CsERF004调控黄瓜双抗性分子机制的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31801871
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    27.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1506.蔬菜与瓜果生长发育
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

We screened out the cucumber resistance-related gene CsERF004, a gene encoding ERF transcription factor,using transcriptome sequencing under Corynespora cassiicola and Pseudoperonospora cubensis stress. Over-expression of CsERF004 could enhance the resistance of cucumber to downy mildew and target spot. In order to investigate the regulatory mechanism of CsERF004 in cucumber double-disease resistance, we will analyze the downstream regulatory genes of CsERF004 in this study. Transgenic plants and wild-type plants will be sequenced to analyze the gene expression changes at transcriptome level. Chromatin immunoprecipitation sequencing would be used to study the DNA binding target of CsERF004. Combining with the changes of the microscopic phenotype of the transgenic plants,the key target genes will be screened out in the consistent results of RNA-seq and ChIP-seq. The function of the target genes would be used to verify by the qPCR and gene silencing techniques. The analysis of the transcriptional regulatory network of CsERF004 can lay the foundation for further study on molecular mechanism of double diseases resistance in cucumber, so as to provide a theoretical basis for multi-resistant cucumber varieties.
本课题组通过对霜霉病菌和棒孢叶斑病菌胁迫下的黄瓜叶片进行转录组测序,已筛选获得编码ERF转录因子的基因CsERF004,并明确了过表达CsERF004能够提高黄瓜对霜霉病及棒孢叶斑病的抗性。为了探明CsERF004在黄瓜双抗性中的调控机制,本研究将进行CsERF004下游调控基因的分析。通过对转基因植株和野生型进行转录组测序,分析在转录组水平的基因表达变化;利用染色质免疫共沉淀测序技术研究CsERF004的DNA结合靶标。将RNA-seq和ChIP-seq结果重叠并结合转基因植株的显微水平表型的变化筛选关键靶基因。利用qPCR及基因沉默等技术对筛选到的靶基因进行功能验证。综合分析CsERF004的调控网络,为深入研究黄瓜双抗性分子机制奠定基础,进而为培育黄瓜多抗性品种提供理论依据。

结项摘要

目前,黄瓜霜霉病和棒孢叶斑病是黄瓜生产上的重要病害。病害传播流行速度快,对黄瓜生产威胁极大。单一抗病品种已无法满足生产需求,多抗性品种又极为缺乏,因此培育多抗性品种尤为重要。前期基础中已经通过对霜霉病菌和棒孢叶斑病菌胁迫下的黄瓜叶片进行转录组测序,已筛选获得编码ERF转录因子的基因CsERF004,并明确了过表达CsERF004能够提高黄瓜对霜霉病及棒孢叶斑病的抗性。本项目通过转录组测序和酵母双杂交文库互作蛋白筛选挖掘CsERF004潜在下游基因,同时对潜在上游基因进行了功能验证,初步探索了CsERF004在黄瓜双抗性中的调控网络,研究结果将为解析黄瓜双抗性分子机制奠定基础,同时也将加快黄瓜分子育种的脚步。.主要结果如下:.(1)成功克隆了CsSTK。通过PEG介导的拟南芥原生质体瞬时表达和农杆菌介导的烟草瞬时表达,亚细胞定位结果表明CsSTK定位在细胞膜上。成功获得过表达CsSTK转基因植株。表型接种鉴定表明过表达CsSTK转基因植株能够增强黄瓜对棒孢叶斑病和霜霉病的抗性。过表达CsSTK后会使CsERF004显著上调表达,酵母双杂交验证显示CsSTK与CsERF004存在互作,推测CsSTK可能是CsERF004的上游基因。.(2)通过转录组技术对转基因CsERF004植株、野生型植株及病原菌胁迫的转基因CsERF004植株进行转录组测序,筛选到31个与抗病相关的基因。.(3)为了进一步筛选下游调控基因,构建了病原菌胁迫下黄瓜酵母双杂交cDNA文库并进行了互作蛋白的筛选。筛选到潜在下游基因3个,7号、8号和25号。CsERF004与潜在下游基因一对一酵母双杂交验证,结果发现7号、8号、25号与CsERF004均存在互作。.(4)25号蛋白为几丁质酶,属于GH18家族蛋白。表达模式分析表明,CsGH18积极响应黄瓜棒孢叶斑病菌和霜霉病菌的胁迫。转基因CsERF004植株中CsGH18显著上调表达。转基因CsSTK植株中CsERF004和CsGH18均显著上调表达。同时CsSTK、CsGH18与CsERF004酵母双杂交结果显示均与CsERF004互作。初步推测在黄瓜抗病机制中CsERF004可能调控CsGH18增强黄瓜抗病性。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
黑龙江省黄瓜棒孢叶斑病分布及 病菌生物学特性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    北方园艺
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张笛;刘齐月;刘东;陶磊;王春龙;张艳菊
  • 通讯作者:
    张艳菊
黑龙江省黄瓜主栽品种及种质资源对霜霉菌 不同致病型抗病性鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    东北农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张艳菊;陶磊;刘东;周秀艳;李雪莲;马天;潘梦佳
  • 通讯作者:
    潘梦佳
Transcriptome analysis of mechanisms and candidate genes associated with cucumber response to cucumber alternaria leaf spot infection
黄瓜对黄瓜链格孢叶斑病感染反应相关机制和候选基因的转录组分析
  • DOI:
    10.1016/j.pmpp.2020.101490
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Physiological and Molecular Plant Pathology
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Sa Rina;Liu Dong;Chen Lixin;Liu Linshuai;Zhang Yanju;Zhang Xingzhe;Xu Chunmei
  • 通讯作者:
    Xu Chunmei
黄瓜棒孢叶斑病菌实时荧光定量PCR方法的建立与应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    东北农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张艳菊;刘齐月;张笛;陶磊;王春龙;刘行风;李雪莲;马天;刘东
  • 通讯作者:
    刘东
ESTABLISHMENT OF REAL-TIME PCR FOR QUANTITATIVELY MONITORING PSEUDOPERONOSPORA CUBENSIS IN CUCUMBER (CUCUMIS SATIVUS)
黄瓜拟霜霉病定量监测实时PCR方法的建立
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Pakistan Journal of Botany
  • 影响因子:
    1.2
  • 作者:
    Dong Liu;Chunqing Pan;Lei Tao;Di Zhang;Chunlong Wang;Ziwei He;Yanju Zhang
  • 通讯作者:
    Yanju Zhang

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    刘倩霞

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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