与包涵体形成相关的GCRV非结构蛋白NS80的功能域研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31072233
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    36.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1907.水产生物免疫学
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

在呼肠孤病毒侵染宿主细胞的过程中,通常在细胞质内形成一种致密的病毒包涵体结构,病毒基因组转录复制及子代病毒的包装在其内进行。基于GCRV基因组同源序列分析,推测其非结构蛋白NS80与该包涵体结构的形成密切相关。为探讨GCRV非结构蛋白 NS80在病毒复制中形成包涵体的分子机理,本项目拟构建NS80全长表达、N端与C缺失表达、GFP融合表达及另一种非结构蛋白NS38表达载体,将其构建体分别或共转染哺乳动物细胞,获得重组蛋白的瞬时表达。采用免疫印迹、免疫荧光或免疫共沉淀等技术,分析NS80及其截短蛋白在转染细胞中的表达及包涵体形成状况。此外,通过分析NS38的单独表达以及NS38/NS80蛋白的共表达,了解在包涵体形成中NS80与NS38的关联性,由此定位与包涵体形成相关的NS80功能结构域。该研究将为揭示NS80在病毒复制中的包涵体形成与包装过程中与其它蛋白的相互作用机制提供依据。

结项摘要

呼肠孤病毒科成员具有在病毒感染细胞中形成典型的病毒加工厂(或称为包涵体)样的特化结构。序列同源性分析表明,草鱼呼肠孤病毒 (Grass Carp Reovirus,GCRV) 非结构蛋白NS80与包涵体结构形成相关。本研究在对包涵体形成的相关蛋白NS80特性研究基础上,利用免疫荧光方法,在病毒感染的不同时间观察细胞内包涵体的形态变化,发现在病毒感染细胞后,随着时间的推移,病毒包涵体不断变大,并有向核周移动的趋势。此外,转染实验表明,单独表达的NS80蛋白就可以在转染细胞中形成与病毒感染细胞中类似的包涵体结构,而单独表达的非结构蛋白NS38或结构蛋白VP4都不能形成包涵体结构。共转染和免疫共沉淀实验发现NS80可以招募NS38和VP4至包涵体结构中。为了研究包涵体的形成与细胞骨架微管蛋白之间的关系,使用微管抑制剂Nocodazole处理细胞,使微管解聚,结果发现无论是在病毒感染还是NS80转染的细胞中,包涵体的形态和分布都不受影响,表明包涵体的形成不依赖于细胞的微管骨架系统。为了进一步精确定位NS80与包涵体形成相关的结构域,构建了一系列NS80C及N末端缺失体及进行了转染实验,结果发现,NS80C端4个氨基酸的缺失及突变Coiled-coil结构就会导致包涵体形成能力的丧失;并确定了530-742氨基酸区域为包涵体形成的最小区域。值得指出的是,随着N端的缺失,在NS80 471 to 513-742区域可形成核包涵体,并检测到核包涵体与细胞蛋白β-catenin共定位。结果表明,Aquareovirus NS80具有形成包涵体功能,并能招募结构蛋白VP4及非结构蛋白NS38到其包涵体结构中,其NS80 coiled-coil结构区域及C末端结构对病毒包涵体的形成至关重要。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Aquareovirus protein VP6 colocalizes with NS80 protein in infected and transfected cells.
水瓶病毒蛋白 VP6 与感​​染和转染细胞中的 NS80 蛋白共定位
  • DOI:
    10.1186/1743-422x-10-133
  • 发表时间:
    2013-04-27
  • 期刊:
    Virology journal
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Wen D;Yan L;Shao L;Guo H;Li X;Fang Q
  • 通讯作者:
    Fang Q
Antibodies against outer-capsid proteins of grass carp reovirus expressed in E. coli are capable of neutralizing viral infectivity.
针对大肠杆菌中表达的草鱼呼肠孤病毒外衣壳蛋白的抗体能够中和病毒感染性
  • DOI:
    10.1186/1743-422x-8-347
  • 发表时间:
    2011-07-12
  • 期刊:
    Virology journal
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Shao L;Sun X;Fang Q
  • 通讯作者:
    Fang Q
Aquareovirus NS80 recruits viral proteins to its inclusions, and its C-terminal domain is the primary driving force for viral inclusion formation.
Aquareovirus NS80 将病毒蛋白招募到其包涵体中,其 C 端结构域是病毒包涵体形成的主要驱动力
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0055334
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Shao L;Guo H;Yan LM;Liu H;Fang Q
  • 通讯作者:
    Fang Q
Characterization of grass carp reovirus minor core protein VP4.
草鱼呼肠孤病毒小核心蛋白VP4的表征
  • DOI:
    10.1186/1743-422x-9-89
  • 发表时间:
    2012-07-05
  • 期刊:
    Virology journal
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Yan L;Guo H;Sun X;Shao L;Fang Q
  • 通讯作者:
    Fang Q
利用抗草鱼IgM的单链抗体分析草鱼呼肠孤病毒的免疫原性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    中国科学:生命科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    汪亚平;郭琼林;方勤;戴和平
  • 通讯作者:
    戴和平

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    谢利红
Building and Refining Protein Models within Cryo-electron Microscopy Density Maps Based on Homology Modeling and Multi-scale Structure Refinement
基于同源建模和多尺度结构细化在冷冻电子显微镜密度图中构建和细化蛋白质模型
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Journal of Molecular Biology
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    方勤
  • 通讯作者:
    方勤

其他文献

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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