016.1231136
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Canadian Journal of Plant Pathology
  • 影响因子:
    2
  • 作者:
    Chen Yajie;Li Baotong;Huang Zhilong;Zheng Shuwen;Zheng Zhuo;Sun Huimin;Sun HM
  • 通讯作者:
    Sun HM
Genome-Wide Analysis of a Radiation-Induced Lesion Mimic Mutant in Rice
水稻辐射诱导病变模拟突变体的全基因组分析
  • DOI:
    10.4238/gmr16039812
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Genetics and Molecular Research
  • 影响因子:
    0.4
  • 作者:
    Zhuo Zhenga;Mingcheng Guoab;Lihua Wua;Huimin Suna
  • 通讯作者:
    Huimin Suna

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其他文献

人骨髓干细胞分离及其向神经细胞诱导分化的实验研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    宁夏医科大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙惠敏;刘婷;马丽君;朱永朝;何亚琴;王立斌
  • 通讯作者:
    王立斌
大穗型水稻品种7-37的光合特性及子粒灌浆特性研究
  • DOI:
    10.16035/j.issn.1001-7283.2016.05.007
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    作物杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙惠敏;郑树文;郑伟;王安萍;冯关萍;段世华;郑卓
  • 通讯作者:
    郑卓
Preparation and Characterization Studies on Porous Flower-Like Fe(3)O(4) Nanospheres
多孔花状Fe(3)O(4)纳米球的制备及表征研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    CHINESE JOURNAL OF INORGANIC CHEMISTRY
  • 影响因子:
    0.7
  • 作者:
    伊希斌;沈晓冬;崔升;孙惠敏;李永梅
  • 通讯作者:
    李永梅
基于InDel分子标记的20个水稻品种的籼粳属性分析
  • DOI:
    10.3969/j.issn.1674-8085.2016.06.021
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    井冈山大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙惠敏;夏米;陈清玲;司二杰;张凯歌;郑卓
  • 通讯作者:
    郑卓
3种细胞因子对整合素αvβ6表达的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    医学研究生学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    邬姝阳;李萍;曾新;孙惠敏;马致南;童华
  • 通讯作者:
    童华

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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